Al finalizar el curso, el participante será capaz de:

• Comprender los conceptos fundamentales del flujo de trabajo en visión por computadora aplicado a datos ecológicos (imágenes y video).

• Implementar técnicas de preprocesamiento y aumento de datos para adaptar conjuntos de datos biológicos (fuera de contexto, desbalanceados, con ruido).

• Aplicar modelos de detección de objetos (YOLO, Faster R-CNN) para localizar y contar individuos en imágenes y video.

• Utilizar modelos de clasificación de imágenes y segmentación semántica para la identificación automática de especies.

• Implementar técnicas de seguimiento de múltiples objetos (MOT) para analizar trayectorias y comportamientos individuales en video.

• Extraer métricas cuantitativas de comportamiento (distancias, interacciones, patrones de movimiento) a partir de los datos procesados.

Sesiones Teóricas: Exposiciones conceptuales sobre algoritmos, arquitecturas y buenas prácticas.

Sesiones Prácticas (Laboratorio):

• Uso de entornos locales con Jupyter Notebooks.

• Implementación de código en Python utilizando librerías como OpenCV, TensorFlow/PyTorch

• Análisis de conjuntos de datos públicos (ej: Snapshot Serengeti, iNaturalist, Arctic Animal Dataset).

• Conocimientos de Programación: Competencia básica en manejo de librerías, estructuras de datos, funciones.

• Conocimientos de Ciencia de Datos: Familiaridad con conceptos de manipulación de datos y experiencia introductoria en aprendizaje automático (ML) es una gran ventaja.

• Conocimiento del sistema de archivos de la computadora
• Descarga e instalación de aplicaciones a través de línea de comandos

Entrega de cuadernos de laboratorio con ejercicios completados (40%).

Presentación final de un proyecto aplicado a un caso de estudio (60%).

Módulo 1: Introducción al Ecosistema de la Visión por Computadora en Ecología

• Panorama histórico y estado del arte.

• Casos de éxito: monitoreo de cámaras trampa, censos aéreos/drones, análisis de video en laboratorio y campo.

• Ética y buenas prácticas: impacto en los animales, sesgo en los datos, uso responsable de la IA.

Módulo 2: Fundamentos de Procesamiento de Imágenes con OpenCV

• Lectura, escritura y transformaciones básicas de imágenes/video.

• Espacios de color, filtros (suavizado, detección de bordes).

• Segmentación tradicional: thresholding, detección de contornos.

• Extracción de características (SIFT, ORB).

Módulo 3: Curso Acelerado de Deep Learning para Visión

• Redes Neuronales Convolucionales (CNN): conceptos fundamentales.

• Entrenamiento, validación y prueba. Transfer learning.

• Frameworks: introducción a TensorFlow/Keras o PyTorch.

Módulo 4: Clasificación y Detección de Especies

• Clasificación de imágenes: entrenamiento de un modelo para identificar especies.

• Detección de objetos: Fundamentos de YOLO y Faster R-CNN.

• Aplicación: Conteo automático de individuos en cámaras trampa.

Módulo 5: Proyecto Integrador y Temas Avanzados

• Diseño de un pipeline completo para un problema específico.

• Trabajo con datos reales: limpieza, anotación (uso de Roboflow, CVAT) y entrenamiento.

• Despliegue de modelos

Que el alumno: 1) Reconozca la importancia de la biodiversidad y de las interacciones biológicas en la conservación de los recursos naturales y como soporte para el bienestar humano. 2) Comprenda la dinámica de las respuestas de los socio-ecosistemas frente a distintos tipos de disturbios, usando diferentes estudios de caso como modelo. 3) Entienda el concepto de Agroecología, contextualizando su importancia en el desarrollo de una agricultura regenerativa. 4) Analice diferentes aproximaciones sobre manejo de los ecosistemas naturales y de origen antrópico. 5) Comprenda el concepto y marco teórico de los servicios ecosistémicos, identificando los diferentes tipos de servicios y las escalas espacio-temporales para su análisis y medición. 5) Entienda qué tipos de prácticas e intervenciones son más adecuadas para generar un compromiso sólido entre los objetivos de productividad y de utilización racional de los recursos naturales y locales,6con base a la experiencia de expertos en el tema

Las sesiones serán híbridas y consistirán en la presentación de las bases teóricas por parte de los coordinadores del curso y de los profesores invitados. Estas bases permitirán comprender mejor los estudios de caso que contrastarán distintas experiencias y perspectivas. Las lecturas, las discusiones y las presentaciones en pdf serán un apoyo importante, así como las herramientas adicionales que los profesores usen para hacer el curso virtual más accesible y dinámico. Se realizarán dos prácticas de campo. Las prácticas serán presenciales de manera obligatoria, ya que partimos de los siguientes principios: si me dices, olvido, si me enseñas recuerdo, y si me involucras, aprendo. Se sugiere asistir presencialmente a las sesiones debido a la dinámica de las clases y a la interacción y discusiones con los invitados.

Interés por estudios multidisciplinarios. Es deseable que participen estudiantes de todas las fortalezas. 

Redacción de textos y capacidad de síntesis para formular reportes de lectura de artículos y ensayos. 

Se considerará la asistencia a clase (5%). En los diferentes módulos se compartirán con los alumnos lecturas que deberán ser analizadas mediante un reporte. Los reportes de lectura deberán ser una revisión crítica de los aspectos que contengan los artículos, no una repetición de los mismos o una opinión sin argumentos (20%). En cuanto al ensayo, cada participante debe elegir un tema de los tratados en el programa y relacionarlo con su proyecto de tesis (30%). El 30% corresponderá a la asistencia y reporte de prácticas de campo. El 15% restante corresponderá a las evaluaciones de ejercicios/reflexiones

Módulo 1. Biodiversidad. Estado y tendencias. Biodiversidad y funciones del Ecosistema. Diversidad funcional: su importancia en ambientes de pastoreo. Biodiversidad, interacciones y funciones. Conceptos básicos y definiciones. Ecosistema, sistemas socioecológicos. Resiliencia. Origen del concepto y definiciones. Medición de la resiliencia en agroecosistemas y sistemas socioecológicos. Valores umbrales y ciclo adaptativo El Concepto de disturbio, sus componentes y su análisis. El manejo agropecuario como un disturbio de origen humano. Beneficios y consecuencias. El efecto de los disturbios de origen natural y antropogénico en la salud de los insectos. Estudio de caso 01. Disturbio ambiental y su efecto en la condición fisiológica de escarabajos del estiércol.

Módulo 2. Tema especial. Hablando sobre Ganadería. Agroecología. Ganadería multifuncional. Significado y evidencias. Sistemas agroforestales pecuarios en México: su concepto e importancia. Ecología del pastoreo. Interacciones planta animal. Las plantas en los pastizales. ¿Qué es forraje y cuáles son sus componentes? Características físicas y químico-nutricionales de las plantas forrajeras. Funciones biológicas de los nutrientes y compuestos secundarios de las plantas. Respuesta morfológica y fisiológica de las plantas al pastoreo. Variación espacio-temporal en el valor nutritivo y defensa de las plantas. El suelo y los agroecosistemas. Estudio de caso 02. ¿Cómo pueden los sistemas ganaderos tropicales contribuir a la conservación del suelo y la mitigación del cambio climático desde un enfoque interdisciplinario? Búfalos de agua y vacas, Estudio de caso 03. Efecto de las prácticas agropecuarias sobre los organismos no blanco. Efecto de los medicamentos veterinarios y de los pesticidas sobre la fauna del suelo, en el ecosistema pastizal. Efecto del uso de agroquímicos en la fauna de Veracruz Central. Estudio de caso 04. Ecología y garrapatas. Una visión del problema. Estudio de caso 05. Práctica de campo 01 Juchique de Ferrer. Proyecto estrategias de pastoreo y GEI. Estudio de caso 06. Maximizando el manejo de la Biodiversidad en el rediseño de unidades de producción Agropecuaria (ACB). Estudio de caso 07. Restauración Ecológica.  El elemento humano. Redes de valor, planes de negocio e innovaciones en ganadería sustentable. Estudio de Caso 08.  Visión de género en manejo ganadero. Estudio de caso 09. Mujeres emprendedoras en la ganadería. Estudio de caso 10. Rancho El Roble. Proyecto Manejo de Cerdos: una mirada agroecológica. Sistemas agroforestales implementación y problemática. Ganadería sustentable o sostenible ¿utopía o realidad. La ganadería regenerativa en Veracruz. Una visión desde INIFAP. Práctica de campo 02. Rancho Chula Vista. Yecuatla, Veracruz. Módulo 3. Servicios Ecosistémicos y Desarrollo Sustentable. El suelo, su biodiversidad y sus servicios ecosistémicos. Estudio de caso 11. Marcos conceptuales en el contexto de los servicios ecosistémicos. La dimensión humana: bienestar y calidad de vida y su relación con los servicios ecosistémicos. Introducción a los servicios ecosistémicos, tipos de servicios, importancia y procesos asociados. Práctica de campo 02. La Joya. Almacenes y flujos de carbono en ecosistemas desérticos. Estudio de caso 12. Valoración de SE. Diferentes tipos de valoración. Valoración de servicios ecosistémicos. Estudio de caso 13. Servicios ecosistémicos. Estudio de caso 14.  Reserva de la Biósfera SLP. Servicios ecosistémicos: cambio climático, humedales y sociedad. Estudio de caso 15. Respuestas o intervenciones. Conceptos básicos. Motores de cambio. Indicadores. Factores socioeconómicos y culturales que subyacen al uso y manejo de servicios ambientales. El manejo de cuencas y la conectividad en relación con agroecosistemas. Monitoreo comunitario del agua. Interacciones y sinergias entre servicios ecosistémicos. El concepto de sustentabilidad y su relación con el manejo y los servicios ecosistémicos. Integralidad GAMMA.

Desarrollar habilidades para la formulación de preguntas evolutivas que puedan analizarse con información filogenética e integración de datos fenotípicos, ecológicos, biogeográficos, etc.

Aprender a usar programas de acceso libre para el análisis macroevolutivo con hipótesis filogenéticas como marco de referencia.

El curso abordará en cada sesión aspectos teóricos y prácticos para cada tema y estará disponible en línea para el acceso a los programas, datos, lecturas, entrega de trabajos y evaluaciones.

Al inicio de cada sesión (posterior a la clase inicial de introducción) habrá una presentación por parte del profesor donde se abordarán aspectos teóricos, metodológicos y/o prácticos de cada tema y la presentación por parte de un alumno, de un artículo con una discusión colectiva y preguntas (10 a 12 hrs).

