1. Discusión sobre las aproximaciones teóricas y prácticas para el estudio de la diversidad funcional.
2. Revisión e implementación de los protocolos para definición de grupos (o entidades) funcionales.
3. Revisión e implementación de métodos analíticos e inferenciales para la estimación y evaluación de la estructura funcional a nivel de comunidad.
4. Ofrecer un espacio para abordar inquietudes específicas con conjuntos de datos de los asistentes al seminario.

El seminario se desarrollará con un flujo de trabajo mixto que abarcará tres actividades: (1) teoría, (2) práctica y (3) secciones de discusión. Las dos primeras actividades se desarrollaron los días lunes, miércoles y viernes. La tercera actividad se desarrollará los martes y jueves. El días viernes 12 de septiembre, los asistentes deberán presentar un seminario de 10 minutos para compartir sus experiencias con el análisis de sus datos (según lo abordado en el seminario). Para las secciones de discusión se tendrá la participación de tres conferencistas invitados que compartirán sus experiencias en estudios de diversidad funcional con insectos en escala local y de paisaje, y la modelación de diversidad funcional anfibios en escala regional y global; por otro lado se pedirá a los asistentes que busquen uno o dos artículos que aborden alguno de los siguientes temas a través de casos de estudio: (i) comparación entre métodos convencionales vs. serie de Hill para evaluación de diversidad funcional; (ii) casos de estudios sobre aplicación de diversidad beta-funcional; (iii) casos de estudio que implementen la aproximación RQL y (iv) integración de análisis de diversidad funcional y redes de interacción. La secciones prácticas se basan en la revisión y uso de scripts en R.   

(1) Manejo básico de hojas de Excel; (2) Conocimientos básicos en el uso de R; (3) Conocimientos en ecología de comunidades; (4) Conocimientos básicos en estadística inferencial; (5) Conocimientos básicos en métodos de estadística multivariada.

Disposición para lectura crítica de artículos científicos y para discusión abierta, constructiva y objetivo, sin miedo a las matemáticas.

(1) Participación en las secciones teóricas y prácticas: 10%

(2) Participación activa en las secciones de discusión: 30%

(3) Seminario final: 60%

Semana 1 (1 - 5 de septiembre)

1.Diversidad funcional vs diversidad rasgos: discusión. Rasgos funcionales (Conceptos). Rasgo efecto y respuesta. Literatura base: McGill et al. (2006); Viole et al., (2007); Petchey et al., (2009); Weiher et al. (2011). 

2. Facetas de diversidad funcional. Literatura base: Villeger et al., (2008); Mouchet et al., (2010); Mason et al., (2013).

3. Medidas convencionales: matrices datos, medidas de distancia y modelos nulos (CWM). Literatura base: Villeger et al., (2008); Mouchet et al., (2010); Mason et al., (2013).

4. Primer caso de estudio, conferencista invitado (martes 4 de septiembre). 

Semana 2 (8 - 12 de septiembre)

5. Marco unificado de estimación: número efectivo de grupos funcionalmente distintos (^qD_fun). Literatura base: Chiu & Chao (2014); Chao et al., (2014, 2019); Olman et al., (2019).

6. Estimaciones de diversidad: iNEXT.3D, FD, mFD. Literatura base: Chao et al., (2021, 2023).

7. Respuesta a filtros ambientales. Estructura funcional (trait syndromes)-RQL. Literatura base: Dray and Legendre (2008); Mouillot et al., (2013); Dray et al., (2014).

8. Dos casos de estudio (anfibios en escalas regional y global-martes 9 de septiembre-; abejas nativas en escala local-martes 9 de septiembre-). Conferencistas invitados.

9. Seminarios finales presentados por asistentes al seminario (10 minutos por seminario, sin contar sección de preguntas y discusión).    

1. Introducir los conceptos básicos de la redacción de artículos científicos en inglés 2. Practicar la redacción científica en inglés para cada sección de un artículo 3. Capacitar los estudiantes en los procesos de publicación (desde el envío hasta la corrección de pruebas de galera) 4. Discutir sobre las experiencias en la revisión, edición y publicación de artículos 5. Preparar estudiantes para las responsabilidades como árbitro y editor de revistas

El curso está diseñado para un máximo de 15 estudiantes de cualquier semestre, preferiblemente de semestres avanzados que ya están escribiendo su tesis o un artículo en inglés. Cada día se darán clases teóricas (1 hora) seguidos por ejercicios prácticas de lectura, redacción, revisión y edición (2 horas) y la exposición y discusión de sus trabajos (1 hora). En dos ocasiones se invitarán profesores de Posgrado para discutir sobre sus experiencias en la redacción, publicación, revisión y edición de artículos científicos.

Conocimientos básicos del inglés. Un fuerte compromiso para mejorar la redacción y lectura de textos en inglés.

Buenos conocimientos del inglés y del manejo de software de texto (Word) y de presentaciones (Powerpoint); trabajo actual en la publicación de artículos científicos.

La participación en el curso, un trabajo práctico individual (ensayo escrito) y un trabajo en grupo (ensayo escrito y revisado varias veces) proporcionan cada uno 33.3% a la evaluación final.

Día 1 1. Conceptos básicos de redacción: ¿Cuándo, dónde, cómo, para quién? 2. ¿Qué es un artículo científico? Estructura IMRAD 3. Inglés como idioma internacional de las ciencias 4. Revistas (Prestigio, impacto, tiempos de revisión, porcentaje de rechazo) 5. Herramientas (traductores, diccionarios, bibliografía, manuales) 6. Ejercicios: Redacción de un primer ensayo libre, Ejercicio de lectura 7. Deberes: Lectura de un texto favorito Día 2 8. Errores típicos de redacción en inglés 9. Planeación y manejo de tiempo (Calendarización de pasos), (Writing an article in 12 weeks) 10. Responsabilidades del autor (Acuerdo de autorías, datos originales, plagios) 11. Derechos de autor, autorías (criterios, orden, acuerdos), direcciones, permisos de reproducción 12. Revisión de bibliografía sobre el tema, buscadores, bases de datos, bibliotecas 13. Ejercicio: Formular hipótesis y defenderla con argumentos, Ejercicio de conversación 14. Deberes: Diseñar un plan de trabajo y redactar un primer borrador Día 3 15. Estructura de párrafos, Vinculación de párrafos 16. Revisión de deberes 17. Sección de métodos 18. Sección de agradecimientos (colegas, técnicos, revisores, becas, apoyos otorgados) 19. Citación de bibliografía en el texto 20. Ejercicios: Revisión de varios artículos, Redacción de una sección de métodos y de agradecimientos basado en ejemplos. 21. Deberes: Revisión mutua de borradores Día 4 22. Ritmo del texto escrito, puntuación 23. Sección de resultados I 24. Ejercicios: Revisión de varios artículos, Redacción de una sección de resultados basado en ejemplos 25. Deberes: Redacción de sus resultados de tesis Día 5 26. Sección de resultados II 27. Revisión de deberes 28. Tablas y figuras (Reglas para leyenda, símbolos, colores, software) 29. Ejercicios: Revisión de varios artículos, Redacción de leyendas de tablas y figuras basado en ejemplos 30. Deberes: Diseño de tablas, figuras y leyendas con ejemplos Día 6 31. Palabras que se deben evitar 32. Revisión de deberes 33. Secciones de discusión y de bibliografía 34. Formatos de bibliografía (Tipos de formatos, Software) 35. Ejercicios: Revisión de varios artículos, Redacción de una sección de discusión basado en ejemplos, Formatear una sección bibliográfica según un sistema de citación 36. Deberes: Búsqueda de ejemplos de buena y mala redacción Día 7 37. 30 pecados de estilo 38. Resumen (problema, métodos, resultados, discusión, conclusión, límite de palabras, abreviaciones) 39. Sección de introducción (problemas, antecedentes, métodos, objetivos, preguntas, hipótesis) 40. Titulo (número de palabras, especificidad, palabras clave, sintaxis, abreviaciones) 41. Ejercicios: Revisión de varios artículos, Revisión de resúmenes, Mejora de títulos, Redacción de un resumen basado en ejemplos Día 8 42. Marcadores de edición 43. Redundancias 44. Proceso de publicación (normas, guías de autores, formatos, carta de envío, carta de recepción, decisión, revisión, corrección, pruebas de galera, costos, sobretiros) 45. Ejercicios: Redacción de una carta de envío, reenvío, corrección de pruebas de galera 46. Profesor invitado: Dr. Victor Bandala 47. Deberes: Edición de un texto escrito Día 9 48. Presentación de libros leídos durante el curso 49. Expresiones confundidas 50. Actividades y responsabilidades como árbitros y editores 51. Ejercicios: Revisión y redacción de un documento de arbitraje, análisis de una carta de aceptación y una carta de rechazo 52. Entrevista con Profesor invitado 53. Deberes: Redacción de un ensayo libre Día 10 54. Presentación de libros leídos durante el curso 55. Revisión de deberes 56. Ejercicios: Redacción de un ensayo libre, Revisión de documentos en conjunto. Ejercicio de lectura 57. Discusión final sobre el curso: Expectativas y necesidades

1) Dominar la terminología relacionada a un experimento de secuenciación; 2) Reconocer el tipo de archivos generados en una corrida de secuenciación y identificar la información que contienen; 3) Familiarizarse con la linea de comandos dentro del ambiente LINUX; 4) Entender los algoritmos computacionales empleados para el ensamblado de genomas y transcriptomas; 5) Familiarizarse con software especializado para el ensamblado de genomas y transcriptomas.

