• Revisar el desarrollo histórico, estado actual y futuro del concepto de los servicios ambientales y la economía ambiental.
• Revisar los procesos ecosistémicos importantes en el funcionamiento de dichos servicios incluyendo los ciclos de agua, carbono, nitrógeno, y fósforo, así como la hidrología, polinización, formación de suelos, protección contra disturbios, etc.
• Revisar los principales servicios ambientales proporcionados por los ecosistemas de México.
• Revisión de siete servicios ambientales para profundizar en los pasos a seguir en la cuantificación, valoración y creación de esquemas de compensación para estos servicios.
• Destacar los métodos principales utilizados para cuantificar y valorar los servicios ambientales.
• Revisar las fortalezas y debilidades de los mercados que se están creando para el pago por servicios ambientales en México y el extranjero.

El curso constará de clases de dos horas y medio cada día. Durante los primeros 1.5 horas habrá presentaciones por los coordinadores del curso o profesores invitados de temas específicas, seguido por un break de 15 minutos. En las últimas 45 minutos de la clase, un alumno tendrá que presentar y liderar una discusión sobre el articulo asignado al grupo por el profesor. Habrá una salida a campo de un día completo para conocer los actores relevantes, las actividades y la historia de un programa de pago por servicios hidrológicos activo en la cuenca del Río Pixquiac.

Conocimientos básicos de Ecología (equivalente a un año de estudios de posgrado) y la capacidad de leer 2-3 artículos (la mayoría en Inglés) por día.

El curso está dirigido en particular a alumnos en la fortaleza de ecología, manejo de recursos naturales y conservación. Sin embargo, también debe proporcionar conocimiento valoroso para alumnos en las demás fortalezas.

• Participación activa en las discusiones de las lecturas, y los temas presentados por los profesores invitados y los artículos asignados (15%)
• Examen final de ensayo sobre temas selectos del material presentado  (50%)
• Presentaciones de árticulos claves al grupo de alumnos y profesores (35%)

• Introducción al curso y avances recientes en el estudio de los servicios ambientales (R. Manson, INECOL: 1 días)
• Desarrollo historico del concepto de servicios ambientales (Santiago Tort, IIE-UNAM: 1)
• Métodos de valoración económica (R. Manson, INECOL: 1)
• Servicios selectos: ecoturismo en el monitoreo de aves en Rio de Rapaces (Kashmir Wolf, Pronatura Veracruz: 1)
• Servicios selectos: manejo holístico de plagas y enfermedades en cafetales (Juan Francisco Barrera, ECOSUR: 1)
• Protección contra tormentas (Octavio Pérez-Maqueo, INECOL: 1)
• Servicios hidrológicos I: Bases sobre hidrología de cuencas I: procesos afectando el régimen de caudales y calidad de agua; Cuantificando servicios hidrológicos con una herramienta de modelación hidrológica (SWAT) (Susana Alvarado, INECOL y Sergio López, FMCN: 1)
• Servicios hidrológicos II: Servicios hidrológicos: evapotranspiración y la cuenca “al revés” (Susana Alvarado, INECOL: 1
• Servicios hidrológicos III: cuantificación y valoración en InVEST (Pierre Mokondoko, IIE-UNAM: 1)
• Consideraciones en la creación operación de programas de PSH (Robert Manson, INECOL: 1)
• Salida a campo para conocer programas de pago por servicios hidrológicos en Coatepec y Xalapa (R. Manson y Tajin Fuentes Gina Vidriales, SENDAS: 1)
• Servicios selectos: conservación de la biodiversidad (Robert Manson, INECOL: 1)
• Servicios selectos: polinización y tendencias mundiales (Taylor Ricketts, Univ. Vermont: 1)
• Servicios selectos: polinzadores y polinización en México (Rémy Vandame, ECOSUR: 1)
• Servicos selectos: belleza escenica en la zona costera (Debora Lithgow, INECOL: 1)
• Servicios selectos: control biológico de plagas (Rodrigo Lasa, INECOL: 1)
• Servicios selectos: fertilidad de suelos en cafetales (Isabelle Barois, INECOL: 1)
• Servicios selectos: fertilidad y hongo microrricicos en milpas (S. Negrete, INECOL: 1)
• Servicios selectos: principios básicos y métodos de medición de sucuestro de carbono (Robert Manson, INECOL: 1
• Servicios selectors: evolución de mercados de carbono y otros mecanismos financieros (Renée González Montagut, FMCN: 1)
• Examen de ensayo (Robert Manson y Susana Alvarado, INECOL: 1)

Cubrir los siguientes tema durante el desarrollo del curso de campo:

1. Métodos para el estudio de Mamíferos (roedores, lagomorfos, quirópteros, ungulados, carnívoros), Aves y Reptiles
2.  Estimaciones Poblacionales Métodos directos- Conteos, trampeos Métodos indirectos - Huellas, excretas, estaciones olfativas, registros acústicos. Programas para estimar densidad poblacional
3. Monitoreo de la salud: Conceptos de ecología de la enfermedad, Técnicas de colecta de muestras biológicas en fauna silvestre. Procedimientos de campo para el estudio de las enfermedades y el estado de salud.
4. Radiotelemetría Principios teóricos y prácticos de esta técnica Estimación de ámbitos hogareños Patrones de actividad
5. El hábitat Principios teóricos Características del hábitat para alimentación, cobertura y agua Métodos para medir las diferentes variables del hábitat Uso del hábitat

Específicas para cada grupo de vertebrados: métodos directos e indirectos. Métodos para caracterizar el hábitat: líneas de Canfield y cuadrantes centrados en puntos.

Tener estudios de licenciatura en biología, Veterinaria, o carreras relacionadas

Tener el conocimiento básico para el estudio de poblaciones de vertebrados y su hábitat. 

EVALUACIÓN:

El 50% es la práctica individual, 40% informes de las prácticas y 10% participación.

CALENDARIO DEL CURSO

3  marzo

9:00-10:00 Introducción al curso. Dra. Sonia Gallina,

10:00-11:00 Métodos para el estudio de anfibios y reptiles MC. Adriana Sandoval

11:00-13:00 Métodos para el estudio de la tortuga del bolsón de Mapimí: Dr. Luis García Feria

4 marzo

09:00-11:00 Técnicas para el estudio sobre Aves Dr. Fernando González 

11:00-13:00 Métodos para el estudio de Murciélagos Dr. Antonio Guillén

5 marzo

9:00-10:30 Método para el estudio de roedores y carnívoros (Long Term Ecological Research) Dr. Alberto González

10.30-12:30 Método del uso de Cámaras-trampa automatizadas Dra. Eva López-Tello

12:30-13:30 Principios básicos de ecología de la enfermedad para el manejo de fauna silvestre Dr. Luis García Feria

6-7 marzo

07:00 Salida a la Reserva de la Biosfera Mapimí

8-10 marzo

Estimaciones de Abundancias Relativas de la tortuga del Desierto y su hábitat 

Dra. Sonia Gallina,      MC. Adriana Sandoval,  MC. Jorge Ramos

Dr. Luis García Feria

GPS e Introducción a SIG, MC. Adriana Sandoval

11-19 de marzo

Práctica de Aves, Dr. Fernando González 

Estimaciones Poblacionales

Métodos Directos para el estudio de la comunidad de roedores en dos ambientes: pastizal y matorral, Dr. Alberto González

Transectos en línea para estimar densidad de lagomorfos en dos ambientes: pastizal y matorral, Dr. Alberto González

Métodos Indirectos como estaciones olfativas para el estudio de Carnívoros, Dr. Alberto González

Práctica sobre el uso de Cámaras-trampa automatizadas. Dra. Eva López

Práctica de Murciélagos (19-21 de marzo), Dr. Antonio Guillén

12-19 marzo

Técnicas indirectas para estimar poblaciones de Ungulados y su hábitat, Dra. Sonia Gallina

Metapoblaciones, Dr. Gerardo Sánchez

El hábitat - Principios teóricos y prácticos. Métodos para medir las distintas variables del hábitat, Dra. Sonia Gallina

Uso de drones para estudios del habitat, Dr. Dante Hernández

Métodos estadísticos empleados para analizar los datos, Dr. Gerardo Sánchez

Revisión de los métodos cualitativos y cuantitativos más aplicables para complementar estudios ecológicos, M. C. Jorge Ramos

Métodos Directos con el uso de trampas.Tomahawk para mamíferos medianos, Dr. Alberto González

Plática: Radiotelemetría, Dr. Luis García Feria

Practica: Uso de la Radiotelemetría, Dr. Luis García Feria

Sistemas de información geográfica como herramientas para el análisis de distribución e interpolación de variables ambientales. MC. Adriana Sandoval

20-23 marzo

Desarrollo de los Proyectos individuales

24-25 marzo

Regreso de Mapimí a Xalapa

26-30  marzo

Análisis de datos y preparación de las prácticas grupales

31 marzo

Entrega Practicas Individuales y grupales. Presentación Proyectos.