La segunda parte de la clase estará destinada a ejercicios con programas computacionales libres y datos proporcionados por el profesor.

La evaluación incluye como elemento importante, la entrega de informes y discusión de los resultados de cada práctica con gráficos editados, y un trabajo final donde se desarrolle un análisis macroevolutivo con datos disponibles en internet.

Conceptos básicos de sistemática, evolución y construcción de filogenias.

Computadora personal.

Comprensión de lecturas en inglés.

Recomendable conocimientos de estadística, sistemática filogenética y nociones de R.

Asistencia= Obligatoria.

Presentación de artículos 30%.

Reportes de prácticas 50%.

Trabajo final 20%.

Filogenias, programas y formatos.

Edición de cladogramas.

Identificación de patrones de transformación evolutiva.

Modelos de evolución.

Señal filogenética.

Métodos filogenéticos comparados para caracteres discretos y continuos.

Métodos estadísticos multivariados en filogenias.

Reconstrucción de estados ancestrales.

Diversificación.

Biogeografía.

Morfometría geométrica.

Morfología teorica. 

Morfología construccional.

Paisajes adaptativos.

Visualización de datos en filogenias.

1) Dominar la terminología relacionada a un experimento de secuenciación; 2) Reconocer el tipo de archivos generados en una corrida de secuenciación y identificar la información que contienen; 3) Familiarizarse con la linea de comandos dentro del ambiente LINUX; 4) Entender los algoritmos computacionales empleados para el ensamblado de genomas y transcriptomas; 5) Familiarizarse con software especializado para el ensamblado de genomas y transcriptomas.

El diseño del curso es teórico-práctico-reflexivo. A cada sesión práctica le antecede una sesión teórica en la que se discutirán los fundamentos esenciales para comprender cada uno de los pasos que se realizarán en los ejercicios. Después de cada sesión práctica, se realizará una sesión de discusión plenaria para interpretar los resultados obtenidos y analizar los resultados disponibles en bases de datos y en la literatura científica.

Contar con un equipo portátil de cómputo (laptop o netbook) con conexión a red (inalámbrica o ethernet) y preferentemente con sistema operativo base UNIX (macOS, Ubuntu, CentOS o alguna otra distribución de Linux). En caso de no contar con alguno de estos sistemas operativos en su equipo, el alumno deberá asistir a una sesión previa al inicio del curso para que se le instale un sistema adecuado.

Capacidad de pensamiento crítico, trabajo por cuenta propia y destrezas básicas para el trabajo por computadora.

Asistencia y participación 20%, Ejercicios en clase 40%, Evaluaciones parciales y final 40%

1. Introducción a la bioinformática y a los sistemas UNIX. 2. Estructura de los genomas eucariotes y procariotes; 3. Genes, DNA repetitivo y eventos de duplicación de genomas; 4. Las plataformas de secuenciación NGS; 5. Tipos de librerías para secuenciación y sus características; 6. Estándares de calidad y filtrado de secuencias; 7. Algoritmos utilizados para el ensamblado de un Genoma; 8. Predicción de modelos génicos en organismos eucariotes y procariotes; 9. Anotación de genomas; 10. Algoritmos utilizados para el ensamblado de un transcriptoma; 11. Análisis de expresión diferencial; 12. Metagenómica.

• Comprender como los patógenos interactúan con sus hospederos y el medio ambiente.
• Explicar los factores que favorecen la emergencia y reemergencia de patógenos en humanos, y animales, incluyendo algunos de importancia en la conservación de especies silvestres.
• Identificar las herramientas teóricas y prácticas para el monitoreo, evaluación, y predicción de epidemias y epizootias.
• Identificar estrategias preventivas y de control de los brotes epidémicos y epizoóticos (Vacunas, manejo de poblaciones, servicios ambientales, etc.)
• Describir los aspectos históricos y actuales que impactan la dinámica de transmisión de patógenos.
• Identificar el papel de los científicos, biólogos, ecólogos, epidemiólogos, veterinarios, y médicos, entre otros en el estudio, prevención y control de enfermedades con un enfoque de Una Salud.

Impartición de clases acerca de los fundamentos y aproximaciones teóricas de la ecología de enfermedades y epidemiología. Se realizará una introducción practica a los métodos de captura y toma de muestra, así como algunos aspectos moleculares para estudiar patógenos y realizar diagnóstico de enfermedades. Cada alumno presentará un artículo de su elección asociado a su sistema de interés donde aborde algún tópico de ecología de enfermedades, tras lo cual se discutirán los métodos, resultados y conclusiones.

Tener estudios de licenciatura en biología, veterinaria, o carreras afines a ciencias de salud.

Tener nociones básicas de ecología y/o epidemiologia y/o medicina veterinaria. Lectura y comprensión del inglés.

25% Tarea: revisión bibliográfica sistemática de un tema asociado a la ecología de enfermedades, 25% presentación de artículo científico, 20% Informe de práctica, 20% Clases grupales, 10% participación en clases.

1. Ecología de enfermedades infecciosas y conceptos generales.
2. Interacciones ecológicas (modulación de las interacciones, del parasitismo al mutualismo, competencia inter and intraespecífica, Interacción parasito-hospedero).
3. Dinámica de enfermedades en los distintos niveles: individuos, poblaciones, comunidades y ecosistemas.
4. Metapoblaciones y las enfermedades.
5. Competencia de hospederos y competencia vectorial.
6. Evolución, el sistema inmune y la Reina Roja.
7. Aspectos evolutivos de los patógenos en la interacción parásito-hospedero: Coespeciación, coevolución y salto taxonómico (“spill over”).
8. Diversidad y enfermedades infecciosas: Hipótesis de dilución.
9. Modelos de enfermedades.
10. Aspectos paisajísticos y antrópicos y su relación con brotes epidémicos y epizoóticos: Cambios en el uso de suelo, pérdida de hábitat, fragmentación, efecto de borde y enfermedades infecciosas.
11. Cambio climático y enfermedades emergentes.
12. Control de enfermedades: Manejo de hábitat, hospederos y parásitos en situaciones de emergencia epidemiológica y epizootiológica.
13. Estudios de caso: Enfermedades emergentes y reemergentes que impactan la salud pública y la conservación en ecosistemas terrestres y marinos (Patógenos de transmisión directa y por vectores).
14. Herramientas para el monitoreo de enfermedades infecciosas: Métodos de captura y colecta y técnicas de diagnósticos.
15. Bioinformática: análisis filogenéticos.
16. Políticas, guerras, pobreza y enfermedades infecciosas en el mundo.
17. Tendencias y perspectivas en ecología de enfermedades en México.

1) Conocer las bases teóricas del Modelado de Nicho Ecológico (MNE) y de los Modelos de Distribución de Especies (MDE).

2) Conocer la teoría y las aplicaciones empíricas del modelado de nicho ecológicos y distribución de especies.

3) Manejo de algunos de los algoritmos más comunes.

Por facilidades prácticas y disposición de los profesores invitados, este curso será intensivo, de tal manera que se cumplan en total 80 horas de clase, más lecturas extra clase para su discusión. Los alumnos utilizarán parte de horario extra clase para el desarrollo de un proyecto.

Los alumnos deben tener conocimientos en el uso de algún sistema de información geográfica: ArcMap, QuantumGIS, etc. o paqueterías para estos análisis en R. Se dará preferencia a los que demuestren haber tomado un curso de SIG. BECAS: Para los estudiantes externos provenientes de instituciones educativas que tengan convenio vigente con el INECOL.

Además de contar con los conocimientos sobre SIG, los interesados deben tener mucho interés en aprender usar este tipo de herramientas para contestar preguntas biológicas concretas.

Serán evaluados a través de la participación en clase a través, de lecturas, la realización de un examen y mediante la realización y presentación de un proyecto final que desarrollarán durante el curso. El curso será evaluado de la siguiente manera: Proyecto 60%, Examen 20%, participación y lecturas 20%.

1. Introducción: el modelado de nicho como herramienta

       1.1 La Informática de la Biodiversidad

       1.2 Los Modelos de Nicho ¿qué son y para qué sirven? Ejercicio manual con México

2. Breve introducción al uso de Sistemas de Información Geográfica

       2.1 Teoría y Ejercicios (SDMtools)

3. Las unidades del modelado

       3.1 ¿Qué estamos modelando? Conceptos de especie, subespecie y población

       3.2 Ejemplo

4. Áreas de distribución

       4.1 Conceptos y métodos para su determinación

       4.2 Ejemplo de delimitación de áreas (práctica alumnos)

       4.3 Análisis de las áreas (areografía)

       4.4 Biogeografía Histórica y Ecológica

5. Conceptos de nicho (desde Grinnell hasta Chase & Leibold) ¿Qué nicho estamos modelando?
6. Del nicho ecológico a la distribución geográfica (BAM)

       6.1 La dualidad de Hutchinson

       6.2 B, A y de M; su papel en las áreas en BAM (Go, Gi, Gp)

       6.3 Áreas de Calibración

       6.4 Configuraciones de BAM

       6.5 Teoría de conservadurismo de nichos

7. Implementación: calibración de modelos

      7.1 Datos de entrada: biológicos

             7.1.1 Tipos de datos: sólo presencia, presencia/ausencia, presencia/pseudoausencia presencia/entorno

             7.1.2 Consideraciones de los datos biológicos: Formatos, Fuentes de datos, Georreferenciación, Errores asociados

             7.1.3 Práctica de limpieza de datos

      7.2 Datos de entrada: geográficos

             7.2.1 Tipos de datos: variables directas e indirectas (scenopoéticas y bionóminas)

             7.2.2 Consideraciones de los datos geográficos: Formatos, Fuentes de datos, Resolución, Calidad, Temporalidad

             7.2.3 Selección de variables (Teoría y práctica)

8. Implementación:

      8.1 Algoritmos de modelado Master Chef de Algoritmos

             8.1.1 Teoría de BIOCLIM y su interfase (DIVA)

             8.1.2 Ellipsenm

             8.1.3 Teoría de Maxent

             8.1.4 Interfase de Maxent Java

9. Enfrentando la complejidad de Maxent

     9.1 Interfase de Maxent KUENM (teoría y práctica)

10. Transferencia de nichos y áreas no análogas: MESS y MOP
11. Validación de los modelos: Pruebas estadísticas, utilidad y limitaciones, Ji-cuadrado, Índice Kappa, TSS, Curva ROC y AUC – ROC Parcial, Índice Boyce
12. Wallace
13. Cambio Climático

     13.1 Variables del futuro y el pasado

     13.2 Modelos tiempo-específicos

     13.3 Consideraciones al cambio climático

14. Nicho y abundancias (Plática)
15. Conservadurismo filogenético de nichos - Ejercicios Wallace y Elipsoides
16. Aplicaciones de los MNE y MDE: Nichos y abundancias, Cambio climático, Comunidades, Conservación, Biogeografía estacional, Agrobiodiversidad, Enfermedades infecciosas, Especies invasoras, etc.