El diseño del curso es teórico-práctico-reflexivo. A cada sesión práctica le antecede una sesión teórica en la que se discutirán los fundamentos esenciales para comprender cada uno de los pasos que se realizarán en los ejercicios. Después de cada sesión práctica, se realizará una sesión de discusión plenaria para interpretar los resultados obtenidos y analizar los resultados disponibles en bases de datos y en la literatura científica.

Contar con un equipo portátil de cómputo (laptop o netbook) con conexión a red (inalámbrica o ethernet) y preferentemente con sistema operativo base UNIX (macOS, Ubuntu, CentOS o alguna otra distribución de Linux). En caso de no contar con alguno de estos sistemas operativos en su equipo, el alumno deberá asistir a una sesión previa al inicio del curso para que se le instale un sistema adecuado.

Capacidad de pensamiento crítico, trabajo por cuenta propia y destrezas básicas para el trabajo por computadora.

Asistencia y participación 20%, Ejercicios en clase 40%, Evaluaciones parciales y final 40%

1. Introducción a la bioinformática y a los sistemas UNIX. 2. Estructura de los genomas eucariotes y procariotes; 3. Genes, DNA repetitivo y eventos de duplicación de genomas; 4. Las plataformas de secuenciación NGS; 5. Tipos de librerías para secuenciación y sus características; 6. Estándares de calidad y filtrado de secuencias; 7. Algoritmos utilizados para el ensamblado de un Genoma; 8. Predicción de modelos génicos en organismos eucariotes y procariotes; 9. Anotación de genomas; 10. Algoritmos utilizados para el ensamblado de un transcriptoma; 11. Análisis de expresión diferencial; 12. Metagenómica; 13. Genómica poblacional.

1. Conocer la diversidad de microorganismos, incluyendo las arqueas, los hongos y las bacterias, así como los principales fila de éstas últimas. 2. Entender los papeles que desempeñan los microorganismos presentes en el ambiente (agua, suelo) en procesos ecosistémicos como el ciclo de elementos y nutrientes, la degradación de contaminantes o el secuestro de carbono. 3. Conocer las principales teorías sobre el origen de los microorganismos, y de la vida misma. 4. Obtener bases teóricas sobre ecología microbiana. 5. Conocer los problemas y las oportunidades asociados a los métodos empleados en la microbiología ambiental, como el muestro, la enumeración, la identificación, el cultivo, y los avances en las tecnologías moleculares. 6. Evaluar la importancia de las interacciones plantas – microorganismos (microorganismos rizosféricos, micorrizas, simbiosis fijadoras de nitrógeno – leguminosas) para la productividad vegetal. 7. Saber acceder a la literatura científica relevante, y poder desarrollar escritos científicos, escritos de divulgación, y presentaciones orales sobre problemáticas relacionadas con la microbiología ambiental.

Los profesores expondrán los temas del curso ante la clase. Los estudiantes realizarán lecturas de literatura científica sobre microbiología ambiental y se tendrán sesiones de discusión. También los estudiantes realizarán ensayos sobre algunos temas, así como un trabajo final. . Se realizarán dos sesiones de práctica en el Laboratorio de Microbiología Ambiental del Campus III del INECOL.

Los estudiantes requieren conocimientos básicos de biología para tomar este curso. Tendrán el 100% de descuento en el pago, estudiantes externos de instituciones educativas que tengan convenio vigente con el INECOL. 

Ninguna.

asistencia y participación durante las clases (10%), exámenes después de cada sesión (20%), presentación sobre un tema de relevancia para el curso (30%), reportes de revisión de artículos (40%). 

1. Clasificación de los microorganismos 1.1. Taxonomía 1.1.1. Bacterias 1.1.2. Arqueas 1.1.3. Hongos 1.2. Filogenia 2. Las bacterias y el medio ambiente 2.1. Abundancia de bacterias en diferentes ambientes 2.2. Energía y metabolismo 2.2.1. Metabolismo aerobio 2.2.2. Metabolismo anaerobio 2.2.3. Fermentación 2.2.4. Asimilación de nutrientes 2.2.5. Fotosíntesis procariota 2.2.6. Quimiosíntesis 2.3. Biogeoquímica 2.3.1. Ciclo del Carbono 2.3.2. Ciclo del Nitrógeno 2.3.3. Ciclo del Fósforo 2.3.4. Ciclo del Azufre 3. Origen de la vida 3.1. Teorías sobre el origen de la vida 3.1.1. Sopa primigénea 3.1.2. RNA world 3.1.3. Metabolismo primero 4. Ecología microbiana 4.1. Concepto de especie 4.2. Genoma núcleo y genoma accesorio 4.3. Procesos de Especiación 4.4. Evolución en bacterias 4.4.1. Genética y genómica de poblaciones 4.4.2. Transferencia horizontal de genes 4.4.3. Evolución experimental 4.5. Ecología de Comunidades 4.5.1. Teorías de ensamblaje de comunidades (procesos neutros, históricos y deterministas) 4.5.2. Cooperación y competencia en comunidades microbianas 4.6. Postulado de Baas-Becking y críticas modernas 5. Herramientas metodológicas en microbiología ambiental 5.1. Muestreo y Aislamiento de cepas 5.1.1. Medios de cultivo 5.1.2. Técnicas de cultivo 5.1.2.1. Teoría del cultivo en lotes 5.1.2.2. Teoría del cultivo continuo 5.1.2.3. Teorías de la competencia en microorganismos 5.1.3. Fisiología microbiana 5.2. Detección de cepas 5.3. Identificación de microorganismos 5.4. Enumeración, medición de biomasa y actividad microbiana 5.5. Secuenciación 5.6. PCR cuantitativo 5.7. Metagenómica 6. Ambientes particulares 6.1. El suelo 6.2. El mar: La zona pelágica 6.3. Tapetes microbianos y estromatolitos 6.4. Chimeneas hidrotermales 6.5. Los tubos digestivos de los animales 6.6. Las zonas polares 7. Interacciones planta – microorganismos 7.1. Microorganismos de corteza, 7.2. Rizosfera 7.3. Micorrizas 7.4. Simbiosis leguminosas- Rhizobium, 7.5. Frankia 7.6. Control biológico. 8. Aplicaciones Biotecnológicas de microbiología ambiental 8.1. Agromicrobiología 8.2. Biorremediación de suelos contaminados 8.3. Tratamiento de aguas residuales

• Dominar comandos esenciales de MOSHPIT para control de calidad y filtrado de ADN huésped.

• Ejecutar ensambles de contigs y binning de MAGs dentro de MOSHPIT.

• Realizar clasificación taxonómica y anotación funcional de contigs/MAGs.

• Calcular métricas de diversidad alfa/beta y abundancia diferencial en R.

• Interpretar resultados bajo el marco de la Ecología Microbiana.

Curso presencial teórico-práctico. Cada sesión alterna explicación conceptual y ejercicios en computadora. Se trabajará con subconjuntos de datos públicos de microbioma para ajustarse a los recursos computacionales. Los estudiantes deberán traer laptop; el servidor ejecutará MOSHPIT vía SSH.

• Laptop con cliente SSH y navegador.

• Conocimientos básicos de biología molecular y edición de texto plano.

Ninguna obligatoria, pero preferentemente:

• Conceptos básicos de sistemas operativos GNU/Linux.
• Conocimiento elemental de R (cargar paquetes, manipular data frames y matrices).

• Tareas/prácticas: 30 %

• Examen teórico intermedio: 20 %

• Proyecto final: 50 %

1.-Infraestructura y QC de datos

a) Arquitectura de servidores Linux y MOSHPIT.
b) Control de calidad.
c) Filtrado de ADN del insecto.
d) Generación de reportes.