1) Entender la terminología de taxonomía integrativa y sus aplicaciones. 2) Entender los diferentes algoritmos para estimar un árbol filogenético. 3) Aplicar diferentes herramientas para la delimitación de especies con datos moleculares. 4) Reconocer diferentes herramientas para estudios morfológicos y ecológicos en la delimitación de especies de helmintos parásitos.

Es un curso teórico-práctico. En cada sesión teórica se discutirán los fundamentos con base en lecturas de artículos científicos. Después, en cada sesión práctica, se implementarán diferentes algoritmos y se discutirán los resultados para su interpretación.

Contar con un equipo portátil de cómputo con conexión a red inalámbrica. De preferencia mayor a 12 núcleos.

Capacidad de pensamiento crítico, trabajo por cuenta propia y destrezas básicas para el trabajo por computadora.

Asistencia y participación 20%; control de lecturas 20%; ejercicios prácticos 20%; trabajo final 40%.

1) helmintos parásitos. 2) introducción a la taxonomía integrativa. 3) características generales de los datos moleculares: ADN; alineamiento de secuencias; genes codificantes y no codificantes; nucleótidos; codones, aminoácidos; tipos de sustituciones; homología de datos moleculares; genómica en gusanos parásitos. 4) métodos de reconstrucción filogenética: parsimonia; modelos de sustitución; máxima verosimilitud; apoyo de ramas; inferencia bayesiana. 5) delimitación de especies con datos moleculares: taxonomía numérica; taxonomía molecular; DNA barcoding; Multispecies coalescent (MSC); Machine learning; ABGD (Automated Barcode Gap Discovery); GMYC (General Mixed Yule Coalescent); PTP (Poisson Tree Process); Bayesian Phylogenetics and Phylogeography (BPP); Bayes factor; Phylogeographic Inference Using Approximate Likelihoods (PHRAPL); delimitación de especies con datos genómicos; delimitación de especies con introgresión (Msci). 6) datos morfológicos: obtención de datos morfométricos en gusanos parásitos; análisis de varianza (ANOVA, MANOVA); análisis de componentes principales (PCA); análisis discriminante (DFA); identificación taxonómica automatizada. 7) datos ecológicos: GBIF; modelos de nicho ecológico en gusanos parásitos; conservadurismo/divergencia de nicho; análisis de K-medias; modelos de nicho en organismos de vida libre vs. parásitos. 8) unificando la taxonomía integrativa; la taxonomía es integrativa, no minimalista.

Lograr que el alumno se famliarice con el uso de SIG y entienda su potencial en la investigación científica.

Presentacion en aula de los fundamentos de los SIG y sus principales menús o herramientas en clase. Cada viernes los alumnos presentarán artículos científicos previamente seleccionados que hallan empleado SIG en alguna investigación ecológica, discutiendo entre todos aspectos metodológicos y sus resultados.

Conocimientos básicos de geografía o cartografía. Matemática básica.

Manejo de computadora y programas complejos, de preferencia uso de Excel o bases de datos y programas de diseño gráfico o graficadores. Lectura y comprensión del inglés Razonamiento Lógico-Matemático claro Nociones básicas de geometría y cartografía

a) Proyecto SIG a entregar al finalizar el curso (50% de la calificación) b) Tareas sobre aspectos cubiertos en clase (dos durante el curso; 20%) c) Exposición de un artículo por estudiante (20%) d) Exposición de un podcast sobre SIG (5%) e) Participación en clase y en discusión de artículos (5%)

Introducción a los SIG
Sistema base 2
Archivos de tipo binario y de tipo ascii
La forma de la tierra y sistemas coordenados sobre elipsoides terrestres

Interfaz de ArcGis

Archivos vectoriales
Características de los archivos vectoriales: Geometría, extensión (Xmin, Xmax, Tmin, Ymax), sistema coordenado, # de registros, numero de campos.
Proyecciones cartográficas: Sistema coordenado de la capa vectorial vs. Sistema coordenado del frame
Edición en el frame
Símbolos para puntos, líneas y polígonos
Simbología para campos tipo texto y para campos numéricos
Consultar atributos de un elemento vectorial
Etiquetas automáticas
Selección en capas vectoriales
Selección manual en puntos, líneas y polígonos
Selección por atributos en puntos líneas y polígonos
Selección entre temas
Tablas de atributos, calculadora de campos
Actualización de tablas de atributos
Crear, borrar, hacer invisible un campo
Calcular un campo nuevo (numérico y/o texto) usando la calculadora de campos
Unir tablas de atributos (Join)
Resumir usando algún atributo (summarize)
Operaciones con vectores: Buffer / Disolver / Cortar / Intersectar
Digitalización: Digitalizar puntos, líneas y polígonos
Ejercicios diversos con vectores
? Convertir de Google Earth a ArcGis y viceversa
? Calcular el cambio en la vegetación entre dos fechas
? Hacer matriz de incidencias
? Seleccionar parcelas al azar
? Calcular un índice de heterogeneidad de uso del suelo sobre todos los municipios de Veracruz
Editar un mapa

Archivos Raster
Características de los archivos raster: Profundidad del Pixel, # renglones, # columnas, # bandas, # campos en la tabla de atributos, extensión, sistema coordenado.
Proyecciones cartográficas: Proyectar archivos raster
Rasterizar y vectorizar: Polygon to Raster / Polyline to Raster / Point to Raster / Raster to polygon / Raster to polyline / Raster to point
Edición en el frame: Simbología (colorear un raster) / Ver valor de una celda
Extracción en capas raster: Extracción por atributos / Extraer por polígono / Extraer valores a puntos
Procesos en capas raster
Geocolocar un raster
Hacer un mosaico
Reclasificar
Float to Integer
Remuestrear
Calcular orientación de laderas
Calcular la pendiente del terreno
Obtener curvas de nivel
Calcular un iluminador hipotético
Algebra de rasters
Distancia euclideana a vectores
Densidad de puntos o líneas
Estadísticas de una variable continua al interior de polígonos
Estadísticas de una pila de rasters
Algunos métodos de interpolación:
i. IDW
ii. Spline
iii. Krigging
iv. Vecino Natural
Ejercicios diversos con rasters
? Calcular la pendiente media y la pendiente media ponderada de un río.
? Hacer una cuenca
? Proponer y calcular un índice de presión a los recursos naturales
? Calcular un cambio de vegetación usando rasters de dos fechas
? Evaluar una función exponencial cuyo exponente contiene rasters de tipo lineal, cuadrático, umbral y bisagra
? Evaluar la altura media del dosel usando información LIDAR
? Calcular la probabilidad de que el uso del suelo cambie, usando una regresión logística sobre algunas variables explicativas (distancia a caminos, pendientes, población, etc…)
? Obtener un mapa de distribución de una especie, usando la técnica de Bioclim manualmente.

Imágenes de Satélite
Ejecutar una clasificación NO supervisada en ArcMap
Ejecutar una clasificación SUPERVISADA en ArcMap

Programación Model Builder, Phyton, R
Ejercicio de presión a los recursos, construirlo en model Builder
Mapas en R: Algunas librerías para trabajar con archivos vectoriales y archivos raster en R
Traslape de especies Hacer un programa en Phyton para contestar la pregunta: ¿Cuántas especies indicadoras son las mínimas necesarias para reproducir la distribución del Bosque Mésófilo?

Temas selectos (podrían variar de acuerdo a la disponibilidad de tiempo)
Clasificación de imágenes de Satélite: Usando la técnica de Random Forest en Ecognition.
Escenarios futuros para el uso del suelo: Cadenas de Markov y autómatas celulares
INVEST: Software con modelos para evaluar servicios ambientales.
Conectividad del paisaje: a. Circuitscape; b. Corridor designer; c. Conefor
Indices de fragmentación: Fragstats y/o Patch Analyst

Cambio de cobertura y usos del suelo (cambio entre dos fechas; matriz transicional).

1. Revisitar de manera crítica los orígenes de la Ecología en el contexto de la ciencia occidental-moderna.
2. Dilucidar las cargas coloniales, raciales y las violencias de conocimiento asociadas al desarrollo de la Ecología.
3. Discutir enfoques de frontera que se plantean la descolonización de la Ecología tanto en los ámbitos educativos como en el ejercicio de la investigación científica.
4. Forjar una postura crítica-constructiva en torno a las prácticas personales, institucionales y colaborativas que se requieren construir para que las y los estudiantes comiencen a transitar hacia enfoques y prácticas decoloniales en su quehacer académico dentro de la Ecología.