Práctica

Proyectos de los alumnos

• Conocer el marco conceptual y fundamentos teóricos en ecología del paisaje.
• Conocer los conceptos y fundamentos teóricos en genética del paisaje.
• Conocer los elementos fundamentales de diseño muestral en ecología y genética del paisaje.
• Aprender los fundamentos, limitaciones, y usos de distintas herramientas de análisis espacial en ecología y genética del paisaje.
• Conocer las principales aplicaciones prácticas de la ecología y genética del paisaje a través de estudios de caso.

El curso será teórico (2-3hrs) y práctico (4-5 hrs). De cada una de las unidades temáticas abordadas se proveerá con una sesión explicativa sobre sus fundamentos y conceptos. Esta información proveerá las bases teóricas para realizar el componente práctico de cada sesión. Asimismo, cada unidad temática estará acompañada de literatura científica cómo revisiones conceptuales, metodológicas, así como estudios de caso. El componente práctico se enfocará a utilizar software especializado para el análisis de datos, donde el alumno tendrá que elaborar reportes de manera individual o grupal. Los ejercicios se utilizarán programas de distribución libre (QGIS, CONEFOR, CIRCUITSCAPE) y paqueterías de R.

• Cada alumno deberá contar con su propia computadora portátil con los programas a usarse en el curso (los profesores enviarán las direcciones electrónicas para bajar dichos recursos).

• Conocimientos básicos de estadística.
• Excelente compresión de textos en inglés.
• Manejo de bases de datos (ej. excel).
• Nociones básicas de R.

• Asistencia y participación (10%)
• Entrega de ejercicios desarrollados en clase (60%). De 4 a 6 ejercicios.
• Presentación oral frente a grupo de un proyecto final (30%). El proyecto consiste en plantear una pregunta de investigación de su interés, desarrollando el diseño muestral y los análisis espaciales necesarios para responder a dicha pregunta propuesta (preferentemente sobre la tesis del estudiante y que ponga en práctica lo aprendido en clase).

Semana 1:

a) Sección teórica:

• Marco conceptual de la ecología del paisaje (escala, composición, configuración) 
• Fragmentación y pérdida de hábitat: Conceptos y casos de estudio 
• Métricas de paisaje y análisis multiescalar 
• Conectividad estructural y funcional 
• Redes de conectividad e índices de conectividad 
• Corredores biológicos

b) Sección práctica

• Métricas del paisaje 
• Extracción de métricas a múltiples escalas
• Determinación de la escala del efecto
• Selección de modelos
• Elaboración de matrices de resistencia
• Elaboracion de corredores
• Redes de conectividad

Semana 2

a) Sección teórica

• Marco conceptual en la genética del paisaje 
• Marcadores moleculares y medidas de diversidad genética 
• Consideraciones de diseño muestral en genética del paisaje 
• Análisis espaciales y no espaciales de estructura genética 
• Simulaciones computacionales en genética del paisaje 
• Análisis de la estructura espacial fina: Autocorrelación espacial 
• Análisis espaciales para evaluar la resistencia del paisaje y ambiente sobre el flujo genético

b) Sección práctica

• Estimadores de diversidad genética
• Medidas de conectividad y su relación con diversidad genética
• Análisis espaciales y no espaciales de la estructura genética
• Autocorrelacion espacial 
• ResistanceGA y otros análisis estadísticos para relacionar métricas de flujo genético con variables espaciales.

El estudiante conocerá la importancia de las proteínas en los organismos, conocerá sus estructuras, así como sus funciones. También entenderá los fundamentos de las técnicas básicas de estudio de las proteínas en el laboratorio, por ejemplo: a) extracción de proteínas, b) Métodos de separación de proteínas, c) herramientas bioinformáticas y d) técnicas masivas para el análisis de las proteínas, con el propósito de aplicará los conocimientos adquiridos en el laboratorio.

La evaluación se realizará bajo los siguientes criterios: asistencia, participación, revisión de artículos, trabajos para entregar, exámenes entre otros.

Los estudiantes interesados en el curso deberán tener conocimientos en el área de las ciencias biológicas. No es obligatorio pero deseable que los participantes tengan bases de bioquímica y biología molecular.

Se recomienda que los estudiantes tengan habilidades generales de laboratorio, como por ejemplo: manejo de pipetas, preparación de disoluciones.

La calificación final del curso (100 puntos) será la suma de las calificaciones de teoría y práctica Teoría- La asistencia, participación, trabajos para entregar, revisión de artículos, exámenes entre otros, tendrán un valor de 25 puntos (10 puntos por cada tema contemplado) Práctica- Los estudiantes entregarán un reporte de la parte experimental el cual tendrá un valor de 75 puntos en su calificación final.

Marco teórico: 1.- Generalidades de las proteínas (estructura y funciones) 2.- Técnicas básicas de purificación de proteínas 3.- Herramientas moleculares para la caracterización de las proteínas 4.-Métodos de análisis masivos para el estudio de las proteínas 5.- Herramientas bioinformáticas para la investigación de las proteínas 6.- Importancia de las proteínas en los procesos biológicos.

Desarrollo experimental: El Curso cuenta con sesiones de laboratorio en donde el estudiante aprenderá los métodos básicos para la extracción, separación y estudio de las proteínas presentes en la biodiversidad.

• Dominar comandos esenciales de MOSHPIT para control de calidad y filtrado de ADN huésped.

• Ejecutar ensambles de contigs y binning de MAGs dentro de MOSHPIT.

• Realizar clasificación taxonómica y anotación funcional de contigs/MAGs.

• Calcular métricas de diversidad alfa/beta y abundancia diferencial en R.

• Interpretar resultados bajo el marco de la Ecología Microbiana.

Curso presencial teórico-práctico. Cada sesión alterna explicación conceptual y ejercicios en computadora. Se trabajará con subconjuntos de datos públicos de microbioma para ajustarse a los recursos computacionales. Los estudiantes deberán traer laptop; el servidor ejecutará MOSHPIT vía SSH.

• Laptop con cliente SSH y navegador.

• Conocimientos básicos de biología molecular y edición de texto plano.

Ninguna obligatoria, pero preferentemente:

• Conceptos básicos de sistemas operativos GNU/Linux.
• Conocimiento elemental de R (cargar paquetes, manipular data frames y matrices).

• Examen teórico: 20 %

• Proyecto final: 80 %

1.-Infraestructura y QC de datos

a) Arquitectura de servidores Linux y MOSHPIT.
b) Control de calidad.
c) Filtrado de ADN del insecto.
d) Generación de reportes.

2.-Ensamble y binning con MOSHPIT

a) Ensamble con MEGAHIT.
b) Evaluación con QUAST.
c) Mapeo de lecturas a contigs.
d) Binning con MetaBAT2.
e) Evaluación de MAGs con BUSCO y filtrado de calidad.

3.-Anotación taxonómica y funcional

a) Construcción de BD Kraken2 y clasificación.
b) Predicción de genes (Prodigal) y búsqueda de ortólogos.
c) Extracción de anotaciones y perfiles funcionales.

4.-Ecología, estadística y visualización en R

a) Exportación de tablas a R.
b) Diversidad alfa/beta.
c) Análisis de abundancia diferencial.
d) Teoría ecológica aplicada al microbioma de insectos.
e) Presentación de resultados (PCoA, heatmaps, barplots).

1. Revisar los conceptos y aplicaciones detrás de los modelos de nicho: la informática de la biodiversidad, los conceptos de nicho ecológico, de área de distribución, etc. 2. Entender la relación entre el espacio geográfico y el espacio ambiental. 3. Conocer las bases teóricas para hacer modelos de nicho ecológico robustos: interacción entre factores bióticos, abióticos y de movilidad (diagrama BAM). 4. Diseñar especies virtuales y usarlas para entender distintos aspectos de la calibración y validación los modelos de nicho ecológico. 5. Explorar la conveniencia y consecuencia del uso de distintos umbrales de corte para representar las distribuciones de las especies. 6. Analizar la validación estadística de modelos. 7. Hacer modelos basados en procesos para estimar la abundancia en un contexto espacialmente explícito y con distintos kernel de dispersión. 8. Discutir la actualidad de los modelos de nicho ecológico: preguntas y avances teóricos y aplicados del modelado de nicho ecológico.

Es un curso intensivo de tal manera que se cumplan en total 80 horas de clase más lecturas extra clase para su discusión. Mediante sesiones teórico-prácticas los alumnes trabajarán durante el tiempo de clase conjuntamente con los profesores para entender los conceptos y visualizar distintas complicaciones en el modelado de nichos ecológicos correlativos y basados en procesos.

Es preferible contar con conocimientos básicos en SIG (e.g., ArcMap, QGIS) y R. Se recomienda también conocimiento sobre la teoría de nichos ecológicos y haber implementado alguna herramienta para la modelación de nichos (e.g., GARP, Maxent, Bioclim). Es conveniente haber tomado el curso básico ofrecido en el INECOL o algún otro relacionado.

Es deseable que el alumne cuente con conocimientos en el lenguaje R y tenga experiencia en algún paquete de SIG (e.g., ArcView, ArcGis, QGIS).

La evaluación ser hará a través de la participación en las lecturas y la discusión grupal (10%), la realización de las prácticas en clase (70%), y el diseño de un caso o experimento a modelar (20%).