2.-Ensamble y binning con MOSHPIT

a) Ensamble con MEGAHIT.
b) Evaluación con QUAST.
c) Mapeo de lecturas a contigs.
d) Binning con MetaBAT2.
e) Evaluación de MAGs con BUSCO y filtrado de calidad.

3.-Anotación taxonómica y funcional

a) Construcción de BD Kraken2 y clasificación.
b) Predicción de genes (Prodigal) y búsqueda de ortólogos.
c) Extracción de anotaciones y perfiles funcionales.

4.-Ecología, estadística y visualización en R

a) Exportación de tablas a R.
b) Diversidad alfa/beta.
c) Análisis de abundancia diferencial.
d) Teoría ecológica aplicada al microbioma de insectos.
e) Presentación de resultados (PCoA, heatmaps, barplots).

Desarrollar las habilidades necesarias para poder realizar sus muestreos en campo de forma segura, esto lo realizaremos a través del aprendizaje en una experiencia vivencial de alto nivel y entrenamiento teórico-práctico.

Aprender la técnica de posicionamiento básico de trabajo: caminar en los brazos/ramas; instalación de puntos de anclaje y redirecciones.

Realizar inspecciones del árbol previas a la escalada conducida por un asistente.

Diferenciar entre el equipo apropiado para trepar a los árboles, y el equipo que es similar en apariencia, pero no adecuado para el soporte de vida en los árboles.

Las clases serán presenciales, el curso tiene una duración de 4 días, en modalidad intensivo 8 horas diarias. El 80% del curso será en campo aplicando las diferentes técnicas de ascenso. Los días de clase serán de lunes a jueves de 9:00 a 17:00 hrs. Las clases prácticas se realizarán en lugares cercanos al la sede de Pátzcuaro del INECOL, el examen final se realizará en el Parque Barranca del Cupatitzio.  Es importante considerar que derivado de la demanda de este tipo de cursos en el Centro de Bajío del INECOL, el curso se llevará acabo al 100% en Pátzcuaro y por las características del mismo es presencial.

Ninguno

No se requiere experiencia previa para el ascenso a los árboles, es recomendable tener una condición física aceptable y no tener miedo a las alturas

Asistencia a las clases teóricas y prácticas (50%), aprobar el examen final que será práctico (50%)

• Inroducción a la ecología del dosel
• Principales técnicas de muestreo en el dosel
• Evaluación de conjunto o panorámica
• Evaluación del terreno
• Evaluación del tronco
• Evaluación de la copa
• Diferentes técnicas de trepa
• Nudos y amarres
• Manejo de cuerda
• Equipo de trepa
• Cuidados y mantenimiento de equipo
• Manejo de equipo de seguridad

1. Revisar los conceptos y aplicaciones detrás de los modelos de nicho: la informática de la biodiversidad, los conceptos de nicho ecológico, de área de distribución, etc. 2. Entender la relación entre el espacio geográfico y el espacio ambiental. 3. Conocer las bases teóricas para hacer modelos de nicho ecológico robustos: interacción entre factores bióticos, abióticos y de movilidad (diagrama BAM). 4. Diseñar especies virtuales y usarlas para entender distintos aspectos de la calibración y validación los modelos de nicho ecológico. 5. Explorar la conveniencia y consecuencia del uso de distintos umbrales de corte para representar las distribuciones de las especies. 6. Analizar la validación estadística de modelos. 7. Hacer modelos basados en procesos para estimar la abundancia en un contexto espacialmente explícito y con distintos kernel de dispersión. 8. Discutir la actualidad de los modelos de nicho ecológico: preguntas y avances teóricos y aplicados del modelado de nicho ecológico.

Es un curso intensivo de tal manera que se cumplan en total 80 horas de clase más lecturas extra clase para su discusión. Mediante sesiones teórico-prácticas los alumnes trabajarán durante el tiempo de clase conjuntamente con los profesores para entender los conceptos y visualizar distintas complicaciones en el modelado de nichos ecológicos correlativos y basados en procesos.

Es preferible contar con conocimientos básicos en SIG (e.g., ArcMap, QGIS) y R. Se recomienda también conocimiento sobre la teoría de nichos ecológicos y haber implementado alguna herramienta para la modelación de nichos (e.g., GARP, Maxent, Bioclim). Es conveniente haber tomado el curso básico ofrecido en el INECOL o algún otro relacionado.

Es deseable que el alumne cuente con conocimientos en el lenguaje R y tenga experiencia en algún paquete de SIG (e.g., ArcView, ArcGis, QGIS).

La evaluación ser hará a través de la participación en las lecturas y la discusión grupal (10%), la realización de las prácticas en clase (70%), y el diseño de un caso o experimento a modelar (20%).

1. La Informática de la Biodiversidad.? 2. Introducción a R para este curso. 3. Conceptos de nicho?ecológico. 4. Modelos correlativos, mecanísticos y basados en procesos. 5. La dualidad de Hutchinson: la relación entre el espacio ecológico y el espacio geográfico. 6. El diagrama BAM: áreas de distribución y nichos ecológicos. a. Los conjuntos B, A y M b. Implicaciones de M en la calibración, significancia, traslape y transferencia de los modelos c. Configuraciones del diagrama BAM 7. Las desigualdades de Hutchinson. 8. Aproximaciones al nicho fundamental y su estructura 3D. a. Cuboides (Bioclim), esferoides (misma favorabilidad interna), elipsoides (covariancia entre variables) b. Distancias ambientales (Euclideana, Manhatan, Mahalanobis) 9. Especies virtuales como herramienta de modelado. a. Sesgos en el modelado: consideraciones en los espacios geográfico y ecológico b. Tipos de datos: presencia, presencia/ausencia, presencia/pseudoausencia, presencia/entorno c. Proceso de modelado: ejercicios de exploración con especies virtuales 10. Proyección espacial: transferencia y extrapolación de los modelos en espacio y tiempo. 11. Validación de los modelos: pruebas estadísticas, utilidad y limitaciones. a. Ji-cuadrada, curva ROC, AUC–ROC Parcial, índice Kappa y TSS 12. Conservadurismo y traslape de nicho: equivalencia, similitud y traslape de ?nichos. 13. De las poblaciones a las metapoblaciones: los modelos basados en procesos, sus fundamentos y supuestos biológicos. 14. Implicaciones de la estructura interna del nicho en fenómenos biológicos. a. Hipótesis del centroide de nicho y la abundancia.

1) enseñar los métodos de recolección de material para diversos estudios botánicos, incluyendo inventarios florísticos, tratamientos taxonómicos, análisis filogenéticos moleculares y anatómicos, entre otros. 2) exponer a los alumnos los principales tipos de vegetación en campo y las características biológicas y climatológicas de ellos. 3) brindar un panorama general de la diversidad de plantas vasculares (helechos, gimnospermas, angiospermas) que se distribuyen en México. 4) dar a conocer las familias y géneros más importantes de cada tipo de vegetación, poniendo atención a características que se pueden observar en el campo. 5) enseñar las medidas de seguridad necesarias para prevenir accidentes y lesiones en el campo y como reaccionar sobre imprevistos en el campo. 

El curso será impartido durante 2 semanas en forma intensiva. Aunque tiene un componente teórico, principalmente son clase práctica, y la mayor parte del curso se llevará a cabo en el campo. Viajaremos a un amplio espectro de ecosistemas naturales en los estados de Guerrero y Michoacán para abundar sobre los temas presentados en la presentación. Haremos recorridos en la mayoría de los tipos de vegetación de México, incluyendo bosque tropical subcaducifolio, bosque tropical caducifolio, bosque espinoso, pastizal, matorral xerófilo, bosque de encino, bosque de coníferas (Pinus, Abies, Juniperus), bosque mesófilo de montaña y vegetación acuática, incluyendo bosque de galería y manglar. En cada uno de los tipos de vegetación se darán descripciones de los mismos y se colectará material; además se conocerán los principales métodos de muestreo de la vegetación. Dado que la colecta de material vegetal es la base de muchos estudios en el campo de la botánica, el curso cubre muchos métodos de preparación de material para los diferentes estudios. Considerando que lo más frecuente es la colecta de especímenes para herbario, practicaremos diversas técnicas, incluyendo la colecta de ejemplares en alcohol y métodos para grupos que requieren técnicas especializadas como plantas suculentas, acuáticas, árboles y lianas. Cubre también la colecta de material en FAA/FPA (Formol-Ácido Acético/Propiónico-Alcohol) para estudios anatómicos y la colecta de material en sílica gel para estudios moleculares o de genética de poblaciones. Con el material recolectado por los propios estudiantes se preparará una colección de especímenes para herbario, mismos que tendrán que determinar haciendo uso de la literatura pertinente. Además podrán desarrollar un pequeño proyecto de manera independiente basado en sus intereses personales. El material necesario para la recolección de especímenes se proporcionará en el curso. Ya que la mayor parte del curso se llevará a cabo en el campo, se recomienda que los estudiantes lleven consigo los siguientes artículos: libreta de campo, pluma o lápices indelebles, mochila pequeña o morral, bloqueador solar, botas o zapatos de campo cómodas, camisa de manga larga, gorra o sombrero y paliacate, e impermeable en caso de lluvia. Además, se pide que los estudiantes lleven todos los artículos personales que van a necesitar durante el curso, tomado en cuenta que el espacio en los vehículos es limitado.