El curso se regirá bajo un ambiente de discusión de ideas y propuestas. En la primera sesión los coordinadores presentarán sus enfoques de investigación a las y los estudiantes, así como las motivaciones que llevaron a la organización del curso. Cada sesión de clase estará organizada en torno a una temática de interés y a lecturas correspondientes que la informan. Para el desarrollo de las mismas, un(a) estudiante, en coordinación con alguno de los coordinadores, será el responsable de organizar una dinámica de discusión grupal de la temática con base en la literatura facilitada. Además, a lo largo del curso, se contará con la participación de cuatro profesores invitado(a)s que contribuirán al debate grupal de la sesión a la que sean convocado(a)s. Al término de la clase, el o la estudiante responsable de la sesión desarrollará una ficha informativa en la que plasme los puntos centrales del debate grupal, mismas que serán utilizadas para la elaboración de la nota científica colectiva que constituye el trabajo final del curso. 

• Disponibilidad de tiempo para atender íntegramente la carga académica del curso.
• Formación a nivel de grado o posgrado preferentemente en Ecología, Biología o alguna otra área del conocimiento relacionada con las ciencias naturales y ambientales.

• Capacidades de análisis de textos científicos.
• Interés por el debate crítico.
• Disposición hacia el trabajo en equipo.

• 20% Asistencia
• 30% Participación en clase
• 50% Nivel de contribución al trabajo final*.

*El trabajo final del curso consistirá en la redacción grupal de una nota científica sobre algunos aspectos de la descolonización de la Ecología, la cual será sometida a publicación en co-autoría a una revista internacional indexada líder en la investigación ecológica.  

Obtener un conocimiento profundo sobre el papel del fuego en ecosistemas a nivel global.

Reconocer los principales ecosistemas mexicanos dependientes al fuego y sus principales características.

Familiarizarse con la preparación de manuscritos sobre los resultados de sus experimentos en campo.

El curso se desarrollará mediante presentaciones presenciales y/o en línea del profesor del curso y de los profesores invitados. Se complementará con una salida de campo a un pastizal natural en el cofre de Perote en el municipio de Ayahualulco. Esto permitirá al estudiante tener un conocimiento más cercano con los ecosistemas dependientes al fuego, adaptaciones de especies al fuego y la problemática por la que atraviesan estos ecosistemas. Durante la salida de campo los estudiantes tendrán que realizar de manera individual un experimento sobre ecología del fuego, para después reportar los resultados a manera de artículo científico (corto) en inglés, siguiendo las normas editoriales de la revista Ecology de la Ecological Society of America (ESA). Al final de la clase presentarán los resultados a sus compañeros. 

Conocimientos básicos de ecología y estadística.

Comprensión de textos en inglés, capacidad de escribir un manuscrito corto en inglés, ya que tendrán que presentar los resultados de su experimento a manera de artículo científico en inglés.

Asistencia 20%, manuscrito 60%, presentación resultados 20%

• Importancia de la ecología del fuego
• Fuego y disturbios naturales y humanos
• Propiedades físicas del fuego y su relación con los ecosistemas
• Taller de estadística
• Adaptaciones de especies de plantas al fuego
• Fuego a escala de poblaciones
• Fuego a escala de comunidades
• Fuego a escala ecosistema: regímenes de fuego
• El fuego en los ecosistemas del mundo
• Regímenes de fuego alterados en México y el mundo
• Restauración en ecosistemas dependientes al fuego

1. Introducir a los estudiantes a los conceptos teóricos de cromatografía de líquidos y espectrometría de masas
2. Introducir a los estudiantes a los conceptos de metabolómica, metabolómica no dirigida y dirigida.
3. Proveer a los estudiantes de las herramientas teórico computacionales para la identificación de marcadores químicos.
4. Proveer a los estudiantes de las herramientas teórico computacionales para la identificación de rutas de biosíntesis enriquecidas.

Se haran uso de métodos teóricos computacionales, softwares y  bases de datos espectrales de acceso libre, tales como METABOANALYST, MASSBANK, METLIN, CHEMSPIDER, entre otros.

Conocimientos básicos de computo. Profesionista o estar cursando las carreras de Lic. en Biología, Ciencias Agropecuarias, Moleculares, Alimentarias y afines.

Conocimientos básicos de cómputo, estadísticas y química orgánica.

Se discutirán ejemplos selectos utilizando bases de datos internas. Se espera que los estudiantes sean capaces de obtener los resultados esperados posterior al procesamiento de estos datos.

Asistencia 100% obligatoria.

Contenido Temático (total 40 horas)

1. Introducción a la cromatografía de líquidos acoplada a la espectrometría de masas (10 h).

            1.1. Principios de la cromatografía de líquidos (2.5 h).

            1.2. Principios de la espectrometría de masas (2.5 h).

            1.3. Tipos de análisis metabolómicos (3 h).

            1.4. Revisión de ejemplos selectos (2 h).

2. Análisis de datos metabolómicos (7 h).

            2.1. Obtención de la matriz de datos (2 h).

            2.2. Análisis estadísticos comparativos de datos metabolómicos no dirigidos.

                        2.2.1. Análisis de componentes principales (1.5 h).

                        2.2.2. Mapas de calor (1.5 h).

            2.3. Revisión de ejemplos selectos (2 h).

3. Identificación de marcadores químicos (7 h).

            3.1. Análisis de “Fold Change” (2 h).

            3.2. Obtención de gráficos tipo volcán (2 h).

            3.3. Análisis discriminantes supervisados (1 h).

            3.4 Revisión de ejemplos selectos (2 h).

4. Identificación de metabolitos (7 h).

            4.1. Identificación por RMN (3 h).

            4.2. Identificación por espectrometría de masas (2 h).

            4.3 Revisión de ejemplos selectos (2 h).

5. Identificación de rutas metabólicas (9 h).

            5.1. Análisis de enriquecimiento de rutas (2 h).

            5.2. Análisis funcionales (2 h).

            5.3. Integración de datos ómicos (1 h).

            5.4 Revisión de ejemplos selectos (3 h).

Proporcionar el conocimiento de los conceptos básicos teóricos y prácticos de la ciencia del suelo

Proporcionar el conocimiento teórico y práctico sobre las propiedades del suelo y la metodología para evaluarlos en campo y en el laboratorio.

Exposición de clases por parte de investigadoras e investigadores internos y externos de sus áreas específicas de conocimiento. Además, se realizará una práctica de campo (2 días) y de laboratorio (4 días). Los estudiantes realizarán un trabajo final evaluando el suelo en base a los resultados obtenidos en la práctica de campo y del laboratorio.

Tener licenciatura en temas afines

Manejo de Word y Excel, PowerPoint básico, ingles (lectura)

• Asistencia 20%
• Participación en clase y en campo 25%
• Practica del laboratorio 20%
• Trabajo final 35%

1. Edafología. Suelo, definición y principales componentes

2. Génesis del suelo

1. Factores de formación
2. Procesos de formación
3. Desarrollo del perfil del suelo, Memoria del suelo
4. Descripción de un perfil del suelo
5. Clasificaciones internacionales del suelo
6. Paleopedología

3. Propiedades físicas del suelo

1. Textura
2. Estructura y Porosidad.
3. Densidad real y aparente
4. Agua en el suelo. Zona Critica. Suelo en el ciclo global del agua.

4. Propiedades químicas del suelo

1. pH, Acidez total e Intercambiable
2. Intercambio de cationes y aniones
3. Mineralogía del suelo
4. Elementos químicos en el suelo

5. Propiedades biológicas y bioquímicas del suelo

1. Ciclo de Carbono
2. Ciclo de N
3. Otros ciclos
4. Materia orgánica, vegetación
5. Organismos: macro, meso, micro
6. Actividad microbiana y enzimática del suelo.

6. Servicios ecosistémicos y funciones del suelo

1. Ciclos Biogeoquímicos
2. Fertilidad, manejo agroecológico.
3. Biodiversidad
4. Material de construcción
5. Registro de paleoambiente
6. Bioindicadores

7. Indicadores de calidad del suelo
   

Parte práctica:

Salida a campo

Explicación del contexto de tratamiento en las parcelas experimentales (Guadalupe Williams),

Descripción del suelo, muestreo, clasificación

experimentos con infiltrómetro, cámara de gases

Trabajo en laboratorio: pH, CE, MO, humedad, textura, cationes int, C, N, P

Actividad enzimática

Análisis de macrofauna

Desarrollar las habilidades necesarias para poder realizar sus muestreos en campo de forma segura, esto lo realizaremos a través del aprendizaje en una experiencia vivencial de alto nivel y entrenamiento teórico-práctico.

Aprender la técnica de posicionamiento básico de trabajo: caminar en los brazos/ramas; instalación de puntos de anclaje y redirecciones.