1. La Informática de la Biodiversidad.? 2. Introducción a R para este curso. 3. Conceptos de nicho?ecológico. 4. Modelos correlativos, mecanísticos y basados en procesos. 5. La dualidad de Hutchinson: la relación entre el espacio ecológico y el espacio geográfico. 6. El diagrama BAM: áreas de distribución y nichos ecológicos. a. Los conjuntos B, A y M b. Implicaciones de M en la calibración, significancia, traslape y transferencia de los modelos c. Configuraciones del diagrama BAM 7. Las desigualdades de Hutchinson. 8. Aproximaciones al nicho fundamental y su estructura 3D. a. Cuboides (Bioclim), esferoides (misma favorabilidad interna), elipsoides (covariancia entre variables) b. Distancias ambientales (Euclideana, Manhatan, Mahalanobis) 9. Especies virtuales como herramienta de modelado. a. Sesgos en el modelado: consideraciones en los espacios geográfico y ecológico b. Tipos de datos: presencia, presencia/ausencia, presencia/pseudoausencia, presencia/entorno c. Proceso de modelado: ejercicios de exploración con especies virtuales 10. Proyección espacial: transferencia y extrapolación de los modelos en espacio y tiempo. 11. Validación de los modelos: pruebas estadísticas, utilidad y limitaciones. a. Ji-cuadrada, curva ROC, AUC–ROC Parcial, índice Kappa y TSS 12. Conservadurismo y traslape de nicho: equivalencia, similitud y traslape de ?nichos. 13. De las poblaciones a las metapoblaciones: los modelos basados en procesos, sus fundamentos y supuestos biológicos. 14. Implicaciones de la estructura interna del nicho en fenómenos biológicos. a. Hipótesis del centroide de nicho y la abundancia.

• Que los estudiantes se familiaricen con los términos y conceptos relacionados a la nomenclatura botánica
• Conocer los principios del Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas
• Conocer las reglas generales para la formación de los nombres científicos de las plantas
• Conocer diversas herramientas electrónicas (plataformas) útiles relacionados a la nomenclatura botánica y estudios taxonómicos

Los profesores impartirán la parte teórica de los diferentes temas. La parte práctica consistirá en resolver algunos ejemplos con problemas taxonómicos y nomenclaturales de algún taxa que sea del interés del estudiante o propuestas de los coordinadores, de tal manera que los estudiantes puedan proponer lectotipos, epitipos o neotipos para los nombres de los taxones. resolver la historia taxonómica del taxa de su interés y reconocer los nombres aceptados y diferentes tipos de sinónimos. Los estudiantes realizarán un trabajo final relacionado a la publicación de nuevas especies

Conocimientos básicos de botánica, o de preferencia que esté trabajando la sistemática o taxonomía de algún grupo de plantas

Conocimientos básicos de botánica, o de preferencia que esté trabajando la sistemática o taxonomía de algún grupo de plantas

Examen: 50%

Ejercicios y tareas: 20%

Trabajo final: 30%

La nomenclatura y su relación con la Sistemática Vegetal

Introducción a la nomenclatura botánica

Códigos Internacionales de Nomenclatura

Principios del Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas

Cómo se forman los nombres de las plantas y sus reglas ortográficas:

Nombres de familias, géneros, especies, variedades y subespecies, híbridos y plantas cultivadas.

Nombre del autor y referencia nomenclatural

Concepto de “tipo nomenclatural”

Clases de tipos nomenclaturales utilizados en botánica

Cambios de nombres

Concepto de basónimo, sinónimo y tipos de sinónimos

Nombres aceptados, válidos e ilégitimos

Descripción de nuevas especies

Recursos electrónicos: librerías y herbarios digitales

Ejercicios prácticos: Tipificación de nombres, descripción  de nuevas especies, historia taxonómica de algún taxa

Brindar un panorama general de la diversidad de plantas vasculares (helechos, gimnospermas y angiospermas) que se distribuyen en México, señalando sus centros de diversifican (sitios y tipos de vegetación) y endemismo.

Interpretar las características morfológicas vegetativas y reproductivas importantes para identificar plantas: hábito, hojas, soros, inflorescencias, flores, frutos.

Mostrar el manejo de claves para determinar plantas.

Presentar la literatura (Floras, revisiones y monografías) y las herramientas en línea más importantes para identificar plantas mexicanas.

Mostrar la importancia de los herbarios en la determinación de plantas vasculares.

Explicar los pros y las contras de las aplicaciones disponibles para determinar plantas de fotos, por ejemplo: LeafSnap, iNaturalista y PlantNet.

Dar a conocer las familias y géneros más diversos en México y mostrar sus características distintivas.

Demostrar métodos de rehidratación de material seco y disección de estructuras, además del uso correcto de un estereoscopio.

El curso será impartido durante 2 semanas de forma intensiva. Tiene componentes teóricos y prácticos.  Cada día se darán presentaciones en la mañana, seguidos por sesiones prácticas por la tarde. Las actividades prácticas consistirán en tres aspectos: 1) caracterizaciones e interpretaciones de estructuras (soros, hojas, flores, frutos, etc.); 2) características sobresalientes de los taxones más importantes, incluyendo clases, familias y géneros; y 3) ejercicios de determinación de ejemplares usando claves y recursos en línea. El material necesario para la identificación de las plantas se proporcionará en el curso. Haremos un par de salidas locales (de dos a tres horas) a sitios en los alrededores de Pátzcuaro para observar plantas en el campo y conseguir material fresco para determinar, siempre asegurando tomar las precauciones necesarias con respecto a seguridad.

Conocimientos básicos de la botánica, incluyendo morfología de plantas.

Conocimientos sobre la biología.

Asistencia (10 %), Exámenes (30 %), Trabajos (60 %)

Diversidad vegetal de México y como se distribuye en diferentes regiones y ecosistemas.

Características y riqueza de los cuatro taxones más importantes de plantas vasculares (licofitas, helechos y plantas afines, gimnospermas, angiospermas).

Como distinguir las familias más diversas de México: Asteraceae, Fabaceae, Orchidaceae, Poaceae, Euphorbiaceae, Rubiaceae, Cactaceae, Lamiaceae, Malvaceae, Asparagaceae, Bromeliaceae, Apocynaceae, Cyperaceae y Solanaceae.

Morfología comparativa de estructuras vegetales: tallos y hojas.

Morfología comparativa de estructuras reproductivas: soros, estróbilos, flores, frutos, semillas.

Las floras regionales y locales de México.

eFloraMEX, una Flora electrónica de plantas mexicanas.

Bibliografía especializada sobre plantas mexicanas, incluyendo revisiones y monografías.

Uso de claves dicótomas y de acceso múltiple.

El método comparativo para determinar plantas.

Plataformas y aplicaciones para identificar plantas.

Organización y manejo correcto de ejemplares de herbario.

Desarrollar habilidades en producción y caracterización de los nanomateriales. Adquirir experiencia en la aplicación de nanotecnología en agricultura y medio ambiente. Conozca los efectos de las nanopartículas y los métodos actuales de evaluación.

El curso incluye clases teóricas, exposición, discusión de literatura científica y prácticas en el laboratorio desde el método de obtención de las nanopartículas hasta la aplicación.  

Los estudiantes requieren un nivel mínimo de licenciatura con conocimientos básicos de biología, química y física, así como comprender textos en inglés. Los estudiantes externos de instituciones educativas que tengan convenio vigente con el INECOL Tendrán el 50% de descuento en el pago. Estudiantes sin convenio tendrán que cubrir el 100% de la cuota.

Los estudiantes requieren un nivel mínimo de licenciatura con conocimientos básicos de biología, química y física, así como comprender textos en inglés. 

Exposición de literatura científica (30%), un reporte y exposición de prácticas en laboratorio (30%), un examen final escrito (40%).

1. Introducción a la Nanociencia y Nanotecnología 2. Síntesis de nanomateriales basadas en metales (NPs-M) 3. Propiedades de los NPs-M 4. Principales técnicas de caracterización de los nanomateriales 5. Nanoencapsulación aplicada a la agricultura 6. Comportamiento de las NPs-M en el suelo y agua 7. Interacción de las NPs-M con las plantas 8. Interacción de las NPs-M con los microorganismos 9. Aplicación de los NPs-M en la agricultura  10. Aplicación de los NPs-M remediación del medio ambiente 

• Dar a conocer los conceptos básicos de la ecología química y de la función de los metabolitos en la mediación de las interacciones de los insectos
• Conocer los mecanismos de detección que utilizan los insectos para percibir olores (i.e., antenas y sénsulos en las mismas, sensilas en el ovipositor), así como los mecanismos moleculares involucrados en la transducción de señales (i.e., proteínas de asociación a olores u “odor binding proteins – OBPs, receptores de olores, proteínas de degradación de olores, etc).
•  Comprender los mecanismos de comunicación química de insectos a nivel intra e interespecífica.
• Comprender los mecanismos conductuales mediados por compuestos químicos que utilizan los insectos para localizar a sus plantas/frutos hospederos y presas (i.e., comportamiento de forrajeo) y determinar la calidad de estos.
• Comprender la compleja interacción entre las plantas y los insectos fitófagos, involucrando químicos secundarios tóxicos (i.e., xenobióticos).
• Conocer el papel que juegan las bacterias en el intestino de los insectos, en el bienestar de estos y en el desdoblamiento de compuestos tóxicos o deletéreos.
• Conocer los instrumentos y técnicas analíticas que se utilizan en estudios de ecología química para la identificación de metabolitos y/o compuestos semioquímicos, que incluyen pruebas conductuales de los insectos en respuesta a estímulos químicos a través de electroantenografía, olfatometría, así como el análisis químico de los compuestos por cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas (CG-EM).
• Conocer algunas técnicas de análisis estadístico utilizadas en estudios de ecología química, incluyendo los modelos de superficie de respuesta.

El curso constará de sesiones teóricas con la presentación y discusión sobre los conceptos fundamentales de ecología química de insectos, incluyendo mecanismos de comunicación química, factores que influyen en las interacciones químicas y técnicas experimentales avanzadas. Y sesiones prácticas, para aplicar los métodos y técnicas aprendidos en las sesiones teóricas. Durante las sesiones habrá análisis y discusión de artículos científicos relevantes para profundizar en los temas tratados en el curso. Al final, se aplicará un examen para evaluar los conocimientos adquiridos. Los participantes desarrollarán un proyecto final que aplique los métodos y técnicas aprendidos en el curso, el cual permitirá evaluar la comprensión y aplicación de los conceptos aprendidos.

Preferentemente contar con conocimientos básicos de entomología, química, agronomía y estadística.

Nociones básicas de química y habilidad para manejar insectos vivos.

Participación en clase y prácticas de laboratorio (50 %); Proyecto corto basado en su sistema de estudio (20 %); Examen (30 %).