Se requiere que los estudiantes tengan conocimientos básicos de la botánica y estén en condiciones físicas adecuadas para caminar en todo tipo de terrenos. Igualmente es importante que tengan capacidad y disponibilidad para pasar muchas horas trabajando en el campo. Aunque el curso se enfoca en plantas vasculares, muchos de los métodos cubiertos tienen relevancia general en la ecología, y no es necesario que el estudiante sea botánico.

Conocimientos sobre la biología y experiencia y disponibilidad de estar en el campo.

Criterio de calificación: Asistencia 10% Exámenes 30% Trabajos 60%

Tipos de vegetación (diversidad de la vegetación de México, su distribución, características y composición): El estudiante será capaz de reconocer los tipos de vegetación más importantes, sus características y los grupos taxonómicos que los componen. 2. Diversidad vegetal (grupos taxonómicos importantes de plantas vasculares, morfología comparativa): El estudiante reconocerá los grupos principales de plantas vasculares y las familias y géneros más diversos en México, así como la morfología descriptiva de ellas. 3. Técnicas para colectar (colecta de material para diversos tipos de estudios como florísticos, taxonómicos, anatómicos y moleculares): El estudiante se familiarizará con diferentes métodos de colecta: material en sílica gel, alcohol, FAA/FPA (Formol-Ácido Acético (Propiónico)-Alcohol) y para ejemplares de herbario, así como tomar los datos necesarios y preparar las etiquetas correspondientes.

Los objetivos de este curso son que el alumno: 1. Conozca y asimile las bases teóricas, conceptuales y metodológicas de la macroecología. 2. Integre las bases ecológicas, biogeográficas y evolutivas de la macroecología. 3. Entienda y cuantifique los patrones macroecológicos más relevantes. 4. Sea capaz de identificar mediante inferencia y deducción los posibles procesos responsables por los patrones macroecológicos. 5. Comprenda las aplicaciones de los enfoques macroecológicos para la conservación biológica, la ecología humana y la sustentabilidad.

Teórico-Práctica: Aulas teóricas y ejercicios prácticos

No ser alumnos de nuevo ingreso a la maestría. 

-Conocimiento básico de R

-Conocimiento básico de SIGs (sistemas de información geográfica)

Evaluación de un trabajo grupal (2-3 personas) a entregarse una semana después del curso.

1. La perspectiva macroecológica

• Antecedentes de la macroecología
• Macroecología antes de la macroecología
• Biodiversidad como sistema complejo

2. Datos e información macroecológica básica

• Áreas de distribución de las especies
• Informática de la biodiversidad
• Lagunas del conocimiento
• Estructura de datos macroecológicos
• *Ejercicio práctico en R

3. Principales patrones macroecológicos

• Gradientes geográficos de biodiversidad
• Escalas espaciales
• Relación entre diversidad y distribución
• Reglas ecogeográficas
• *Ejercicios prácticos en R

4. Enfoques para el estudio de gradientes geográficos de biodiversidad

• Enfoque correlativo entre ambiente y biodiversidad
• Ejemplos de enfoques correlativos en otras propiedades de la biodiversidad (e.g. redes ecológicas)
• Modelos de simulación en Macroecología
• *Ejercicios prácticos en R

5. Macroevolución y biodiversidad

• Microevolución vs Macroevolución
• Filogenias e información evolutiva
• Procesos macroevolutivos y la generación de patrones de biodiversidad en el tiempo
• Causas histórico-evolutivas de los gradientes de biodiversidad

6. Enfoques evolutivos para estudiar patrones de biodiversidad

• Señal y estructura filogenética
• Filogenética de comunidades
• Conservación filogenética de nicho
• Métodos comparativos filogenéticos

7. Macroecología y Macroevolución

• Filogenias en el espacio geográfico
• Distribuciones geográficas en la filogenia
• Espacio y tiempo en la generación de patrones de biodiversidad

8. Aplicaciones de la macroecología y macroevolución en la conservación biológica.

• Macroecología/Biogeografía de la conservación
• Lagunas del conocimiento
• Patrones de riqueza, endemismo y amenaza
• Delimitación de hotspots y coldspots de biodiversidad
• Macroecología humana

Que el estudiantado: 

1) Conozca y comprenda las características de las corrientes pedagógicas relevantes para relacionarlas con la comunicación, socialización y transferencia del conocimiento científico. 

2) Conozca, comprenda y aplique los métodos y técnicas didácticas que pueden incluirse en el diseño y planeación instruccional de cursos formales, así como los elementos que se requieren para la estructuración de talleres y otras formas de educación social y mixta. 

3) Conozca y comprenda los diferentes espacios y medios de aprendizaje y difusión en los que se interactúa con los diferentes actores sociales. 

4) Adquiera y aplique  conocimientos, herramientas y habilidades generales para el desarrollo de productos relevantes en la Comunicación Pública de la Ciencia. 

5) Conozca y comprenda las bases de la investigación y el trabajo transdisciplinario y su relevancia como estrategia metodológica para el abordaje de diversos contextos y actores sociales. 

El curso se desarrollará aplicando la metodología de taller, a través de la cual abordaremos los contenidos teóricos para posteriormente promover el trabajo individual y en equipo para llevar a la práctica los conocimientos adquiridos. 

El desarrollo del curso se organiza en cuatro  momentos principales que se abordarán en el lapso de cuatro semanas a través de sesiones teórico-prácticas (cuatro sesiones por semana). El primer momento (semanas 1 y 2 del curso) corresponde al bloque de contenido en Educación donde se abordarán los objetivos específicos 1 y 2. El segundo momento (semanas 3 y 4) constituye el bloque temático correspondiente a Comunicación Pública de la Ciencia que corresponde a los objetivos específicos 3 y 4. El tercer momento (semana 4) se relaciona con el bloque de contenido que refiere al trabajo transdisciplinar y que corresponde al objetivo específico 5. Durante el transcurso de las sesiones desarrollaremos abordajes teóricos - conceptuales y metodológicos , donde plantearemos los temas a través de lecturas que serán compartidas con los estudiantes antes de cada sesión . Durante la sesión, los coordinadores y los docentes invitados desarrollarán cada tema a través de presentaciones y breves recapitulaciones de cada lectura que serán reforzadas en la parte final de la sesión, generando debates desde un enfoque participativo guiado sobre el desarrollo del tema. Finalmente, el curso se cierra con un cuarto momento (semana 4) que incluye sesiones de presentación y retroalimentación de los productos finales que cada estudiante desarrolla en educación y comunicación pública de la ciencia con una primera aproximación a perspectivas transdisciplinares .  

Esta información se detalla en la sección Contenido Temático.  

• Ser estudiante de Maestría o Doctorado . 

• Disponibilidad de tiempo para atender íntegramente la carga académica del curso. 

• Especialmente sugerido para quienes estén o vayan a desarrollar un proyecto de investigación que incluya actividades educativas o de difusión con impacto social. 

• Gusto e interés por la docencia y el trabajo con grupos o comunidades. 

• Gusto o interés de abordar e incursionar en espacios y momentos educativos y de Comunicación Pública de la Ciencia . 

Se considerarán tres etapas de evaluación , donde cada una aporta una tercera parte de la evaluación de cada criterio (ver detalle de los criterios de evaluación y su correspondiente porcentaje de la calificación final en la siguiente tabla) : (1) diagnóstica , al inicio del curso; (2) continua , a lo largo del curso y considerando asistencia, participación, trabajos de clase y tareas; y (3) sumativa , al final del curso mediante la entrega y presentación oral del diseño de una planeación, secuencia didáctica, carta descriptiva de un taller o del producto de difusión de su elección (Se adjunta Rúbrica de Evaluación para cada producto sugerido , así como la Rúbrica de Evaluación para la presentación de los productos finales ).