Realizar inspecciones del árbol previas a la escalada conducida por un asistente.

Diferenciar entre el equipo apropiado para trepar a los árboles, y el equipo que es similar en apariencia, pero no adecuado para el soporte de vida en los árboles.

Las clases serán presenciales, el curso tiene una duración de 4 días, en modalidad intensivo 8 horas diarias. El 80% del curso será en campo aplicando las diferentes técnicas de ascenso. Los días de clase serán de lunes a jueves de 9:00 a 17:00 hrs. Las clases prácticas se realizarán en lugares cercanos al la sede de Pátzcuaro del INECOL, el examen final se realizará en el Parque Barranca del Cupatitzio.  Es importante considerar que derivado de la demanda de este tipo de cursos en el Centro de Bajío del INECOL, el curso se llevará acabo al 100% en Pátzcuaro y por las características del mismo es presencial.

Ninguno

No se requiere experiencia previa para el ascenso a los árboles, es recomendable tener una condición física aceptable y no tener miedo a las alturas

Asistencia a las clases teóricas y prácticas (50%), aprobar el examen final que será práctico (50%)

• Inroducción a la ecología del dosel
• Principales técnicas de muestreo en el dosel
• Evaluación de conjunto o panorámica
• Evaluación del terreno
• Evaluación del tronco
• Evaluación de la copa
• Diferentes técnicas de trepa
• Nudos y amarres
• Manejo de cuerda
• Equipo de trepa
• Cuidados y mantenimiento de equipo
• Manejo de equipo de seguridad

- Introducir al estudiante a los conceptos teóricos de bioquímica, biología molecular, proteómica, metabolómica y las principales aplicaciones en el área biomédica y agrícola.

- Mostrar o describir las principales técnicas en biología molecular, bioquímica, metabolómica y su aplicación en la investigación científica.

El curso será impartido en sesiones I) teóricas para cada tema, II) sesiones de laboratorio para la realización de extracción de ADN, PCR, cuantificación de proteínas, pruebas de bioactividad, actividad enzimática, III) sesiones in silico para análisis bioinformático de secuencias de ADN, para el estudio de proteínas y edición de genes, IV) Síntesis y discusión de temas desarrollados por estudiantes.

Egresados de QFB, Biología, Bioquímica, Biotecnología y áreas afines u otros interesados en el estudio de hongos por medio de las ciencias ómicas.

Conocimientos básicos de cómputo y de laboratorio, capacidad de análisis y síntesis de información.

Para la evaluación se tomará en cuenta la asistencia y puntualidad (30%), participación en laboratorio (40%) y exposición de trabajo final (30%).

1. Biodiversidad y Sistemática de macrohongos.
2. Sistemática y riqueza biocultural como base para la investigación y aprovechamiento biotecnológico de los hongos.
3. Uso de la biología molecular en el estudio de macrohongos silvestres
4. Uso de la proteómica en el estudio de macrohongos silvestres
5. Aplicaciones de la metabolómica para el estudio integral de macrohongos silvestres
6. Metabolismo secundario
7. Edición genética
8. Aplicaciones biomédicas y fitosanitarias de hongos macro y microscópicos
9. Ciencias ómicas en el estudio de simbiosis ectomicorrícica

* Conocer los grupos de insectos acuáticos y ser capaz de identificar los órdenes y principales familias de este grupo.

* Conocer los principales aspectos relacionados con la biología, morfología y papel ecológico de los insectos acuáticos.

* Conocer y entender los principales conceptos relacionados con los ecosistemas dulceacuícolas, así como sus características físicas y químicas.

* Conocer e implementar la metodología apropiada para realizar muestreos sistematizados de insectos acuáticos.

* Conocer e implementar pruebas estadísticas para el análisis de los datos obtenidos.

Las sesiones estarán divididas en dos partes (mañana y tarde). Por la mañana los profesores abordarán la parte teórica del curso, donde se tratarán las generalidades sobre biología, morfología, diversidad, sistemática e importancia ecológica de los órdenes y familias de insectos acuáticos, así como los principales métodos de recolecta y pruebas estadísticas para analizar datos recabados en campo. El tercer día del curso se llevará a cabo una salida de campo al Río Huehueyapan, en el municipio de Coatepec, Veracruz, donde los alumnos recolectarán insectos acuáticos conforme a las metodologías expuesta en clase. Durante las sesiones prácticas de la tarde los estudiantes llevarán a cabo la identificación taxonómica a nivel de familia de los ejemplares recolectados en campo, así como de ejemplares que se les proporcionarán para complementar la muestra, mismos que serán utilizados para la elaboración de una colección entomológica.

Los alumnos interesados deberán contar con conocimientos básicos de entomología. 

Conocimiento del uso de claves dicotómicas.

* Puntualidad y asistencia a clase (90% para tener derecho a exámenes y entrega de colección entomológica)

* Examen práctico 40% (identificación a nivel de familia)

* Discusión de artículos científicos y participación en clase 20%

* Colección entomológica 40%

Día 1 Introducción

Ambientes dulceacuícolas: aspectos físicos y químicos. Insectos acuáticos: órdenes, biología, morfología, evolución e importancia ecológica. Biomonitoreo. Función de los insectos en los ecosistemas.

Día 2 Muestreo y métodos estadísticos

Tipos de muestreo, equipo de recolección utilizado en campo y distintas pruebas estadísticas para analizar la información recabada.

Día 3 Salida de campo

Vistita al Río Huehueyapan (Coatepec, Veracruz) para recolectar insectos acuáticos.

Día 4 Odonata y Ephemeroptera

Generalidades sobre biología, morfología, diversidad, sistemática, importancia ecológica e identificación taxonómica de las principales familias.

Día 5 Collembola, Orthoptera y Plecoptera

Generalidades sobre biología, morfología, diversidad, sistemática, importancia ecológica e identificación taxonómica de las principales familias.

Día 6 Hemiptera, Mecoptera, Neuroptera y Megaloptera

Generalidades sobre biología, morfología, diversidad, sistemática, importancia ecológica e identificación taxonómica de las principales familias.

Día 7 Trichoptera y Lepidoptera

Generalidades sobre biología, morfología, diversidad, sistemática, importancia ecológica e identificación taxonómica de las principales familias.

Día 8 Hymenoptera y Coleoptera

Generalidades sobre biología, morfología, diversidad, sistemática, importancia ecológica e identificación taxonómica de las principales familias.

Día 9 Diptera

Generalidades sobre biología, morfología, diversidad, sistemática, importancia ecológica e identificación taxonómica de las principales familias.

Día 10 Colección entomológica y examen

Sesión para trabajar en la colección entomológica por la mañana y por la tarde aplicación de examen.

Que el estudiante aprenda y discuta la teoría y las metodologías para estudiar el comportamiento animal desde una perspectiva ecológica y evolutiva. Que conozca distintas aplicaciones del estudio de la conducta y sea capaz de realizar estudios de comportamiento con su organismo de estudio.

Clases teóricas, discusión de artículos, planteamiento y ejecución de proyectos, redacción de ensayos. 

Conocimientos básicos de ecología y evolución. Estudiantes con convenio solo pagarán el 50%, estudiantes sin convenio cubrirán el 100% de la cuota del curso.

Conocimientos básicos de ecología y evolución. 

Ensayo/Reporte (60%), Presentación de artículos (20%), participación en clase (20%) 

Selección natural y la función de la conducta. Selección individual y de grupo. Adecuación inclusiva, selección de parentesco y altruismo.  Desarrollo y genética de la conducta Mecanismos de la conducta. Aprendizaje y memoria. Cuidado parental / Conflicto padre-hijo. Conducta social Alimentación. Depredación y conductas antidepredatorias. Comunicación Influencia de los parásitos en la conducta Selección sexual (introducción). Conflicto sexual Elección críptica de las hembras. Competencia espermática. Sistemas de apareamiento. Estrategias alternativas de apareamiento. Conducta y conservación en un mundo cambiante. Selección sexual y especiación. Conducta y control de plagas. Conducta y control de vectores. Selección sexual en humanos  

Que el alumno aprenda los fundamentos y las técnicas de laboratorio para el análisis químico de agua, suelo, plantas y gases. Que el alumno aprenda a realizar y analizar reportes de laboratorio. Que el alumno aprenda a realizar aislamientos, cultivos y cinéticas de crecimiento de microalgas, cianobacterias, hongos y plantas. Que el alumno aprenda las técnicas de laboratorio para trabajar con de germoplasma de distintos microorganismos

En el curso participarán profesores de la Red de Manejo Biotecnológico de Recursos, cada uno de ellos tendrá sesiones teóricas con presentaciones y discusión de bibliografía, así como prácticas de laboratorio relacionadas al tema que impartan.