DIA 1:

1. Introducción a la ecología química (Larissa Guillén; 2 hrs.)
   • ¿Qué es la ecología química?
   • Clasificación ecológica/funcional de los metabolitos secundarios: Infoquímicos/semioquímicos, feromonas (sexuales, oviposición, agregación, de alarma, de rastro, de reconocimiento, reguladoras), Aleloquímicos: Alomonas, kairomonas y sinomonas.
2. Metabolitos secundarios (Juan Luis Monribot; 2:30 hrs.)
   • Defensas constitutivas e inducibles de las plantas.
   • Tipos de metabolitos secundarios: Terpenos, compuestos fenólicos, compuestos nitrogenados, glucósidos cianogénicos, glucosinolatos, aminoácidos no proteicos, benzoxazinides.
   • Marcadores químicos distintivos de plantas resistentes o tolerantes.
3. Herramientas para estudios de Ecología Química (Patricia Romero/Alma Altúzar; 1 hr.)
   • Métodos de colecta de compuestos volátiles.
4. Sesión práctica: Colecta de compuestos volátiles (Alma Altúzar/Patricia Romero/Larissa Guillén; 2 hrs.)

DIA 2:

1. Olfacción en insectos (Larissa Guillén; 2 hrs.)
   • Antenas y su morfología.
   • Sénsulos olfativos.
2. Mecanismos moleculares de transducción de señales olfativas en insectos (Joan Aguilar; 2.5 hrs.)
   • Proteínas involucradas en la detección de olores.
   • Mecanismo molecular del proceso de olfacción.
   • Procesamiento de la información olfativa.
3. Herramientas para estudios de Ecología Química (Patricia Romero/Larissa Guillén; 1 hr.)
   • Electrofisiología:Electroantenografía, electroantenodetección, sensilografía.

4. Sesión práctica: Pruebas de electroantenografía (Patricia Romero/Alma Altúzar/Larissa Guillén; 2:30 hrs).

DIA 3

1. Comunicación química intra e interespecífica que media diferentes comportamientos de insectos y factores bióticos y abióticos que influyen en la respuesta olfativa: el caso de las Moscas de la Fruta (Martín Aluja; 4 hrs.)
   • Comportamiento de forrajeo (búsqueda de hospedero y de precursores feromonales)
   • Comportamiento sexual
   • Comportamiento de oviposición
   • Interacciones con parasitoides
   • Uso de trampas con atrayentes volátiles para el monitoreo y control de poblaciones plaga
2. Herramientas para estudios de Ecología Química (Patricia Romero; 1 hr.)
   • Olfatometría
   • Pruebas de comportamiento en olfatómetros de una, dos y múltiples vías, túnel de viento, uso de trampas en jaula y campo.
3. Sesión Práctica: Medición de respuesta en olfatómetro de 2 vías y túnel de viento (Patricia Romero/Larissa Guillén; 2 hrs.)

DIA 4

1. Interacción química con microorganismo (Dr. Daniel Cerqueda, 2.5 hr)
   • Microbiota como “fábrica” y modulador de señales químicas

• Concepto de holobionte olfativo: huésped + microbiota
• Producción y biotransformación de volátiles microbianos (VOCs)
• “Blend coding”: por qué el olor es mezcla (no un compuesto aislado)
  • Olores humanos + microbiota: atracción de insectos hematófagos
• Microbiota cutánea y perfiles de volátiles (variación entre individuos)
• Ejemplo guía: ácidos carboxílicos cutáneos y atracción diferencial a mosquitos
• Implicaciones ecológicas y de salud pública (señales, riesgo, intervención) 
  • Insectos + microbios: olores de recursos y señales sociales
•  Fermentación como señal ecológica: levaduras/bacterias guiando atracción y oviposición
•  Microbiota intestinal como fuente/precursor de semioquímicos (ej. compuestos fenólicos)
•  Caso aplicado: volátiles microbianos como herramienta para atracción/trampas
  • Resistencia Inducida por Microorganismos (MIR/ISR) y ecología química de defensas
• Preacondicionamiento y Resistencia Sistémica Inducida: conceptos y rutas (JA/ET/SA; visión ecológica)
• Volátiles bacterianos como elicitores
• Consecuencias multitróficas: cambios en VOCs de plantas y sus consecuencias en herbívoros y enemigos naturales

2. Herramientas para estudios de Ecología Química (Dras. Alma Altúzar/Patricia Romero; 2 hrs.)

2. • Identificación de compuestos volátiles
   • Fundamento
   • Identificación de compuestos, cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas y otras técnicas frecuentemente aplicadas
3. Sesión práctica: Análisis e identificación de compuestos químicos volátiles por cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas (Patricia Romero/Alma Altúzar/Larissa Guillén; 2 hrs.)

DIA 5

1. Tendencias: Ecología química reversa, estrategias omicas, etc. (Larissa Guillén; 1 hr.)
2. Diseño experimental y análisis estadísticos de datos (Carlos Pascacio; 4 hrs.)
   • Diseño experimental
   • Significancia estadística, tamaño de muestra, tamaño del efecto e intervalos de confianza
   • Exploración de datos
   • Análisis de varianza
   • Métodos de superficie de respuesta
3. Discusión general (Larissa Guillén; 1 hr.)
4. Aplicación de examen (Larissa Guillén; 1 hr.)

• Revisar el desarrollo histórico, estado actual y futuro del concepto de los servicios ambientales y la economía ambiental.
• Revisar los procesos ecosistémicos importantes en el funcionamiento de dichos servicios incluyendo los ciclos de agua, carbono, nitrógeno, y fósforo, así como la hidrología, polinización, formación de suelos, protección contra disturbios, etc.
• Revisar los principales servicios ambientales proporcionados por los ecosistemas de México.
• Revisión de siete servicios ambientales para profundizar en los pasos a seguir en la cuantificación, valoración y creación de esquemas de compensación para estos servicios.
• Destacar los métodos principales utilizados para cuantificar y valorar los servicios ambientales.
• Revisar las fortalezas y debilidades de los mercados que se están creando para el pago por servicios ambientales en México y el extranjero.

El curso constará de clases de dos horas y medio cada día. Durante los primeros 1.5 horas habrá presentaciones por el coordinador del curso o profesores invitados de temas específicas, seguido por un break de 15 minutos. En las últimas 45 minutos de la clase, un alumno tendrá que presentar y liderar una discusión sobre el articulo asignado al grupo por el profesor. Habrá una salida a campo de un día completo para conocer los actores relevantes, las actividades y la historia de un programa de pago por servicios hidrológicos activo en la cuenca del Río Pixquiac.

Conocimientos básicos de Ecología (equivalente a un año de estudios de posgrado) y la capacidad de leer 2 artículos (la mayoría en Inglés) por día.

El curso está dirigido en particular a alumnos en la fortaleza de ecología, manejo de recursos naturales y conservación. Sin embargo, también debe proporcionar conocimiento valoroso para alumnos en las demás fortalezas.

• Participación activa en las discusiones de las lecturas, y los temas presentados por los profesores invitados y los artículos asignados (15%)
• Examen final de ensayo sobre temas selectos del material presentado  (50%)
• Presentaciones de árticulos claves al grupo de alumnos y profesores (35%)

• Introducción al curso y avances recientes en el estudio de los servicios ambientales (R. Manson, INECOL: 1 días)
• Desarrollo historico del concepto de servicios ambientales (Santiago Tort, IIE-UNAM: 1)
• Métodos de valoración económica (R. Manson, INECOL: 1)
• Servicios selectos: ecoturismo en el monitoreo de aves en Rio de Rapaces (Kashmir Wolf, Pronatura Veracruz: 1)
• Servicios selectos: manejo holístico de plagas y enfermedades en cafetales (Juan Francisco Barrera, ECOSUR: 1)
• Protección contra tormentas (Octavio Pérez-Maqueo, INECOL: 1)
• Servicios hidrológicos I: Bases sobre hidrología de cuencas I: procesos afectando el régimen de caudales y calidad de agua; Cuantificando servicios hidrológicos con una herramienta de modelación hidrológica (SWAT) (Susana Alvarado, INECOL y Sergio López, FMCN: 1)
• Servicios hidrológicos II: Servicios hidrológicos: evapotranspiración y la cuenca “al revés” (Susana Alvarado, INECOL: 1
• Servicios hidrológicos III: cuantificación y valoración en InVEST (Pierre Mokondoko, IIE-UNAM: 1)
• Consideraciones en la creación operación de programas de PSH (Robert Manson, INECOL: 1)
• Salida a campo para conocer programas de pago por servicios hidrológicos en Coatepec y Xalapa (R. Manson y Tajin Fuentes Gina Vidriales, SENDAS: 1)
• Servicios selectos: conservación de la biodiversidad (Robert Manson, INECOL: 1)
• Servicios selectos: polinización y tendencias mundiales (Taylor Ricketts, Univ. Vermont: 1)
• Servicios selectos: polinzadores y polinización en México (Rémy Vandame, ECOSUR: 1)
• Servicos selectos: belleza escenica en la zona costera (Debora Lithgow, INECOL: 1)
• Servicios selectos: control biológico de plagas (Rodrigo Lasa, INECOL: 1)
• Servicios selectos: fertilidad de suelos en cafetales (Isabelle Barois, INECOL: 1)
• Servicios selectos: fertilidad y hongo microrricicos en milpas (S. Negrete, INECOL: 1)
• Servicios selectos: principios básicos y métodos de medición de sucuestro de carbono (Robert Manson, INECOL: 1
• Servicios selectors: evolución de mercados de carbono y otros mecanismos financieros (Renée González Montagut, FMCN: 1)
• Examen de ensayo (Robert Manson y Susana Alvarado, INECOL: 1)

1. Discusión sobre las aproximaciones teóricas y prácticas para el estudio de la diversidad funcional.
2. Revisión e implementación de los protocolos para definición de grupos (o entidades) funcionales.
3. Revisión e implementación de métodos analíticos e inferenciales para la estimación y evaluación de la estructura funcional a nivel de comunidad.
4. Ofrecer un espacio para abordar inquietudes específicas con conjuntos de datos de los asistentes al seminario.

El seminario se desarrollará con un flujo de trabajo mixto que abarcará tres actividades: (1) teoría, (2) práctica y (3) secciones de discusión. Las dos primeras actividades se desarrollaron los días lunes, miércoles y viernes. La tercera actividad se desarrollará los martes y jueves. El días viernes 12 de septiembre, los asistentes deberán presentar un seminario de 10 minutos para compartir sus experiencias con el análisis de sus datos (según lo abordado en el seminario). Para las secciones de discusión se tendrá la participación de tres conferencistas invitados que compartirán sus experiencias en estudios de diversidad funcional con insectos en escala local y de paisaje, y la modelación de diversidad funcional anfibios en escala regional y global; por otro lado se pedirá a los asistentes que busquen uno o dos artículos que aborden alguno de los siguientes temas a través de casos de estudio: (i) comparación entre métodos convencionales vs. serie de Hill para evaluación de diversidad funcional; (ii) casos de estudios sobre aplicación de diversidad beta-funcional; (iii) casos de estudio que implementen la aproximación RQL y (iv) integración de análisis de diversidad funcional y redes de interacción. La secciones prácticas se basan en la revisión y uso de scripts en R.   