Criterios de evaluación:

Asistencia  (para tener derecho a la evaluación, cada alumno deberá asistir al menos al 80% de las sesiones)

Participación (se evaluará mediante la entrega de textos diarios (apuntes de cada sesión), trabajos de clase y entrega de tareas) 20%

Producto final (ver detalles en cada rúbrica de evaluación) 60%

Presentación final (ver detalles en la Rúbrica de Evaluación) 20%

TOTAL 100%

Contenido temático

Bloque temático                                          Temas y subtemas 

Bloque 1 (24 horas)           

(Primer momento)

Educación 

1.1 Educación 

• Enfoques/modelos pedagógicos 
• Teorías del aprendizaje 
• Espacios/entornos de enseñanza y aprendizaje 
• Educación ambiental 

• 1.2  Diseño instruccional en la educación formal 

  • Características de la educación formal 
  • Currículo y plan de estudios 
  • El plan de clase como herramienta educativa 
  • Metodologías activas 
  • Estrategias de enseñanza y aprendizaje 
  • Evaluación 
  • Experiencias inspiradoras: Acercándose al Jardín Botánico (Fairchild y Jardín Etnobiológico) desde la Nueva Escuela Mexicana.

1.3  Diseño instruccional en educación social y mixta (informal y no formal) 

• Características de la educación social y mixta  
• El contexto en los espacios sociales  
• La carta descriptiva como herramienta educativa  
• Metodologías de enfoque comunitario 
• Estrategias de aprendizaje dialógico (visita interpretativa, taller, grupo focal, diálogo, debate) 
• Evaluación 
• Experiencias inspiradoras: Estrategias de investigación y comunicación social.  

Bloque 2 (15 horas)

(Segundo momento) 

Comunicación pública de la ciencia 

2.1 Comunicación Pública de la Ciencia 

• Todo lo que no sabías sobre el CPC (qué implica, qué integra, por qué y para qué comunicamos ciencia, qué ciencia comunicamos). 
• Modelos de comunicación. 
• Identificación por instituciones. 

2.2 Diseño general de estrategias de comunicación. 

• Objetivos del PCCh 
• De los medios como fin a los medios como herramienta (medios tradicionales, selección y análisis de audiencias, el mensaje, planificación) 
• Herramientas para la evaluación. 
• Otras herramientas para comunicar (STEM, gamificación, artes, senderos interpretativos, medios no tradicionales). 

2.3 Divulgación por escrito 

• Formatos básicos de difusión escrita (artículos, libros; algunos formatos de literatura, periodismo y diseño). 

Bloque 3 (6 horas)

(Tercer momento)

La transdisciplina en contextos y espacios de investigación científica, educación y comunicación pública de la ciencia 

3.1 Nociones teóricas y conceptuales de la investigación transdisciplinaria 

• Revisión de términos de referencia y glosario conceptual  
• Conceptos clave de la investigación transdisciplinaria 
• Paradigmas de yuxtaposición de la investigación transdisciplinaria e interdisciplinaria 
• Integración de epistemologías, cosmovisiones y comunidades interpretativas 

3.2 Métodos y paradigmas en la educación popular  

• La investigación como agente constitutivo de propuestas educativas  
• Identificación de temas generativos, percepciones y expectativas socioculturales 
• Investigación temática (aspecto educativo) e investigación-acción-participativa (aspecto sociológico) 
• Procesos participativos en la investigación, la educación y la comunicación pública de la ciencia   
• La sistematización de experiencias como herramienta metodológica para democratizar los conocimientos y habilidades tradicionales 
• Entre la educación popular y la investigación alternativa: formar sujetos para y en la transformación social  

3.3 Investigación y educación interdisciplinaria y transdisciplinaria 

• Política educativa y educación popular: las contribuciones de Paulo Freire a la investigación y la educación interdisciplinaria 
• La investigación transformadora como capacidad humana: Principios de investigación y aprendizaje inter y transdisciplinario desde el trabajo conceptual  
• Investigación Acción Participativa (IAP) como vínculo entre la academia y los movimientos sociales con acciones concretas de transformación 
• Experiencia inspiradora: Cuenca del Alto Atoyac: Estrategias de investigación social.

Bloque 4 (3 horas)

(Cuarto momento) 

Presentaciones finales, retroalimentación y recapitulación 

• Presentaciones finales: Apropiación, vinculación y aplicación de los contenidos del curso en los productos finales de los estudiantes
• Recapitulación participativa y aprendizaje del curso 

1. Conozca la importancia de la ilustración Científica.
2. Aprenda el uso de la Ilustración Científica en la divulgación y/o difusión de la ciencia.
3. Adquiera las bases que le permitan ilustrar diferentes organismos como son plantas e insectos para su uso en la divulgación y/o difusión de la ciencia.
4. Se familiarice con herramientas para la adquisición de imágenes necesarias para realizar la ilustración.
5. Conozca los materiales adecuados para la elaboración de ilustraciones.

El curso consta de sesiones teóricas en donde el estudiante conocerá los antecedentes de la ilustración, composición y tipografía y su aplicación en la ilustración científica y naturalista, así como de la morfología de plantas e insectos. También tendrá sesiones prácticas en donde aprenderá a reconocer y diferenciar morfología de plantas e insectos y realizará ejercicios con diferentes técnicas para ilustrar.

Conocimientos básicos de ilustración y morfología de plantas y/o insectos.

Nociones básicas de ilustración.

Asistencia, Puntualidad y Participación en clase (10%); Proyecto en clase (40%); Proyecto Final (50%)

SEMANA 1 (6- 9 mayo)

SESIÓN 1. 6 de mayo

Introducción. Antecedentes y procesos de la ilustración científica y naturalista

(Teresa Jiménez)

 SESIÓN 2. 7 de mayo

Introducción a la morfología de plantas (Itzi Fragoso)

Visita al Herbario (Francisco Lorea)

SESIÓN 3. 8 de mayo 

Introducción a la morfología de grupos representativos de insectos

Visita a la colección entomológica (Viridiana Vega)

SESIÓN 4. 9 de mayo 

Ejercicios de dibujo

Técnicas de tinta y grafito (Arturo Ibarra y Teresa Jiménez)

 SEMANA 2 (12-16 mayo)  

SESIÓN 5. 12 de mayo 

Visita al jardín botánico 

Cuaderno de campo y acuarela (Carmen Gutiérrez y Carlos Ortega)

SESIÓN 6. 13 de mayo 

Práctica de acuarela (Carmen Gutiérrez y Carlos Ortega)

SESIÓN 7. 14 de mayo 

Sesión para trabajar láminas científicas (plantas o insectos)

Presentación de propuestas, realización de bocetos

(Viridiana vega, Arturo Ibarra y Teresa Jiménez)

SESIÓN 8. 15 de mayo 

Visita al jardín botánico y Santuario del Bosque de niebla 

Dibujo en campo y técnica de pintura acrílica (Aldo Domínguez)

SESIÓN 9. 16 de mayo

Práctica de pintura acrílica (Aldo Domínguez)

SEMANA 3 (19-23 mayo)

SESIÓN 10. 19 de mayo

Sesión para trabajar láminas científicas (plantas o insectos) / avances en ejercicios. 

(Viridiana Vega, Arturo Ibarra y Teresa Jiménez)

Charla con profesor invitado: Alberto Guerra (1 hr. En línea) 

SESIÓN 11. 20 de mayo

Sesión para trabajar láminas científicas (plantas o insectos) / avances en ejercicios.

(Viridiana Vega, Arturo Ibarra y Teresa Jiménez)

Digitalización de imágenes (Arturo Ibarra)

SESIÓN 12. 21 de mayo 

Sesión para trabajar láminas científicas (plantas o insectos)

(Viridiana Vega, Arturo Ibarra y Teresa Jiménez)

Charla con profesor invitado: Diego Ávila (1 hr.)

SESIÓN 13. 22 de mayo

Entrega final. Revisión

(Viridiana Vega, Arturo Ibarra y Teresa Jiménez)

Charla con profesora invitada: Lilian Tendilla (1 hr. En línea)

 SESIÓN 14. Montaje y exposición de trabajos finales

(Viridiana Vega, Arturo Ibarra y Teresa Jiménez)

Analizar los fundamentos básicos teóricos sobre el estudio de la biología del suelo. Profundizar en la biología y fisiología de los principales grupos que conforman la biota del suelo. Mediante estudios de caso exponer la importancia del manejo de la biota en la restauración y conservación de los ecosistemas y agroecosistemas. Conocer las principales interacciones biológicas edáficas y su relevancia en las comunidades vegetales. Familiarizar al estudiante con las técnicas básicas empleadas en el aislamiento de los principales grupos de microorganismos del suelo (nematodos, hongos saprobios, endomicorrizas). Familiarizar al estudiante con metodologías para la detección de la actividad fisiológica de diferentes grupos de microorganismos (especies celulolíticas, solubilizadores de fósforo, productoras de enzimas).