El curso tendrá una duración de 4 semanas e iniciará con una breve reunión de las coordinadoras con los estudiantes para explicarles la metodología del curso, los criterios de calificación y el formato de los reportes de las prácticas. Cada tema iniciará con las sesiones teóricas que tendrán, por lo general, una duración de 1h por tema y solo en algunos casos durarán más de 1h. En total serán 21 horas de teoría. Después de las sesiones teóricas iniciarán las prácticas de laboratorio, las cuales cubren un total de 99h y se realizarán en los laboratorios de la Red Manejo Biotecnológico de Recursos con apoyo de los técnicos de la misma Red.

Durante el curso se tiene dos días de asueto (1 y 5 de mayo) por eso se reduce a 18 días de clase con 7 horas diarias, en total serán 126, pero habrá días que saldrán más temprano.

Se requiere que los estudiantes estén inscritos en el programa del posgrado del INECOL o de otras instituciones en áreas químico-biológicas o similares.

Conocimientos básicos de equipo de laboratorio y bases de química y biología.

Asistencia- 5 %; Reportes de prácticas de laboratorio-80 %; Examen 15 %.

Los reportes de las prácticas se deberán elaborar de forma individual

Habrá un examen de repaso al final de cada semana

Tema I. Conceptos y prácticas relevantes de Química Analítica

2.1 Principios de química analítica cualitativa y cuantitativa

2.2Principios y aplicaciones de Espectrofotometría UV-Vis

2.3 Análisis químico del suelo y plantas- muestreo de suelos, muestreo de plantas, procesamiento de las muestras

2.4 Muestreo de cuerpos de agua contaminados y análisis químico de agua

2.5 Análisis de polisacáridos constituyentes de la pared vegetal (celulosa, hemicelulosa, lignina)

2.6 Digestión de biomasa y espectroscopia de absorción atómica

2.7 Principios y aplicaciones de cromatografía de gases para el análisis de gases de efecto invernadero

2.8 Principios y aplicaciones de cromatografía iónica

2.9 Fundamentos de los analizadores de carbono

Tema II. Conceptos y prácticas relevantes de Bioquímica y Microbiología.

2.1 Determinación de enzimas celulolíticas producidas por hongos en fermentación en estado sólido.

2.2 Microalgas y cianobacterias. Aspectos generales de cultivo. Cinética de Crecimiento. Composición Bioquímica

2.3 Desarrollo apical y factores de crecimiento en hongos filamentosos

2.4 Caracterización in vitro de hongos filamentosos

Tema III Técnicas de aislamiento y conservación

3.1 Plantas vasculares.  Técnicas de cultivo de tejidos para el estudio, conservación y propagación de plantas vasculares. El uso del cultivo de tejidos vegetales como herramienta para estudios omicos

3.2 Técnicas generales de aislamiento de hongos, medios de cultivo para optimizar crecimiento. Conservación de hongos: técnicas de conservación por corto y largo tiempo (liofilización, criogenización).

1. Adentrarse a las bases epistémicas y al aparato conceptual de las investigaciones socioecológicas.
2. Familiarizarse con las principales escuelas de pensamiento socioecológico.
3. Conocer las pautas de diseño y análisis de investigaciones socioecológicas.
4. Adquirir habilidades metodológicas para el desarrollo de herramientas participativas y multiactorales.
5. Reflexionar las posibilidades y retos de transitar hacia aproximaciones multi-inter y transdisciplinares en los procesos investigativos.
6. Fortalecer las capacidades de pensamiento crítico, discusión académica informada y redacción de textos científicos. Integrar el discernimiento teórico con el desarrollo de habilidades prácticas para el diseño, la implementación y el seguimiento de herramientas analíticas participativas y multiactorales de investigación en diferentes áreas socioecológicas de estudio.

El curso se desarrollará a partir de un balance entre la dimensión teórica y la práctica. Posterior a la introducción/actualización teórica, cada sesión será acompañada de la lectura de un artículo científico que contextualice la pertinencia y aplicaciones de la herramienta en función dentro de las investigaciones socioecológicas, para posteriormente familiarizarse con la disposición de los datos, el empleo de software y el tipo de análisis que es posible desarrollar con las herramientas revisadas. Dentro del curso se priorizará que los estudiantes trabajen con datos de sus investigaciones y que las visualizaciones y análisis a entregar en el trabajo final tengan formatos de alta calidad académica, de tal manera que puedan ser incorporados como resultados dentro de sus tesis o sirvan como insumos para la redacción de manuscritos científicos.

• Disponibilidad de tiempo para atender íntegramente la carga académica del curso.
• Formación académica en algún área de las ciencias ambientales y/o sociales.
• Desarrollo de una tesis u otro trabajo de investigación enmarcado en el área socioecológica.
• Preferentemente haber atendido el Curso de Posgrado de Inecol "Métodos de Investigación Socioecológica"

• Compresión lectora de textos en inglés.
• Interés por integrar temáticas ecológicas y sociales.
• Disposición hacia el trabajo en equipo.
• Acceso a datos empíricos de corte socioecológica (no indispensable).
• Experiencia en el uso de software y herramientas analíticas de investigación (no indispensable).

20% Asistencia

30% Participación en clase

20% Controles de lectura

30% Trabajo final 

1.Introducción a las escuelas de investigación socioecológica. 

2. ¿Cuáles son los supuestos con los que partimos?

3. Ética. Protocolos, consultas. Dilemas sociales

4.Diseño de investigación. Matriz de congruencia teórica-metodológica

5. Inicio de proceso en comunidad. Mapeo de actores, guía de observación

6. Facilitación y manejo de grupos. Organización de talleres

7. IAP y DRP

8. Técnicas de colecta de datos. Entrevistas, grupo focal. Kobos. Bases de datos (Sofía)

9. Listados y calendarios 

10. Cartografía social

11. Mapeos difuso

12. Método Q

13. Análisis de Redes Sociales

14 Análisis de Redes Sociales

15. Agenciamientos

16. Investigación artística

17. Juegos multiactorales

18. Herramientas audiovisuales

19. Monitoreo y evaluación

20. Cierre y evaluación curso

Dirigir la atención de las/los estudiantes a la aproximación experimental fundamentada en bases de datos a nivel local, regional o mundial.

Introducir a las/los estudiantes el cómo elaborar preguntas de investigación y diseño experimental para avanzar el conocimiento científico.

Reconozcan las limitaciones, sesgos y como controlarlos cuando se trata de analizar patrones y procesos con gran volumen de datos disponibles.

El curso gira en torno a prácticas guiadas por el profesor líder del curso o algunos invitados. En estas prácticas el profesor guía planteará un marco conceptual sobre el problema a resolver, definirá una o más preguntas de investigación, planteará el experimento y dirigirá o mostrará a los alumnos las bases de datos que se utilizarán. Cada estudiante ejecutará el "experimento" de forma individual. Compilación de datos, análisis de datos. Para cada ejercicio se entregará un reporte escrito con formato de una revista científica. Cada actividad cerrará con una discusión general sobre el tema investigado en la que participará el profesor guías, asistentes de curso, alumnos y coordinadores.

En la segunda parte del curso cada estudiante plantea una pregunta de investigación que se presentará al grupo para recibir retroalimentación, se ejecutará e proyecto y se presentará un reporte escrito. Estos proyectos se basan en uno o más de los Datapapers de la revista Ecology.

Ser estudiante de algun programa de posgrado.

Fundamentos de ecología.

Fundamentos de estadística.

Fundamentos de evolución.

Asistencia virtual a las sesiones (15%)

Reportes de prácticas guiadas (20%)

Discusión de resultados (20%)

Planteamiento de ejercicio individual (10%)

Reporte de proyecto individual (35%)

Ciencia Abierta.

Bases de datos.

Data papers.

Gradientes de distribución.

Química computacional.

1. Conocer las estrategias de defensa de las plantas para minimizar el consumo de sus tejidos por parte de los herbívoros.
2. Conocer las estrategias de fitófagos para acceder a su recurso y sus consecuencias para la planta hospedera.
3. Discutir las estrategias de los artrópodos carnívoros (depredadores y parasitoides) para encontrar y consumir sus presas/hospederos.
4. Comprender cómo interactúan las plantas, artrópodos herbívoros y artrópodos carnívoros en un contexto de interacciones multitróficas.