(1) Manejo básico de hojas de Excel; (2) Conocimientos básicos en el uso de R; (3) Conocimientos en ecología de comunidades; (4) Conocimientos básicos en estadística inferencial; (5) Conocimientos básicos en métodos de estadística multivariada.

Disposición para lectura crítica de artículos científicos y para discusión abierta, constructiva y objetivo, sin miedo a las matemáticas.

(1) Participación en las secciones teóricas y prácticas: 10%

(2) Participación activa en las secciones de discusión: 30%

(3) Seminario final: 60%

Semana 1 (1 - 5 de septiembre)

1.Diversidad funcional vs diversidad rasgos: discusión. Rasgos funcionales (Conceptos). Rasgo efecto y respuesta. Literatura base: McGill et al. (2006); Viole et al., (2007); Petchey et al., (2009); Weiher et al. (2011). 

2. Facetas de diversidad funcional. Literatura base: Villeger et al., (2008); Mouchet et al., (2010); Mason et al., (2013).

3. Medidas convencionales: matrices datos, medidas de distancia y modelos nulos (CWM). Literatura base: Villeger et al., (2008); Mouchet et al., (2010); Mason et al., (2013).

4. Primer caso de estudio, conferencista invitado (martes 4 de septiembre). 

Semana 2 (8 - 12 de septiembre)

5. Marco unificado de estimación: número efectivo de grupos funcionalmente distintos (^qD_fun). Literatura base: Chiu & Chao (2014); Chao et al., (2014, 2019); Olman et al., (2019).

6. Estimaciones de diversidad: iNEXT.3D, FD, mFD. Literatura base: Chao et al., (2021, 2023).

7. Respuesta a filtros ambientales. Estructura funcional (trait syndromes)-RQL. Literatura base: Dray and Legendre (2008); Mouillot et al., (2013); Dray et al., (2014).

8. Dos casos de estudio (anfibios en escalas regional y global-martes 9 de septiembre-; abejas nativas en escala local-martes 9 de septiembre-). Conferencistas invitados.

9. Seminarios finales presentados por asistentes al seminario (10 minutos por seminario, sin contar sección de preguntas y discusión).    

Desarrollar las habilidades necesarias para poder realizar sus muestreos en campo de forma segura, esto lo realizaremos a través del aprendizaje en una experiencia vivencial de alto nivel y entrenamiento teórico-práctico.

Aprender la técnica de posicionamiento básico de trabajo: caminar en los brazos/ramas; instalación de puntos de anclaje y redirecciones.

Realizar inspecciones del árbol previas a la escalada conducida por un asistente.

Diferenciar entre el equipo apropiado para trepar a los árboles, y el equipo que es similar en apariencia, pero no adecuado para el soporte de vida en los árboles.

Las clases serán presenciales, el curso tiene una duración de 4 días, en modalidad intensivo 8 horas diarias. El 80% del curso será en campo aplicando las diferentes técnicas de ascenso. Los días de clase serán de lunes a jueves de 9:00 a 17:00 hrs. Las clases prácticas se realizarán en el Jardín Botánico Clavijero del INECOL, el examen final se realizará en el mismo Jardín Botánico, de Xalapa, Veracruz.

Ninguno

No se requiere experiencia previa para el ascenso a los árboles, es recomendable tener una condición física aceptable y no tener miedo a las alturas

Asistencia a las clases teóricas y prácticas (50%), aprobar el examen final que será práctico (50%)

• Inroducción a la ecología del dosel
• Principales técnicas de muestreo en el dosel
• Evaluación de conjunto o panorámica
• Evaluación del terreno
• Evaluación del tronco
• Evaluación de la copa
• Diferentes técnicas de trepa
• Nudos y amarres
• Manejo de cuerda
• Equipo de trepa
• Cuidados y mantenimiento de equipo
• Manejo de equipo de seguridad

1. Conozca la importancia de la ilustración Científica.
2. Aprenda el uso de la Ilustración Científica en la divulgación y/o difusión de la ciencia.
3. Adquiera las bases que le permitan ilustrar diferentes organismos como son plantas e insectos para su uso en la divulgación y/o difusión de la ciencia.
4. Se familiarice con herramientas para la adquisición de imágenes necesarias para realizar la ilustración.
5. Conozca los materiales adecuados para la elaboración de ilustraciones.

El curso consta de sesiones teóricas en donde el estudiante conocerá los antecedentes de la ilustración, así como la morfología de plantas e insectos. También tendrá sesiones prácticas en donde aprenderá morfología de plantas e insectos y realizará ejercicios con diferentes técnicas para ilustrar. Los alumnos desarrollarán un proyecto en el transcurso del curso y un proyecto final empleando las técnicas vistas en clase.

Conocimientos básicos de ilustración y morfología de plantas y/o insectos.

Nociones básicas de ilustración.

Asistencia, Puntualidad y Participación en clase (10%); Proyecto en clase (40%); Proyecto Final (50%)

Módulo 1:

1.- Antecedentes e Introducción a la Ilustración Científica y Naturalista (María Teresa Jiménez Segura-3 hrs).

2.- Introducción a la morfología de plantas y visita al herbario (Itzi Fragoso-6 hrs).

3.- Introducción a la morfología de grupos representativos de insectos (Viridiana Vega-3hrs)

4.- Visita a la colección entomológica y métodos para adquirir imágenes (Viridiana Vega Badillo y Luis Ibarra-3 hrs)

Módulo 2

1.- Cuaderno de campo, toma de datos e importancia del material para ilustración (Teresa Jiménez y Luis Ibarra-3hrs)

2.- Grafito y tinta (Teresa Jiménez y Luis Ibarra-3hrs).

3.- Técnicas tradicionales y aplicadas a la ilustración contemporánea (Carlos Ortega Contreras [Balamoc]-3 hrs).

4.- Ilustración entomológica (Aldo Domínguez-3hrs).

5.- Ilustración digital (Alberto Guerra-3hrs).

Módulo 3:

1.- Escaneo y limpieza de imágenes (Viridiana Vega, Teresa Jiménez y Luis Ibarra-3 hrs).

2.- Proyecto Final (Viridiana Vega, Teresa Jiménez y Luis Ibarra-12 hrs).

Requerimientos equipo y material (los materiales a utilizar se especificarán en la primer sesión).

1.- Lápices de grafito (lápices de diferentes durezas, tentativamente 2H, HB, 2B, 4B, 6B)

2.- Rapidografos y/o estilógrafos desechables o reutilizables (0.005, 0.01, 0.02).

3.- Papeles de diferentes gramajes (Opalina de 200 grs, Canon o Fabriano de 90 grs).

4.- Borrador blanco y/o moldeable.

5.- Sacapuntas.

6.- Cutter.

7.- Papel milimétrico.

8.- Papel albanene.

9.- Cuaderno p/bitácora y cuaderno de campo.

10.- Computadora y software para procesamiento de imágenes.

Que el estudiantado: 

1) Conozca y comprenda las características de las corrientes pedagógicas relevantes para relacionarlas con la comunicación, socialización y transferencia del conocimiento científico. 

2) Conozca, comprenda y aplique los métodos y técnicas didácticas que pueden incluirse en el diseño y planeación instruccional de cursos formales, así como los elementos que se requieren para la estructuración de talleres y otras formas de educación social y mixta. 

3) Conozca y comprenda los diferentes espacios y medios de aprendizaje y difusión en los que se interactúa con los diferentes actores sociales. 

4) Adquiera y aplique  conocimientos, herramientas y habilidades generales para el desarrollo de productos relevantes en la Comunicación Pública de la Ciencia. 

5) Conozca y comprenda las bases de la investigación y el trabajo transdisciplinario y su relevancia como estrategia metodológica para el abordaje de diversos contextos y actores sociales. 

6) Conozca y comprenda la importancia del uso adecuado de la inteligencia artificial en los procesos formativos, así como sus implicaciones presentes y futuras.

El curso se desarrollará aplicando la metodología de taller, a través de la cual abordaremos los contenidos teóricos para posteriormente promover el trabajo individual y en equipo para llevar a la práctica los conocimientos adquiridos. 

El desarrollo del curso se organiza en cuatro  momentos principales que se abordarán en el lapso de cuatro semanas a través de sesiones teórico-prácticas (cinco sesiones por semana). El primer momento (semanas 1 y 2 del curso) corresponde al bloque de contenido en Educación donde se abordarán los objetivos específicos 1 y 2. El segundo momento (semanas 3 y 4) constituye el bloque temático correspondiente a Comunicación Pública de la Ciencia que corresponde a los objetivos específicos 3 y 4. El tercer momento (semana 4) se relaciona con el bloque de contenido que refiere al trabajo transdisciplinar y que corresponde al objetivo específico 5, así como a lo referente al uso de la inteligencia artificial que arañe al objetivo específico 6.Durante el transcurso de las sesiones desarrollaremos abordajes teóricos - conceptuales y metodológicos , donde plantearemos los temas a través de lecturas que serán compartidas con los estudiantes antes de cada sesión . Durante la sesión, los coordinadores y los docentes invitados desarrollarán cada tema a través de presentaciones y breves recapitulaciones de cada lectura que serán reforzadas en la parte final de la sesión, generando debates desde un enfoque participativo guiado sobre el desarrollo del tema. Finalmente, el curso se cierra con un cuarto momento (semana 4) que incluye sesiones de presentación y retroalimentación de los productos finales que cada estudiante desarrolla en educación y comunicación pública de la ciencia con una primera aproximación a perspectivas transdisciplinares .  

Esta información se detalla en la sección Contenido Temático.  

• Ser estudiante de Maestría o Doctorado . 

• Disponibilidad de tiempo para atender íntegramente la carga académica del curso. 

• Especialmente sugerido para quienes estén o vayan a desarrollar un proyecto de investigación que incluya actividades educativas o de difusión con impacto social. 

• Gusto e interés por la docencia y el trabajo con grupos o comunidades. 

• Gusto o interés de abordar e incursionar en espacios y momentos educativos y de Comunicación Pública de la Ciencia . 