La dinámica del curso incluye exposiciones teóricas, discusión de artículos, análisis de estudios de caso y demostraciones de las principales técnicas de aislamiento y manejo de algunos grupos.

El curso está enfocado a biólogos, agrónomos y estudiantes de áreas afines, con un nivel mínimo de licenciatura. Los aspirantes deben contar con un conocimiento básico de biología así como comprender textos en inglés.

Capacidad de analizar, integrar y sintetizar información de textos científicos.

Al inicio de cada módulo se les dará a los alumnos un cuestionario, el cual deberán entregar al finalizar el módulo; el promedio de las notas obtenidas en los cuestionarios equivaldrá al 50% de la calificación final.

El otro 50% se repartirá en 25% para la exposición oral de temas específicos y el 25% para la exposición de artículos.

El suelo; conceptos generales, perfiles y horizontes, características físicas: pH, textura, macro y micro agregados, características químicas. La fracción coloidal: arcilla y humus. Tipos de suelos en México. Ambiente biótico y procesos edáficos, diversidad, distribución y factores que influyen en el desarrollo de la biota edáfica. Actividades microbianas en los ciclos biogeoquímicos; asimilación, inmovilización, descomposición de la materia orgánica. La biota edáfica; características biológicas, fisiológicas y ecología de los principales grupos de la microbiota, macro y meso fauna del suelo (nemátodos, lombrices, insectos sociales, arqueobacterias, bacterias, algas, hongos). Interacciones microbianas entre los organismos del suelo y las plantas. Conceptos básicos: endomicorrizas y ectomicorrizas. Manejo y aplicación biotecnológica de las poblaciones del suelo (biofertilización, control biológico, biorremediación). Paradigmas en la Biología del suelo; La diversidad de la biota edáfica y la funcionalidad de los ecosistemas; ecología de las enfermedades en el ambiente rizosférico; parámetros en la evaluación de la calidad del suelo; métodos estadísticos en la valoración de la diversidad de la biota edáfica; el manejo agrícola y su impacto en las comunidades del suelo y su funcionalidad.

• Revisar el desarrollo histórico, estado actual y futuro del concepto de los servicios ambientales y la economía ambiental.
• Revisar los procesos ecosistémicos importantes en el funcionamiento de dichos servicios incluyendo los ciclos de agua, carbono, nitrógeno, y fósforo, así como la hidrología, polinización, formación de suelos, protección contra disturbios, etc.
• Revisar los principales servicios ambientales proporcionados por los ecosistemas de México.
• Revisión de siete servicios ambientales para profundizar en los pasos a seguir en la cuantificación, valoración y creación de esquemas de compensación para estos servicios.
• Destacar los métodos principales utilizados para cuantificar y valorar los servicios ambientales.
• Revisar las fortalezas y debilidades de los mercados que se están creando para el pago por servicios ambientales en México y el extranjero.

El curso constará de clases de dos horas y medio cada día. Durante los primeros 1.5 horas habrá presentaciones por el coordinador del curso o profesores invitados de temas específicas, seguido por un break de 15 minutos. En las últimas 45 minutos de la clase, un alumno tendrá que presentar y liderar una discusión sobre el articulo asignado al grupo por el profesor. Habrá una salida a campo de un día completo para conocer los actores relevantes, las actividades y la historia de un programa de pago por servicios hidrológicos activo en la cuenca del Río Pixquiac.

Conocimientos básicos de Ecología (equivalente a un año de estudios de posgrado) y la capacidad de leer 2 artículos (la mayoría en Inglés) por día.

El curso está dirigido en particular a alumnos en la fortaleza de ecología, manejo de recursos naturales y conservación. Sin embargo, también debe proporcionar conocimiento valoroso para alumnos en las demás fortalezas.

• Participación activa en las discusiones de las lecturas, y los temas presentados por los profesores invitados y los artículos asignados (15%)
• Examen final de ensayo sobre temas selectos del material presentado  (50%)
• Presentaciones de árticulos claves al grupo de alumnos y profesores (35%)

• Introducción al curso y avances recientes en el estudio de los servicios ambientales (R. Manson, INECOL: 1 días)
• Desarrollo historico del concepto de servicios ambientales (Santiago Tort, IIE-UNAM: 1)
• Métodos de valoración económica (R. Manson, INECOL: 1)
• Servicios selectos: ecoturismo en el monitoreo de aves en Rio de Rapaces (Kashmir Wolf, Pronatura Veracruz: 1)
• Servicios selectos: manejo holístico de plagas y enfermedades en cafetales (Juan Francisco Barrera, ECOSUR: 1)
• Protección contra tormentas (Octavio Pérez-Maqueo, INECOL: 1)
• Servicios hidrológicos I: Bases sobre hidrología de cuencas I: procesos afectando el régimen de caudales y calidad de agua; Cuantificando servicios hidrológicos con una herramienta de modelación hidrológica (SWAT) (Susana Alvarado, INECOL y Sergio López, FMCN: 1)
• Servicios hidrológicos II: Servicios hidrológicos: evapotranspiración y la cuenca “al revés” (Susana Alvarado, INECOL: 1
• Servicios hidrológicos III: cuantificación y valoración en InVEST (Pierre Mokondoko, IIE-UNAM: 1)
• Consideraciones en la creación operación de programas de PSH (Robert Manson, INECOL: 1)
• Salida a campo para conocer programas de pago por servicios hidrológicos en Coatepec y Xalapa (R. Manson y Tajin Fuentes Gina Vidriales, SENDAS: 1)
• Servicios selectos: conservación de la biodiversidad (Robert Manson, INECOL: 1)
• Servicios selectos: polinización y tendencias mundiales (Taylor Ricketts, Univ. Vermont: 1)
• Servicios selectos: polinzadores y polinización en México (Rémy Vandame, ECOSUR: 1)
• Servicos selectos: belleza escenica en la zona costera (Debora Lithgow, INECOL: 1)
• Servicios selectos: control biológico de plagas (Rodrigo Lasa, INECOL: 1)
• Servicios selectos: fertilidad de suelos en cafetales (Isabelle Barois, INECOL: 1)
• Servicios selectos: fertilidad y hongo microrricicos en milpas (S. Negrete, INECOL: 1)
• Servicios selectos: principios básicos y métodos de medición de sucuestro de carbono (Robert Manson, INECOL: 1
• Servicios selectors: evolución de mercados de carbono y otros mecanismos financieros (Renée González Montagut, FMCN: 1)
• Examen de ensayo (Robert Manson y Susana Alvarado, INECOL: 1)

Que cada participante se fortalezca en las áreas del Derecho Ambiental de su preferencia.

La metodología didáctica de este curso se basa en "El constructivismo en el aula" Coll C. et alia 2007. Editorial Colofón.

Personas con licenciaturas en derecho y afines a la biología.

Haber cursado las materias de las licenciaturas en derecho y afines a la biología.

Asistencia y Participación 50% y trabajo asignado por los profesores de cada módulo y ensayo sobre un tópico 50%

1) Medio Ambiente: sus componentes y amenazas antropogénicas. 2) Derecho y medio ambiente: introducción. 3) Responsabilidades de investigadores y Servidores Públicos. 4) Leyes que tutelan a la biodiversidad: aciertos y vacíos. 5) La manifestación de Impacto Ambiental y sus componentes. 6) El Ordenamiento Ecológico Territorial. 7) El Peritaje Ambiental. 8) El Derecho Humano al Ambiente Sano: ejemplos. 9) Constitucionalidad y juicio de amparo: historia y evolución. 10) El litigio estratégico: casos de alto impacto. 11) Convencionalidad y convenios internacionales. 12) Coversatorio y conclusiones del curso.

Que el estudiante conozca y aplique correctamente las pruebas estadísticas paramétricas (z, t, regresión y correlación, análisis de varianza, comparaciones múltiples) y no paramétricas (re-muestreo, frecuencias, conteos, ordinales).

En cada sesión el profesor presenta las bases teóricas del tema y utiliza un conjunto de datos con el fin de ejemplificar la prueba o análisis de interés. El conocimiento adquirido se refuerza con la solución de ejercicios en clase y otros para resolver en casa, con la posterior discusión en clase. Se emplea la dinámica de aprender haciendo, en la que los procedimientos que se exponen en una primera clase, se reafirman gradualmente durante las sesiones de práctica que se incluyen en las clases posteriores. Se usa un enfoque flexible para elegir las técnicas de resolución de los ejemplos. Se introduce al programa R y se enseña cómo resolverlos con ese programa.