El curso será coordinado por un profesor y reforzado con la participación de especialistas en los diferentes temas del curso. Cada tema se abordará en uno a dos días y el coordinador estará presente durante todas las sesiones. El curso es teórico-practico y tiene duración de tres semanas. Las dos primeras semanas son teóricas, organizadas de la siguiente manera: clases formales y presentaciones cortas de artículos por los alumnos del tema expuesto en la clase anterior. Las presentaciones cortas tendrán una duración máxima de 12-15 minutos (+5 minutos para preguntas). En la tercera semana desarrollaremos actividades prácticas grupales en el Santuario del Bosque de Niebla sobre algunos de los temas tratados en las aulas teóricas. Cada grupo (3-4 alumnos) desarrollará un proyecto preestablecido bajo la dirección de un profesor y los resultados del proyecto se presentarán al final de la semana.

Estudiantes de posgrado. Conocimientos básicos de entomología (órdenes).

El estudiante deberá tener habilidad para la comprensión de conceptos biológicos y de textos escritos en inglés sobre las interacciones planta-artrópodo-artrópodo. Habilidad de comunicarse oralmente.

Presentación de artículos: 40%, participación en las discusiones en clase: 20, proyecto practico grupal: 40%

1) Historia evolutiva de las interacciones antagonistas planta-artrópodo. 2) Defensas en plantas: Escape y tolerancia. 3) Defensas físicas y químicas en plantas. 4) Estrategias de ataque de herbívoros. 5) Florivoría. 6)  Artrópodos carnívoros: Depredación y parasitismo. 7) Conectando plantas, herbívoros y enemigos naturales: Interacciones multitróficas.

1) Definir e introducir el concepto de las principales fitohormonas y sus funciones. 2) Proporcionar al estudiante las bases conceptuales para identificar cómo las fitohormonas contribuyen al crecimiento, desarrollo, reproducción y diversas respuestas de estrés. 3) Identificar los factores que contribuyen a la acumulación y respuesta de las fitohormonas 4) Explicar los mecanismos de percepción y transmisión de señales hormonales, los mecanismos de control de la respuesta hormonal como: cambios de concentración, sensibilidad. 5) Conocer los distintos tipos de hormonas fundamentales en las plantas y la importancia de su interacción.

La impartición del curso será teórico-práctica y se desarrollará en el aula mediante presentaciones de los profesores del curso con ayuda de audiovisuales, proporcionando información teórica y referencias bibliográficas para que los alumnos puedan profundizar en el tema. También habrá sesiones de discusión de artículos dependiendo las necesidades que se deban cubrir en cada tema. De cada uno de los temas se llevarán a cabo prácticas en el laboratorio con el objetivo de que el alumno pueda visualizar el efecto de las fitohormonas sobre algunos procesos de desarrollo y estrés en plantas.

Los interesados en el curso deberán contar con conocimientos en Biología y áreas afines con un nivel mínimo de licenciatura. Además es deseable que cuenten con conocimientos básicos de Bioquímica y de Biología celular.

Principios básicos de Biología y Bioquímica

El profesor evaluará el desempeño de cada estudiante durante todo el curso con: participación en clase (15%), discusión y presentación de artículos (25%) (previamente seleccionados por el profesor), examen teórico (40%), practicas de laboratorio (20%).

1. Desarrollo vegetal 1.1 Crecimiento y desarrollo 1.2 Patrones de crecimiento y desarrollo 1.3 Juvenilidad 1.4 Totipotencia 1.5 Principios de diferenciación 2. Fitohormonas y reguladores del crecimiento 2.1 Concepto de fitohormona y su mecanismo de acción 2.2 Puntos de regulación: biosíntesis, transporte, degradación, conjugación y vías de señalización 2.3 Participación en el desarrollo y diferentes tipos de estrés. 3. Auxinas 4. Citocininas 5. Ácido salicílico 6. Ácido abscisico 7. Giberelinas 8. Etileno 9. Jasmonatos 10. Nuevas moléculas señalizadoras 11. Interconexiones entre hormonas durante el estrés abiótico 12. Interconexiones entre fitohormonas durante el estrés biótico.

Instalación local de R y preferente algún IDE (RStudio, VS Code, etc.). Poder instalar paquetes, manejar funciones básicas, y cargar datos desde archivos y fuentes remotas.

Conocimiento básico de R, análisis de biodiversidad y datos asociados.

1) Flujos de trabajo y análisis:

– Organización de proyectos y archivos

– Buenas prácticas para nombrar archivos y objetos

– Trabajando con rutas

– Estructuras de datos

2) Manipulación y limpieza de datos

– Pasos a seguir para importar y reestructurar    tablas y archivos.

– Principios de datos ordenados (tidy data) y herramientas del ‘tidyverse’ para ordenar datos

– Expresiones regulares para trabajar con cadenas de texto

– Herramientas para trabajar con datos faltantes 

– Formas de identificar Información repetida

– Exploración rápida de datos

3) Visualización de Datos

– Introducción a ggplot2

– Representaciones gráficas de información

– Personalización de elementos gráficos (ejes, colores, fuentes, leyendas)

– Preparación de figuras científicas 

– Herramientas para exportar gráficos de alta resolución en múltiples formatos

4) Lo que nadie nos enseñó sobre R

– Entornos de trabajo y configuración

– Iteración y vectorización para evitar repetición

– Trabajando con listas

– Manejo de matrices (Gabriel)

– Atajos y herramientas para mayor eficiencia

– Significado de los errores más comunes

5) Aspectos de geografía de la biodiversidad

– Puntos, polígonos, rasters: nuevas paqueterías para manejo de datos espaciales

– Paquetes para generar mapas bivariados

– Trabajo con modelos de elevación digital

– Filogenias: manejo y visualización   

El curso brindará a los estudiantes la oportunidad de:

1) Comprender los roles ambientales y socioeconómicos de las áreas verdes urbanas y el bosque urbano.

2) Identificar los problemas, desafíos y oportunidades en torno a la infraestructura verde en ciudades.

3) Aprender sobre las diferentes metodologías para analizar, manejar y planear los diferentes componentes de infraestructura verde y bosques urbanos.

El curso se imparte de forma virtual y con sesiones de profesores invitados. La actividad en campo tiene como objetivo que los alumnos pongan en práctica una de las diferentes metodologías de análisis de bosques urbanos, además de que escriban un reporte final en formato de reporte de investigación en el que aplicarán los temas aprendidos en clase. Al finalizar el curso, los alumnos presentarán los resultados obtenidos en la práctica de campo.

Las actividades consisten en clases teóricas con discusiones en clase con los alumnos y una práctica de campo que cada alumno realizará en sus respecitivas ciudades. El curso tendrá profesores invitados de diferentes instituciones nacionales e internacionales, y abarcarán temas específicos sobre las bases teóricas de la silvicultura urbana, la relación entre bosques urbanos y la salud humana, los desafíos de la construcción y el diseño urbano y la arboricultura, la biodiversidad urbana, y percepciones de los ciudadanos.

No es necesario ningún prerequisito para tomar este curso

No es necesaria ningúna habilidad ni destreza previa para tomar este curso

El curso se evaluará con la participación en clase de los alumnos (30%), un reporte de investigación final (40%), y una presentación en clase (30%).

1. Definiciones, introducción a la disciplina de la forestería urbana.

• Introducción, descripción general y definiciones de infraestructura verde y bosques urbanos. Funciones y beneficios de la infraestructura verde y bosques urbanos.
• An urban forest: parcel by parcel. Profesora invitada Dra. Danijela Puric-Mladenovic, Universidad de Toronto, Canadá.
• Permanent city dwellers: taking care of urban trees so they can take care of us in a global climate crisis. Profesora invitada Dra. Sivajanani Sivarajah, Universidad de Laval, Canadá.

2. Biodiversidad asociada a los bosques urbanos.

• Biodiversidad: Patrones globales de la biodiversidad urbana. Homogeneización biótica. Especies nativas y no nativas, y especies invasoras.
• Impacto de la urbanización en la diversidad funcional de las comunidades de macromicetos a lo largo de un ecosistema urbano en el suroeste México. Profesor invitado Dr. Marko Gómez-Hernández. CIDIIR, Oaxaca.
• Fauna nativa en ambientes antropizados. Profesor invitado Dr. Romeo Saldaña Vázquez. IBERO, Puebla.
• Estudios en dos bosques urbanos: Planeación espacial de bosques urbanos en la Ciudad de México. Regeneración y restauración de bosques urbanos en Xalapa, Veracruz.

3. Factores que afectan las características de los bosques urbanos.

• Factores biofísicos y socioeconómicos que influyen en los patrones de diversidad de los bosques urbanos.
• Percepciones de los ciudadanos en contextos urbanos y boscosos. Profesora invitada Dra. Socorro Aguilar Cucurachi. Universidad Veracruzana.

4. Métodos y técnicas de medición y evaluación del arbolado urbano. iTree, Neighbourwoods, SIG.

• Planes de Manejo de Bosques Urbanos.
• Neighbourwoods: Protocolo para la construcción de un inventario de arbolado urbano. Teórico y práctico.
• Introducción a la identificación de las principales espeices de árboles en ciudades.