Se considerarán tres etapas de evaluación , donde cada una aporta una tercera parte de la evaluación de cada criterio (ver detalle de los criterios de evaluación y su correspondiente porcentaje de la calificación final en la siguiente tabla) : (1) diagnóstica , al inicio del curso; (2) continua , a lo largo del curso y considerando asistencia, participación, trabajos de clase y tareas; y (3) sumativa , al final del curso mediante la entrega y presentación oral del diseño de una planeación, secuencia didáctica, carta descriptiva de un taller o del producto de difusión de su elección (Se adjunta Rúbrica de Evaluación para cada producto sugerido , así como la Rúbrica de Evaluación para la presentación de los productos finales ).

Criterios de evaluación:

Asistencia  (para tener derecho a la evaluación, cada alumno deberá asistir al menos al 80% de las sesiones)

Participación (se evaluará mediante la entrega de textos diarios (apuntes de cada sesión), trabajos de clase y entrega de tareas) 20%

Producto final (ver detalles en cada rúbrica de evaluación) 60%

Presentación final (ver detalles en la Rúbrica de Evaluación) 20%

TOTAL 100%

Contenido temático

Bloque temático                                          Temas y subtemas 

Bloque 1 (30 horas)           

(Primer momento)

Educación 

1.1 Educación 

• Enfoques/modelos pedagógicos 
• Teorías del aprendizaje 
• Espacios/entornos de enseñanza y aprendizaje 

• 1.2  Diseño instruccional en la educación formal 

  • Características de la educación formal 
  • Currículo y plan de estudios 
  • El plan de clase como herramienta educativa 
  • Metodologías activas 
  • Estrategias de enseñanza y aprendizaje 
  • Evaluación 
  • Experiencias inspiradoras: Acercándose al Jardín Botánico (Fairchild y Jardín Etnobiológico) desde la Nueva Escuela Mexicana.

1.3  Diseño instruccional en educación social y mixta (informal y no formal) 

• Características de la educación social y mixta  
• El contexto en los espacios sociales  
• La carta descriptiva como herramienta educativa  
• Metodologías de enfoque comunitario 
• Estrategias de aprendizaje dialógico (visita interpretativa, taller, grupo focal, diálogo, debate) 
• Evaluación
• Educación ambiental  
• Ética en la educación 
• Sesión de recapitulación  
• Experiencias inspiradoras: Estrategias de investigación y comunicación social.
• Recapitulación del 1er momento  

Bloque 2 (18 horas)

(Segundo momento) 

Comunicación pública de la ciencia 

2.1 Comunicación Pública de la Ciencia 

• Todo lo que no sabías sobre el CPC (qué implica, qué integra, por qué y para qué comunicamos ciencia, qué ciencia comunicamos). 
• Modelos de comunicación. 
• Identificación por instituciones. 

2.2 Diseño general de estrategias de comunicación. 

• Objetivos del PCCh 
• De los medios como fin a los medios como herramienta (medios tradicionales, selección y análisis de audiencias, el mensaje, planificación) 
• Herramientas para la evaluación. 
• Otras herramientas para comunicar (STEM, gamificación, artes, senderos interpretativos, medios no tradicionales). 

2.3 Divulgación por escrito 

• Formatos básicos de difusión escrita (artículos, libros; algunos formatos de literatura, periodismo y diseño).
• Recapitulación del 2o. momento 

Bloque 3 (9 horas)

(Tercer momento)

La transdisciplina en contextos y espacios de investigación científica, educación y comunicación pública de la ciencia 

3.1 Nociones teóricas y conceptuales de la investigación transdisciplinaria 

• Revisión de términos de referencia y glosario conceptual  
• Conceptos clave de la investigación transdisciplinaria 
• Paradigmas de yuxtaposición de la investigación transdisciplinaria e interdisciplinaria 
• Integración de epistemologías, cosmovisiones y comunidades interpretativas 

3.2 Métodos y paradigmas en la educación popular  

• La investigación como agente constitutivo de propuestas educativas  
• Identificación de temas generativos, percepciones y expectativas socioculturales 
• Investigación temática (aspecto educativo) e investigación-acción-participativa (aspecto sociológico) 
• Procesos participativos en la investigación, la educación y la comunicación pública de la ciencia   
• La sistematización de experiencias como herramienta metodológica para democratizar los conocimientos y habilidades tradicionales 
• Entre la educación popular y la investigación alternativa: formar sujetos para y en la transformación social  

3.3 Investigación y educación interdisciplinaria y transdisciplinaria 

• Política educativa y educación popular: las contribuciones de Paulo Freire a la investigación y la educación interdisciplinaria 
• La investigación transformadora como capacidad humana: Principios de investigación y aprendizaje inter y transdisciplinario desde el trabajo conceptual  
• Investigación Acción Participativa (IAP) como vínculo entre la academia y los movimientos sociales con acciones concretas de transformación 
• Alcances y limitaciones de la inteligencia artificial en la educación
• Experiencia inspiradora: Cuenca del Alto Atoyac: Estrategias de investigación social.

Bloque 4 (3 horas)

(Cuarto momento) 

Presentaciones finales, retroalimentación y recapitulación 

• Presentaciones finales: Apropiación, vinculación y aplicación de los contenidos del curso en los productos finales de los estudiantes
• Recapitulación participativa y aprendizaje del curso 

Los objetivos de este curso son que el alumno: 1. Conozca y asimile las bases teóricas, conceptuales y metodológicas de la macroecología. 2. Integre las bases ecológicas, biogeográficas y evolutivas de la macroecología. 3. Entienda y cuantifique los patrones macroecológicos más relevantes. 4. Sea capaz de identificar mediante inferencia y deducción los posibles procesos responsables por los patrones macroecológicos. 5. Comprenda las aplicaciones de los enfoques macroecológicos para la conservación biológica, la ecología humana y la sustentabilidad.

Teórico-Práctica: Aulas teóricas y ejercicios prácticos

No ser alumnos de nuevo ingreso a la maestría. 

-Conocimiento básico de R

-Conocimiento básico de SIGs (sistemas de información geográfica)

Evaluación de un trabajo grupal (2-3 personas) a entregarse una semana después del curso.

1. La perspectiva macroecológica

• Antecedentes de la macroecología
• Macroecología antes de la macroecología
• Biodiversidad como sistema complejo

2. Datos e información macroecológica básica

• Áreas de distribución de las especies
• Informática de la biodiversidad
• Lagunas del conocimiento
• Estructura de datos macroecológicos
• *Ejercicio práctico en R

3. Principales patrones macroecológicos

• Gradientes geográficos de biodiversidad
• Escalas espaciales
• Relación entre diversidad y distribución
• Reglas ecogeográficas
• *Ejercicios prácticos en R

4. Enfoques para el estudio de gradientes geográficos de biodiversidad

• Enfoque correlativo entre ambiente y biodiversidad
• Ejemplos de enfoques correlativos en otras propiedades de la biodiversidad (e.g. redes ecológicas)
• Modelos de simulación en Macroecología
• *Ejercicios prácticos en R

5. Macroevolución y biodiversidad

• Microevolución vs Macroevolución
• Filogenias e información evolutiva
• Procesos macroevolutivos y la generación de patrones de biodiversidad en el tiempo
• Causas histórico-evolutivas de los gradientes de biodiversidad

6. Enfoques evolutivos para estudiar patrones de biodiversidad

• Señal y estructura filogenética
• Filogenética de comunidades
• Conservación filogenética de nicho
• Métodos comparativos filogenéticos

7. Macroecología y Macroevolución

• Filogenias en el espacio geográfico
• Distribuciones geográficas en la filogenia
• Espacio y tiempo en la generación de patrones de biodiversidad

8. Aplicaciones de la macroecología y macroevolución en la conservación biológica.

• Macroecología/Biogeografía de la conservación
• Lagunas del conocimiento
• Patrones de riqueza, endemismo y amenaza
• Delimitación de hotspots y coldspots de biodiversidad
• Macroecología humana

• Comprender las bases teóricas del origen y evolución de la fitofagía en los insectos terrestres, así como los aspectos fundamentales de su historia natural y ciclos de vida, en relación con la explotación y uso de los recursos.
• Conocer los sistemas y técnicas de detección y monitoreo poblacional de especies fitófagas, así como los métodos convencionales y biológicos utilizados para el manejo de especies nocivas en sistemas productivos.
• Identificar los caracteres morfológicos y adaptativos relacionados con la fitofagia en los insectos terrestres, destacando algunas familias representativas.

El curso se llevará a cabo de manera presencial en las instalaciones del Instituto de Ecología AC (INECOL) en su sede principal en Xalapa, Veracruz (México). Es un curso intensivo con una duración de 12 días efectivos de trabajo continuo, por lo que se requiere de tiempo completo.

El curso tiene un componente mixto, en una proporción equivalente de sesiones teóricas (50%) y prácticas (50%), de tal forma que el estudiante adquiera los conocimientos básicos relacionados con las adaptaciones biológicas y evolutivas de los insectos fitófagos, conozca las técnicas relacionadas con su monitoreo y manejo, además de adquirir las destrezas suficientes para el reconocimiento de los principales grupos taxonómicos que viven en las plantas.

El contenido está dividido en 4 módulos temáticos sobre: 1) Ecología y evolución; 2) Biología y métodos de identificación; 3) Métodos de monitoreo poblacional; y 4) Agricultura y manejo de especies nocivas.

En el aula será impartida la teoría básica de las interacciones antagonistas insecto-planta, su ecología, monitoreo y manejo. En el laboratorio, se presentarán estudios de caso complementados con sesiones prácticas para la observación y reconocimiento de algunos grupos relevantes. Adicionalmente, los estudiantes desarrollarán ensayos temáticos, los cuales serán presentados y discutidos en el grupo.

En el laboratorio se llevarán a cabo sesiones prácticas para el reconocimiento de los rasgos morfológicos de relevancia taxonómica en grupos selectos de fitófagos, además de ejemplos demostrativos para la identificación de especímenes de algunas familias representativas. Al final del curso se hará una evaluación de los conceptos teóricos y prácticos, para reforzar el aprendizaje y comprensión efectiva de los estudiantes.

La literatura básica de apoyo para las sesiones teóricas y prácticas será proporcionada por el coordinador del curso a los alumnos inscritos. El cupo mínimo de alumnos inscritos será de 4 hasta un máximo de 10 estudiantes.

Se requiere del uso del Aula Laboratorio del Posgrado institucional que cuenta con espacios de laboratorio suficientes, además de estereomicroscopios en buen estado para su asignación individual por estudiante.