Es un curso intensivo. Las clases son impartidas diariamente por 1 profesor durante 4 horas. Después de cada sesión diaria, los alumnos resuelven ejercicios en casa, normalmente en 4 horas.  

Conocimiento de álgebra y manejo de hojas de cálculo o R.

Conocer la naturaleza y estructura de varias pruebas estadísticas y desarrollar ejercicios numéricos.

Cada módulo se evalúa separadamente y la calificación final del curso es el promedio aritmético de las evaluaciones de cada módulo. Los Criterios de Evaluación por Módulo son: Módulo I: Cinco tareas que se califican por puntos de acuerdo al grado de dificultad de cada ejercicio. La calificación del módulo es un promedio ponderado de 5 tareas. Módulo II: Resolución de tareas diarias y examen escrito final de resolución de ejercicios. La escala de calificación del módulo es del 1 al 10. Módulo III: Resolución de tareas diarias y examen escrito final de resolución de ejercicios. La escala de calificación del módulo es del 1 al 10. Módulo IV: Resolución de tareas diarias y examen escrito final de resolución de ejercicios. La escala de calificación del módulo es del 1 al 10.

MÓDULO I. INTRODUCCIÓN A R, PROBABILIDAD Y PRUEBA DE t

Rosario Landgrave.

7 clases, 4 horas = 28 horas.

Clase 1. Temas selectos de matemáticas e introducción a R.

Clase 2. Temas selectos de matemáticas e introducción a R.

Clase 3. Estadística Descriptiva.

Clase 4. Probabilidad Teórica.

Clase 5. Funciones de densidad de probabilidad.

Clase 6. Teorema del límite central.

Clase 7. Prueba de z y prueba de t

MÓDULO II. REGRESIÓN Y CORRELACIÓN LINEAL SIMPLE

Oscar Briones.

8 Clases, 4 horas = 32 horas.

Clase 1. Modelo, objetivos y usos de la regresión lineal. Supuestos del modelo. Modelos I y II. Estimación de parámetros por mínimos cuadrados y derivación del coeficiente de regresión (b). Cálculos básicos y ecuaciones principales para obtener el modelo de regresión. 

Clase 2. Sesión práctica con el uso del programa R. Regresión lineal con repeticiones. Pruebas de hipótesis. Análisis de varianza de la regresión. Coeficiente de determinación (r2).

Clase 3. Pruebas de t sobre b y la ordenada (a). Equivalencia entre análisis de varianza y prueba de t para b. Estimación de intervalos de confianza para a, b y valores esperados. 

Clase 4. Comprobación de la adecuación del modelo de regresión: residuales ordinarios, escalados y datos atípicos, prueba de falta de ajuste.

Clase 5. Transformaciones para corregir inadecuaciones del modelo. Funciones linealizables. Predicción inversa.

Clase 6. Comparación entre líneas de regresión. Correlación lineal simple (r). Prueba de hipótesis. Estimación de intervalo de confianza. Comparación entre coeficientes de correlación. Relación matemática entre b, r y r2.

Clase 7. Sesión práctica con el uso del programa R. Modelo II de regresión lineal (ambas variables sujetas a error): método de los 3 grupos. Comparación entre modelos I y II de regresión lineal simple. Relación entre regresión y correlación paramétrica.

Clase 8. Examen.

MÓDULO III. ANÁLISIS DE VARIANZA Y DISEÑO EXPERIMENTAL

Miguel Equihua.

9 Clases, 4 horas = 36 horas.

Clase 1. Diseño de experimentos y ANOVA 1 vía.

Clase 2. Comparaciones múltiples. Transformaciones.

Clase 3. ANOVA 2 vías. Factoriales. Interacciones.

Clase 4.  Efectos fijos aleatorios y mixtos.

Clase 5. Diseños con restricciones a la aleatorización I: Diseño en bloques completamente aleatorizados. 

Clase 6. Diseños con restricciones a la aleatorización II: Diseños anidados.

Clase 7. Diseños con restricciones a la aleatorización III: Parcelas divididas.

Clase 8. Diseños con restricciones a la aleatorización IV: Medidas repetidas.

Clase 9. Examen.

MÓDULO IV. ANÁLISIS “NO PARAMÉTRICOS” Y RE-MUESTREO

Salvador González de León.

6 Clases, 4 horas = 24 horas.

Clase 1. Introducción y visión general (2 h); Análisis de re-muestreo y generación de distribuciones adhoc (2 h).

Clase 2: Análisis de re-muestreo y generación de distribuciones adhoc (cont.).

Clase 3: Análisis de frecuencias o conteos.

Clase 4: Análisis de frecuencias o conteos (cont.).

Clase 5: Análisis basados en transformaciones ordinales; examen a casa.

Clase 6: Revisión de examen a casa (2 h); Introducción a modelos lineales generalizados (2 h).

Comprender los principios teóricos y metodológicos de la ecología del paisaje y su aplicación al análisis de la estructura y función de paisajes agrícolas y periurbanos.

Identificar y analizar las prácticas sociales, culturales y productivas que dan forma a los paisajes multifuncionales y condicionan su uso, transformación y conservación.

Explorar las interacciones entre biodiversidad, valores de la naturaleza y procesos sociales que dan lugar a  distintos tipos de paisajes (agrícolas, forestales, urbanos, mixtos, etc).

Conocer algunas herramientas (como SIG, cartografía participativa, análisis de redes) útiles en el estudio de paisajes desde una perspectiva socioecológica.

Reflexionar sobre enfoques de manejo y gobernanza que promuevan paisajes más sostenibles, equitativos y resilientes frente a cambios socioambientales.

Revisión de literatura especializada. Se realizará la lectura crítica de artículos científicos sobre diferentes aspectos relacionados con el concepto de paisaje, sus interacciones sociales y ecológicas y el concepto de paisaje multifuncional

Interés en la temática

Lectura y discusión crítica de literatura científica (incluyendo textos en inglés)

Asistencia y Participación 

Liderar discusión y revisión de artículos

Ensayo final  

1. Fundamentos de la Ecología del Paisaje

• Principios clave: patrón y proceso
• Fragmentación, conectividad, bordes y matriz
• Escalas espaciales y temporales
• Paisaje como sistema ecológico: biodiversidad, funciones múltiples del paisaje

2. Paisaje como bien común 

• Territorio y biculturalidad 
• Gobernanza de los recursos y tenencia de la tierra
• Conflictos socioambientales
• Valores y valoración de la naturaleza

3. Interacciones Socioecológicas en Paisajes 

• Usos del suelo, sistemas de producción y actores sociales
• Sistemas tradicionales de manejo (milpa, cafetales, agroforestería)
• Resiliencia y vulnerabilidad socioecológica
  
  

4. Métodos y Herramientas para el Análisis del Paisaje

• SIG y análisis espacial
• Cartografía participativa y metodologías mixtas
• Indicadores ecológicos y sociales del paisaje

5. Diseño y Gestión de Paisajes para la Sustentabilidad

• Planificación territorial y escenarios futuros
• Enfoques bioculturales y co-manejo
• Casos de estudio y aplicaciones 

Brindar un panorama general de la diversidad de plantas vasculares (helechos, gimnospermas y angiospermas) que se distribuyen en México, señalando sus centros de diversifican (sitios y tipos de vegetación) y endemismo.

Interpretar las características morfológicas vegetativas y reproductivas importantes para identificar plantas: hábito, hojas, soros, inflorescencias, flores, frutos.

Mostrar el manejo de claves para determinar plantas.

Presentar la literatura (Floras, revisiones y monografías) y las herramientas en línea más importantes para identificar plantas mexicanas.

Mostrar la importancia de los herbarios en la determinación de plantas vasculares.

Explicar los pros y las contras de las aplicaciones disponibles para determinar plantas de fotos, por ejemplo: LeafSnap, iNaturalista y PlantNet.

Dar a conocer las familias y géneros más diversos en México y mostrar sus características distintivas.

Demostrar métodos de rehidratación de material seco y disección de estructuras, además del uso correcto de un estereoscopio.