5. Manejo de bosques urbanos: criterios de poda, derribo, atención a plagas y enfermedades. 

• Arboricultura, diseño y construcción.  Profesor invitado Edgar Ojeda, arborista certificado ISA. México.

-Que el estudiante aprenda diversos técnicas para realizar el aislamiento, caracterización microbiológica e identificación de microorganismos.

-Que el estudiante conozca diversas herramientas y técnicas biología molecular y celular en el estudio del desarrollo de las plantas.

El curso práctico se llevará a cabo mediante el desarrollo de diversas prácticas de laboratorio donde el estudiante desarrolle las habilidades en el uso de técnicas en las áreas de microbiología, biología celular y molecular de plantas.

Se recomienda que el estudiante tenga una preparación básica en microbiología, biología celular, biología molecular y fisiología vegetal.

Conocimiento básico de reglas y medidas de seguridad de trabajo en el laboratorio, cultivo de microorganismos in vitro, preparación y formulación de medios de cultivo, técnicas de biología molecular en la caracterización de microorganismos.

Aspectos teóricos 10%, Campo y Laboratorio 70%, Reporte de prácticas de laboratorio 20%.

1. Aspectos teóricos del estudio de las interacciones planta-microorganismo (8 horas)
2. Colecta de material biológico en campo. Técnicas de colecta de campo para el aislamiento de bacterias y hongos microscópicos. Técnicas de preservación de muestras biológicas para su traslado al laboratorio. (12 horas)
   
3. Aislamiento, caracterización microbiológica e identificación molecular de bacterias asociadas. Métodos de cultivo para el aislamiento de bacterias, caracterización microbiológica, Tinción Gram, métodos de cultivos y obtención de cultivos puros, métodos de preservación de aislados bacterianos, curvas de crecimiento bacteriano. Extracción de ADN bacteriano y amplificación por PCR y diseño de oligonucleótidos. Evaluación de la integridad y calidad del ADN mediante geles de agarosa y expectrofotometría. Análisis bioinformático de las secuencias de gen ARN ribosomal 16s para la identificación molecular de bacterias. Construcción de árboles filogenéticos. (40 horas) 
4. Aislamiento, caracterización microbiológica e identificación molecular de hongos fitopatógenos. Medios de cultivo para el aislamiento de hongos fitopatógenos de tejido vegetal. Preparaciones para microscopía de campo claro, métodos de aislamiento y obtención de cultivos puros. Métodos de preservación de cepas fúngicas, viabilidad y cuantificación de esporas. Extracción de ADN y amplificación de diferentes marcadores moleculares para asignación taxonómica. Análisis y edición de secuencias y construcción de árboles filogenéticos. (40 horas)
   
5. Herramientas y técnicas en el estudio de interacciones de planta-microorganismo. Preparación de medios de cultivo y preparación de material vegetal para su germinación y cultivo in vitro. Ensayos de evaluación planta-microorganismo. Evaluación de variables de crecimiento. Cuantificación de clorofila y antocianinas. Análisis de la expresión de genes relacionados en respuesta a diversas fitohormonas y nutrición vegetal. Fijación de material biológico para su análisis por microscopía óptica. Herramientas de imagenología para la evaluación de variables de crecimiento. (50 horas)
   
6. Herramientas de microscopía en el estudio de interacciones planta-microorganismo. Análisis de la expresión de genes relacionados con respuesta de defensa y desarrollo en las plantas durante la interacción con microorganismos mediante el uso de microscopía confocal. (10 horas)
   

Enseñar a los estudiantes el método científico en campo.

Aprendizaje de diferentes diseños experimentales y pruebas estadísticas.

Enseñar cómo realizar trabajos en grupo de manera eficiente.

Aplicar los conocimientos por medio comparativo de dos grupos de plantas.

Cada día se darán 2 horas de clases teóricas, seguidas por 10 horas de trabajos prácticos de campo incluyendo la presentación y discusión de resultados sobre los proyectos.

Cada estudiante participa en una práctica grupal y una individual.

Al final del día los estudiantes exponen sus trabajos a discusión ante todos los participantes.

Conocimientos básicos de botánica, ecología, método científico e inglés.

Experiencia básica con estadística.

Buena disposición para trabajo en grupo y tolerancia social.

Manejo de trabajo bajo condiciones estresantes por el clima caluroso, el esfuerzo físico-mental, presencia de animales y plantas tóxicas, y tiempo limitado.

La participación en el curso, dos presentaciones y dos trabajos escritos en formato de un artículo científico (uno sobre la práctica individual y otro sobre la práctica grupal) proporcionan cada uno 20% de la evaluación final.

Día 1 (lunes) 1. Salida de Xalapa, Viaje a Los Tuxtlas 2. Clase teórica vespertina: Vegetación de Los Tuxtlas 3. Recorrido de campo 4. Formación de grupos de trabajo, cada uno apoyado por un profesor Día 2 5. Clase teórica matutina: Sistemática de plantas 6. Introducción a los temas grupales 7. Identificación de especies en campo 8. Clase teórica vespertina: Método científico 9. Discusión de bibliografía Día 3 10. Clases teórica matutina: Interacciones hormiga-planta 11. Introducción a los temas grupales 12. Identificación de especies en campo 13. Clase teórica vespertina: Diseños experimentales Día 4 14. Clases teóricas: Morfología de plantas 15. Trabajos grupales de campo 16. Discusión de avances Día 5 17. Clases teóricas: Reproducción de plantas y ciclos de vida 18. Trabajos grupales de campo 19. Presentación final de trabajos grupales Día 6 20. Clases teóricas: Biodiversidad 21. Trabajos grupales de campo (salida de la estación) Día 7 22. Clases teóricas: Herbivoria 23. Trabajos grupales de campo 24. Discusión de avances Día 8 25. Clases teóricas: Evolución de plantas 26. Trabajos grupales de campo 27. Presentación final de trabajos grupales Día 9 28. Clases teóricas: Fenología y demografía de poblaciones 29. Trabajos grupales de campo (salida de la estación) Día 10 30. Clases teóricas: Hormigas 31. Trabajos grupales de campo 32. Discusión de avances Día 11 33. Clases teóricas: Ecofisiología de plantas 34. Trabajos grupales de campo 35. Presentación final de trabajos grupales Día 12 36. Trabajos individuales de campo 37. Redacción de trabajos individuales 38. Discusión de avances Día 13 39. Trabajos individuales de campo 40. Redacción de trabajos individuales 41. Presentación de trabajos individuales concluidos, 42. Entrega de manuscritos 43. Discusión final 44. Viaje de regreso de Los Tuxtlas a Xalapa

1. Aprender a proponer proyectos de investigación breves, y ejercitar la creatividad científica.
2. Ejercitarse en el trabajo de campo, aprender diferentes técnicas de muestreo y análisis de resultados.
3. Adquirir experiencia en la presentación oral de propuestas de investigación, así como de los resultados de los proyectos de investigación.
4. Adquirir experiencia en la elaboración de manuscritos, siguiendo el formato de los manuscritos científicos.

1. La estación será CICOLMA (La mancha). Se realizarán pláticas introductorias y recorridos de los sitios, para que los y las estudiantes se familiaricen, donde se dará información de la historia natural del lugar; al mismo tiempo se podrán plantear preguntas específicas de ecología e historia natural.
2. En los dos sitios se harán proyectos de grupo dirigidos por profesores invitados, cada uno de los cuales resulta en un informe (oral y escrito). Los y las alumnos son responsables de la toma de datos y su análisis, hacer las presentaciones orales de los resultados y presentar los informes escritos de acuerdo al formato predeterminado. De igual forma, dependiendo de la propuesta de los profesores, podrán aportar de forma complementario en el planteamiento de preguntas, objetivos y el diseño experimental y análisis para responder las preguntas y objetivos específicos.
3. Los y las alumnos deben de realizar un proyecto de investigación en equipos de 2-3 personas, y presentar su propuesta oral, desarrollar el trabajo de campo, analizar los datos, formular una presentación oral y realizar un informe escrito de acuerdo al formato establecido. Además, cada estudiante debe de revisar, editar y aprobar el contenido de los manuscritos que se entreguen con su autoría a los coordinadores.
4. Los manuscritos se entregarán de acuerdo al calendario de actividades en formato electrónico. No se aceptarán informes en fechas posteriores a las indicadas.
5. Durante el curso, los profesores invitados y otros profesores podrán dictar pláticas sobre diversos temas que pueden derivarse en discusiones sobre ecología, conservación, etc. Los profesores están a la vanguardia en sus áreas de especialidad y los alumnos deben de aprovechar su experiencia y conocimiento. Es necesario recalcar que todos los profesores estarán a la completa disposición de los alumnos para discutir los temas de investigación desarrollados en el curso, así como cualquier otro tema de interés de los estudiantes.