El curso está dirigido principalmente a personas que cursan estudios de Posgrado en alguna área de las Ciencias Naturales, de preferencia con conocimientos básicos de entomología e interacciones ecológicas. Se aceptan estudiantes de posgrado de otras instituciones que cubran los requisitos señalados por el posgrado del INECOL

Conocimientos básicos de entomología e interacciones ecológicas

Participación y desempeño en las sesiones teóricas y prácticas durante todo el curso (40%)

Presentación de ensayos temáticos asignados para el curso (Presentación oral y escrita) (30%)

Examen final práctico de identificación de especímenes preservados (30%)

Introducción del curso: Presentación de profesores y objetivos; Criterios de evaluación y dinámica didáctica; Presentación de participantes.

Módulo 1. Ecología y Evolución (10 hrs)

Sistemática y evolución de de la fitofagia en los ecosistemas terrestres; Origen de la fitofagia y adaptaciones alimentarias en los insectos herbívoros; Interacciones antagonistas insecto-planta (morfología, fisiología, rasgos adaptativos); Ciclos de vida (voltinismo, estacionalidad); Explotación de recursos y uso del nicho.

Módulo 2. Biología y Métodos de Identificación en Insectos Fitófagos (40 hrs)

Biología e historia natural; Morfología básica e identificación de familias representativas de los principales ordenes de insectos fitófagos (Coleoptera, Diptera, Orthoptera, Lepidoptera, Hemiptera).

Módulo 3. Métodos de Monitoreo Poblacional (10 hrs)

Sistemas de monitoreo poblacional de insectos fitófagos (unidades de muestreo, distribución espacial); Métodos directos en plantas (flores, frutos, hojas); Métodos indirectos (uso trampas y atrayentes).

Módulo 4. Agricultura y Manejo de Especies Nocivas (10 hrs)

Métodos de evaluación para el manejo de plagas en sistemas productivos; Métodos convencionales (labores culturales, uso de plaguicidas); Métodos biológicos (uso de agentes de bio-control); Método autocida (Técnica del insecto estéril).

Que el estudiante conozca y aplique correctamente las pruebas estadísticas paramétricas (z, t, regresión y correlación, análisis de varianza, comparaciones múltiples) y no paramétricas (re-muestreo, frecuencias, conteos, ordinales).

En cada sesión el profesor presenta las bases teóricas del tema y utiliza un conjunto de datos con el fin de ejemplificar la prueba o análisis de interés. El conocimiento adquirido se refuerza con la solución de ejercicios en clase y otros para resolver en casa, con la posterior discusión en clase. Se emplea la dinámica de aprender haciendo, en la que los procedimientos que se exponen en una primera clase, se reafirman gradualmente durante las sesiones de práctica que se incluyen en las clases posteriores. Se usa un enfoque flexible para elegir las técnicas de resolución de los ejemplos. Se introduce al programa R y se enseña cómo resolverlos con ese programa.

Es un curso intensivo. Las clases son impartidas diariamente por 1 profesor durante 4 horas. Después de cada sesión diaria, los alumnos resuelven ejercicios en casa, normalmente en 4 horas.  

Conocimiento de álgebra y manejo de hojas de cálculo o R.

Conocer la naturaleza y estructura de varias pruebas estadísticas y desarrollar ejercicios numéricos.

Cada módulo se evalúa separadamente y la calificación final del curso es el promedio aritmético de las evaluaciones de cada módulo. Los Criterios de Evaluación por Módulo son: Módulo I: Cinco tareas que se califican por puntos de acuerdo al grado de dificultad de cada ejercicio. La calificación del módulo es un promedio ponderado de 5 tareas. Módulo II: Resolución de tareas diarias y examen escrito final de resolución de ejercicios. La escala de calificación del módulo es del 1 al 10. Módulo III: Resolución de tareas diarias y examen escrito final de resolución de ejercicios. La escala de calificación del módulo es del 1 al 10. Módulo IV: Resolución de tareas diarias y examen escrito final de resolución de ejercicios. La escala de calificación del módulo es del 1 al 10.

MÓDULO I. INTRODUCCIÓN A R, PROBABILIDAD Y PRUEBA DE t

Rosario Landgrave.

7 clases, 4 horas = 28 horas.

Clase 1. Temas selectos de matemáticas e introducción a R.

Clase 2. Temas selectos de matemáticas e introducción a R.

Clase 3. Estadística Descriptiva.

Clase 4. Probabilidad Teórica.

Clase 5. Funciones de densidad de probabilidad.

Clase 6. Teorema del límite central.

Clase 7. Prueba de z y prueba de t

MÓDULO II. REGRESIÓN Y CORRELACIÓN LINEAL SIMPLE

Oscar Briones.

8 Clases, 4 horas = 32 horas.

Clase 1. Modelo, objetivos y usos de la regresión lineal. Supuestos del modelo. Modelos I y II. Estimación de parámetros por mínimos cuadrados y derivación del coeficiente de regresión (b). Cálculos básicos y ecuaciones principales para obtener el modelo de regresión. 

Clase 2. Sesión práctica con el uso del programa R. Regresión lineal con repeticiones. Pruebas de hipótesis. Análisis de varianza de la regresión. Coeficiente de determinación (r2).

Clase 3. Pruebas de t sobre b y la ordenada (a). Equivalencia entre análisis de varianza y prueba de t para b. Estimación de intervalos de confianza para a, b y valores esperados. 

Clase 4. Comprobación de la adecuación del modelo de regresión: residuales ordinarios, escalados y datos atípicos, prueba de falta de ajuste.

Clase 5. Transformaciones para corregir inadecuaciones del modelo. Funciones linealizables. Predicción inversa.

Clase 6. Comparación entre líneas de regresión. Correlación lineal simple (r). Prueba de hipótesis. Estimación de intervalo de confianza. Comparación entre coeficientes de correlación. Relación matemática entre b, r y r2.

Clase 7. Sesión práctica con el uso del programa R. Modelo II de regresión lineal (ambas variables sujetas a error): método de los 3 grupos. Comparación entre modelos I y II de regresión lineal simple. Relación entre regresión y correlación paramétrica.

Clase 8. Examen.

MÓDULO III. ANÁLISIS DE VARIANZA Y DISEÑO EXPERIMENTAL

Miguel Equihua.

9 Clases, 4 horas = 36 horas.

Clase 1. Diseño de experimentos y ANOVA 1 vía.

Clase 2. Comparaciones múltiples. Transformaciones.

Clase 3. ANOVA 2 vías. Factoriales. Interacciones.

Clase 4.  Efectos fijos aleatorios y mixtos.

Clase 5. Diseños con restricciones a la aleatorización I: Diseño en bloques completamente aleatorizados. 

Clase 6. Diseños con restricciones a la aleatorización II: Diseños anidados.

Clase 7. Diseños con restricciones a la aleatorización III: Parcelas divididas.

Clase 8. Diseños con restricciones a la aleatorización IV: Medidas repetidas.

Clase 9. Examen.

MÓDULO IV. ANÁLISIS “NO PARAMÉTRICOS” Y RE-MUESTREO

Salvador González de León.

6 Clases, 4 horas = 24 horas.

Clase 1. Introducción y visión general (2 h); Análisis de re-muestreo y generación de distribuciones adhoc (2 h).

Clase 2: Análisis de re-muestreo y generación de distribuciones adhoc (cont.).

Clase 3: Análisis de frecuencias o conteos.

Clase 4: Análisis de frecuencias o conteos (cont.).

Clase 5: Análisis basados en transformaciones ordinales; examen a casa.

Clase 6: Revisión de examen a casa (2 h); Introducción a modelos lineales generalizados (2 h).

Discutir los conceptos que sientan las bases de la ecohidrología como disciplina integrativa. Examinar detalladamente los procesos y reservorios del ciclo del agua, y el rol de la vegetación y el suelo en cada uno de éstos. Examinar patrones y procesos ecológicos que pueden ser explicados por mecanismos hidrológicos. Conocer métodos de cuantificación y modelaje de procesos ecohidrológicos.

Se impartirán clases teóricas en formato de conferencia magistral y discusiones grupales en modalidad híbrida presencial-virtual sincrónica (virtual en caso de estudiantes que no residan o puedan estar de manera presencial en Xalapa). Otras actividades serán asincrónicas que luego se discutirán grupalmente en modalidad sincrónica: material requerido de lectura, seminarios pregrabados por profesores invitados o videos de seminarios, y ejercicios. 

Estudiantes que estén cursando un posgrado en ciencias o profesores. Estudiantes de último año de licenciatura en Ciencias de la Tierra, Ambientales, Biológicas o afines serán considerados con recomendación del director de tesis.

Experiencia en el manejo de hojas de cálculo. Alto nivel de comprensión de lectura en inglés. Motivación para aprender en comunidad y entorno virtual.

Búsqueda de literatura primaria (científica), comprensión de lectura en inglés. Habilidad de comunicarse efectivamente por escrito y oralmente. Habilidad de trabajar en equipo multidisciplinario. Destrezas informáticas básicas. 

Participación en discusiones de lecturas y seminarios pregrabados asignados previo a cada clase sincrónica (40%), ejercicios de cómputo fuera de clase (40%) y ensayo escrito (20%). Asistencia mínima del 90% a las actividades sincrónicas.

1) Introducción, Ecohidrología como ciencia integrativa. 2) Ciclo hidrológico: concepto de sistema, procesos, reservorios, tiempo de residencia, escalas, trazadores isotópicos e hidrogeoquímicos. 3) Evaporación, condensación, formación de nubes y precipitación. 4) Partición de la lluvia e intercepción por la superficie. 5) Relaciones hídricas de las plantas y transporte de agua en el continuo suelo-planta-atmósfera. 6) Suelo y agua: características del suelo, disponibilidad y almacenamiento de agua en el suelo, infiltración. 7) Respuesta hidrológica de cuencas y balance hídrico; caudal ecológico y alteraciones antropogénicas al régimen del caudal 8) Efectos del cambio de cobertura/uso del suelo en la hidrología y clima, a nivel local, cuenca, regional y global. 9) Efectos de la variabilidad hidrológica en los patrones y procesos ecológicos (distribución y estructura de ecosistemas, productividad primaria): 9.1 Ecohidrología de ecosistemas de montaña y afectados por neblina. 9.2) Ecohidrología de humedales. 9.3) Ecohidrología de ecosistemas áridos y semiáridos. 10) Ecohidrología como ciencia para resolver problemas relacionados con el agua: escasez, exceso, mala calidad.