El curso será impartido durante 2 semanas de forma intensiva. Tiene componentes teóricos y prácticos.  Cada día se darán presentaciones en la mañana, seguidos por sesiones prácticas por la tarde. Las actividades prácticas consistirán en tres aspectos: 1) caracterizaciones e interpretaciones de estructuras (soros, hojas, flores, frutos, etc.); 2) características sobresalientes de los taxones más importantes, incluyendo clases, familias y géneros; y 3) ejercicios de determinación de ejemplares usando claves y recursos en línea. El material necesario para la identificación de las plantas se proporcionará en el curso. Haremos un par de salidas locales (de dos a tres horas) a sitios en los alrededores de Pátzcuaro para observar plantas en el campo y conseguir material fresco para determinar, siempre asegurando tomar las precauciones necesarias con respecto a seguridad.

Conocimientos básicos de la botánica, incluyendo morfología de plantas.

Conocimientos sobre la biología.

Asistencia (10 %), Exámenes (30 %), Trabajos (60 %)

Diversidad vegetal de México y como se distribuye en diferentes regiones y ecosistemas.

Características y riqueza de los cuatro taxones más importantes de plantas vasculares (licofitas, helechos y plantas afines, gimnospermas, angiospermas).

Como distinguir las familias más diversas de México: Asteraceae, Fabaceae, Orchidaceae, Poaceae, Euphorbiaceae, Rubiaceae, Cactaceae, Lamiaceae, Malvaceae, Asparagaceae, Bromeliaceae, Apocynaceae, Cyperaceae y Solanaceae.

Morfología comparativa de estructuras vegetales: tallos y hojas.

Morfología comparativa de estructuras reproductivas: soros, estróbilos, flores, frutos, semillas.

Las floras regionales y locales de México.

eFloraMEX, una Flora electrónica de plantas mexicanas.

Bibliografía especializada sobre plantas mexicanas, incluyendo revisiones y monografías.

Uso de claves dicótomas y de acceso múltiple.

El método comparativo para determinar plantas.

Plataformas y aplicaciones para identificar plantas.

Organización y manejo correcto de ejemplares de herbario.

1. Diferenciar las estructuras reproductoras que producen los micromicetos y familiarizarse con su nomenclatura.
2. Analizar los diferentes sistemas de clasificación basados ??en características morfológicas.
3. Adquirir conocimientos sobre las técnicas básicas para la colecta, detección, aislamiento y conservación de los hongos saprobios.
4. Familiarizarse con las técnicas para el análisis molecular para la identificación de las especies fúngicas microscópicas.
5. Analizar información sobre estudios morfológicos y moleculares en la identificación y el análisis filogenético de los hongos conidiales.
6. Conocer las técnicas para evaluar in vitro las capacidades fisiológicas de los micromicetos.

La dinámica del curso abarca exposiciones teóricas y sesiones prácticas en el laboratorio, donde los estudiantes aprenderán a detectar, aislar y elaborar preparaciones permanentes y semipermanentes, así como a ubicar taxonómicamente los micromicetos que detecten a nivel de género. Se incluirán actividades centradas en la aplicación de técnicas moleculares y bioinformática para la identificación y ubicación filogenética de estos organismos. También se llevarán a cabo sesiones demostrativas sobre la metodología para evaluar las capacidades fisiológicas in vitro de los micromicetos.

Este curso está dirigido a biólogos, agrónomos, químicos y estudiantes de disciplinas relacionadas, con un nivel mínimo de licenciatura. Los participantes deben tener conocimientos básicos de biología y ser capaces de comprender textos en inglés.

Habilidad para usar agujas de disección, comprensión de lecturas en inglés, mantener orden y limpieza en laboratorio y buena disposición para trabajar en equipos.

Al inicio del curso se les dará a los alumnos un cuestionario, el cual deberán entregar al finalizar el curso: 40% de la calificación final. 

Colección de evidencias de las sesiones de laboratorio (preparaciones microscópicas): 60% de la calificación final.

Definición, importancia ecológica y biotecnológica de los micromicetos saprobios.

Desarrollo, morfología y ontogenia conidial.

Sistemas de clasificación con base en caracteres morfológicos.

Principales grupos de micromicetos de los restos vegetales.

Integración de los estudios morfológicos y moleculares para la identificación y el análisis filogenético de los hongos conidiales.

Técnicas esenciales para la colecta, detección, aislamiento y conservación.

Técnicas para el análisis molecular de las especies fúngicas microscópicas.

Cubrir los siguientes tema durante el desarrollo del curso de campo:

1. Métodos para el estudio de Mamíferos (roedores, lagomorfos, quirópteros, ungulados, carnívoros), Aves y Reptiles
2.  Estimaciones Poblacionales Métodos directos- Conteos, trampeos Métodos indirectos - Huellas, excretas, estaciones olfativas, registros acústicos. Programas para estimar densidad poblacional
3. Monitoreo de la salud: Conceptos de ecología de la enfermedad, Técnicas de colecta de muestras biológicas en fauna silvestre. Procedimientos de campo para el estudio de las enfermedades y el estado de salud.
4. Radiotelemetría Principios teóricos y prácticos de esta técnica Estimación de ámbitos hogareños Patrones de actividad
5. El hábitat Principios teóricos Características del hábitat para alimentación, cobertura y agua Métodos para medir las diferentes variables del hábitat Uso del hábitat

Específicas para cada grupo de vertebrados: métodos directos e indirectos. Métodos para caracterizar el hábitat: líneas de Canfield y cuadrantes centrados en puntos.

Tener estudios de licenciatura en biología, Veterinaria, o carreras relacionadas

Tener el conocimiento básico para el estudio de poblaciones de vertebrados y su hábitat. 

EVALUACIÓN:

El 50% es la práctica individual, 40% informes de las prácticas y 10% participación.

CALENDARIO DEL CURSO

2  marzo

9:00-10:00 Introducción al curso. Dra. Sonia Gallina,

10:00-11:00 Métodos para el estudio de anfibios y reptiles MC. Adriana Sandoval

11:00-13:00 Métodos para el estudio de la tortuga del bolsón de Mapimí: Dr. Luis García Feria

3 marzo

09:00-11:00 Técnicas para el estudio sobre Aves Dr. Fernando González 

11:00-13:00 Métodos para el estudio de Murciélagos Dr. Antonio Guillén

4 marzo

9:00-10:30 Método para el estudio de roedores y carnívoros (Long Term Ecological Research) Dr. Alberto González

10.30-12:30 Método del uso de Cámaras-trampa automatizadas Dra. Eva López-Tello

12:30-13:30 Principios básicos de ecología de la enfermedad para el manejo de fauna silvestre Dr. Luis García Feria

5-6 marzo

07:00 Salida a la Reserva de la Biosfera Mapimí

7-9 marzo

Estimaciones de Abundancias Relativas de la tortuga del Desierto y su hábitat 

Dra. Sonia Gallina,      MC. Adriana Sandoval,  MC. Jorge Ramos

Dr. Luis García Feria

GPS e Introducción a SIG, MC. Adriana Sandoval

10-18 de marzo

Práctica de Aves, Dr. Fernando González 

Estimaciones Poblacionales

Métodos Directos para el estudio de la comunidad de roedores en dos ambientes: pastizal y matorral, Dr. Alberto González

Transectos en línea para estimar densidad de lagomorfos en dos ambientes: pastizal y matorral, Dr. Alberto González

Métodos Indirectos como estaciones olfativas para el estudio de Carnívoros, Dr. Alberto González

Práctica sobre el uso de Cámaras-trampa automatizadas. Dra. Eva López

Práctica de Murciélagos (19-21 de marzo), Dr. Antonio Guillén

11-18 marzo

Técnicas indirectas para estimar poblaciones de Ungulados y su hábitat, Dra. Sonia Gallina

Metapoblaciones, Dr. Gerardo Sánchez

El hábitat - Principios teóricos y prácticos. Métodos para medir las distintas variables del hábitat, Dra. Sonia Gallina

Uso de drones para estudios del habitat, Dr. Dante Hernández

Métodos estadísticos empleados para analizar los datos, Dr. Gerardo Sánchez

Revisión de los métodos cualitativos y cuantitativos más aplicables para complementar estudios ecológicos, M. C. Jorge Ramos

Métodos Directos con el uso de trampas.Tomahawk para mamíferos medianos, Dr. Alberto González

Plática: Radiotelemetría, Dr. Luis García Feria

Practica: Uso de la Radiotelemetría, Dr. Luis García Feria

Sistemas de información geográfica como herramientas para el análisis de distribución e interpolación de variables ambientales. MC. Adriana Sandoval

19-22 marzo

Desarrollo de los Proyectos individuales

23-24 marzo

Regreso de Mapimí a Xalapa

25-26  marzo

Análisis de datos y preparación de las prácticas grupales

27 marzo

Entrega Practicas Individuales y grupales. Presentación Proyectos.