1. Estudiantes de Posgrado que hayan llevado cursos de ecología poblaciones, ecología de comunidades y estadística.
2. Disposición para trabajo intenso de campo, laboratorio y gabinete.
3. Disposición para convivencia con los compañeros y profesores durante el tiempo del curso.
4. Dedicación de tiempo completo.

Una alta capacidad de trabajo en equipo y una amplia disposición de colaboración.

1. La evaluación se basa en el desempeño de los alumnos durante el curso (participación, creatividad, puntualidad, entusiasmo, etc.):
   Prácticas individuales 25 puntos cada una (1 en total). Total 25
   1. Prácticas de grupo¹, 25 puntos cada una² (3 en total). Total 75

TOTAL 100 puntos

¹ Los profesores invitados darán una evaluación subjetiva de la participación individual de los alumnos participantes en su práctica, que podrá ser ponderada en la asignación de calificación individual.

² La calificación será la misma para cada uno de los estudiantes participantes en ella.

1. En particular, cada práctica será evaluada conforme los siguientes criterios:
   Prácticas individuales:

Presentación oral (protocolo) 30

Presentación oral (resultados y discusión) 30

Texto (calidad académica, redacción, seguimiento de la guía de informes) 40

1. Prácticas de grupo:

Presentación oral (resultados y discusión) 40

Texto (calidad académica, redacción, seguimiento de la guía de informes) 60

1. En ambos casos hay sanciones si no se cumple con el formato indicado en la guía para la elaboración de los informes y si hay errores ortográficos.

Ecología de plantas parásitas

Ecología de interacciones planta-animal

Ecología de dunas costeras

Ecología de manglares y fisiología de plantas

Ecología de sistemas de agua dulce

Ecología de la restauración de bosques y selvas

• Comprender las bases teóricas del origen y evolución de la fitofagía en los insectos terrestres, así como los aspectos fundamentales de su historia natural y ciclos de vida, en relación con la explotación y uso de los recursos.
• Conocer los sistemas y técnicas de detección y monitoreo poblacional de especies fitófagas, así como los métodos convencionales y biológicos utilizados para el manejo de especies nocivas en sistemas productivos.
• Identificar los caracteres morfológicos y adaptativos relacionados con la fitofagia en los insectos terrestres, destacando algunas familias representativas.

El curso se llevará a cabo de manera presencial en las instalaciones del Instituto de Ecología AC (INECOL) en su sede principal en Xalapa, Veracruz (México). Es un curso intensivo con una duración de 12 días efectivos de trabajo continuo, por lo que se requiere de tiempo completo.

El curso tiene un componente mixto, en una proporción equivalente de sesiones teóricas (50%) y prácticas (50%), de tal forma que el estudiante adquiera los conocimientos básicos relacionados con las adaptaciones biológicas y evolutivas de los insectos fitófagos, conozca las técnicas relacionadas con su monitoreo y manejo, además de adquirir las destrezas suficientes para el reconocimiento de los principales grupos taxonómicos que viven en las plantas.

El contenido está dividido en 4 módulos temáticos sobre: 1) Ecología y evolución; 2) Biología y métodos de identificación; 3) Métodos de monitoreo poblacional; y 4) Agricultura y manejo de especies nocivas. En el aula será impartida la teoría básica de las interacciones antagonistas insecto-planta, su ecología, monitoreo y manejo, apoyada con estudios de caso y complementada con sesiones prácticas en el laboratorio, además de la elaboración de ensayos temáticos que serán preparados, presentados y discutidos por los estudiantes.

En el laboratorio se llevarán a cabo sesiones prácticas para el reconocimiento de los rasgos morfológicos de relevancia taxonómica en grupos selectos de fitófagos, además de ejemplos demostrativos para la identificación de especímenes de algunas familias representativas. Al final del curso se hará una evaluación de los conceptos teóricos y prácticos, para reforzar el aprendizaje y comprensión efectiva de los estudiantes.

La literatura básica de apoyo para las sesiones teóricas y prácticas será proporcionada por el coordinador del curso a los alumnos inscritos. El cupo mínimo de alumnos inscritos será de 4 hasta un máximo de 10 estudiantes. Se requiere del uso del Aula Laboratorio del Posgrado institucional que cuenta con espacios de laboratorio suficientes, además de estereomicroscopios en buen estado para su asignación individual por estudiante.

El curso está dirigido principalmente a personas que cursan estudios de Posgrado en alguna área de las Ciencias Naturales, de preferencia con conocimientos básicos de entomología e interacciones ecológicas. Se aceptan estudiantes de posgrado de otras instituciones que cumplan los requisitos señalados por el posgrado del INECOL. Para otros estudiantes externos se requiere al menos un título de Licenciatura afín a esta área del conocimiento, los cuales deberán establecer un contacto previo con el coordinador del curso.

Conocimientos básicos de entomología e interacciones ecológicas

Participación y desempeño en las sesiones teóricas y prácticas de todo el curso. Presentación de ensayos temáticos durante el curso. Examen final práctico de identificación de especímenes preservados.

Participación y desempeño en sesiones teóricas y prácticas: 40 %

Evaluación de ensayo temático (presentación oral y escrita): 30 %

Evaluación práctica de reconocimiento taxonómico: 30 %

Introducción del curso: Presentación de profesores y objetivos; Criterios de evaluación y dinámica didáctica; Presentación de participantes.

Módulo 1. Ecología y evolución (10 hrs)

Origen y adaptaciones alimentarias de insectos fitófagos; Sistemática y evolución de la fitofagia; Morfología, fisiología y rasgos adaptativos de las interacciones antagonistas insecto-planta; Ciclos de vida y explotación de recursos.

Módulo 2. Biología y métodos de identificación (40 hrs)

Biología y morfología básica de los principales ordenes de insectos fitófagos (Coleoptera, Diptera, Orthoptera, Lepidoptera, Hemiptera).

Módulo 3. Métodos de monitoreo poblacional (10 hrs)

Sistemas de monitoreo poblacional de insectos fitófagos; Métodos directos en plantas; Métodos indirectos (uso trampas y atrayentes).

Módulo 4. Agricultura y manejo de especies nocivas (10 hrs)

Métodos de evaluación para el manejo de plagas en sistemas productivos; Métodos convencionales; Métodos biológicos; Método autocida.

1. 1. Comprender como la interacción de las plantas con el ambiente biótico y abiótico afecta los procesos de crecimiento y distribución de las especies vegetales.

    

   2. Entender el rol de las características morfo-fisiológicas de las plantas y su asociación en el funcionamiento del ecosistema.

    

   3. Aprender a recolectar datos de las plantas creciendo en el campo con el uso de metodologías y equipos ecofisiológicos.

Cada día de clase tendrá una duración de 8 horas. Durante la primera hora se presentarán los fundamentos teóricos y bases conceptuales de cada tema. Las siguientes horas se emplearán para el desarrollo de las actividades en campo y técnicas de laboratorio. Las actividades en el campo se realizarán de manera grupal en el Santuario del Bosque de Niebla del INECOL y las del laboratorio en el Laboratorio de Posgrado.

Se abordarán cuatro unidades: 1-Medio abiótico; 2-Fotosíntesis; 3-Relaciones hídricas y 4-Análisis de diversidad funcional.

Todas las actividades prácticas se realizarán de manera grupal.

El primer día se establecerán parcelas de muestreo en el Bosque de Niebla, donde se censarán las comunidades vegetales y se caracterizarán las condiciones topográficas y climáticas. Posteriormente, las actividades prácticas se desarrollarán dentro de las parcelas establecidas.

Individualmente se generará un reporte del proyecto por la temática de la unidad.

El quinto día se estimarán parámetros de diversidad funcional de las comunidades vegetales en el Bosque de Niebla del Santuario. Los resultados de diversidad funcional y su interpretación formarán parte del proyecto final.

1. Formato de protocolo del proyecto:
   1. Título y nombre de autores.
   2. Introducción (máximo 500 palabras): describir las variables y su aplicación para entender la relación de las plantas con el microambiente.
   3. Pasos y herramientas para estimar las variables: indicar el procedimiento para estimar las variables, puede incluir imágenes, tablas, figuras, fotos.
   4. Referencias: incluir la literatura clave en formato APA.

Conocimiento básico de ecología y botánica.

Capacidad de trabajo en equipo, conocimientos básicos de análisis y gráficos de datos. Capacidad de trabajo bajo condiciones estresantes en el campo. Lectura fluida de textos en inglés.

De manera individual cada unidad será evaluada equitativamente con la entrega de un protocolo. Y como proyecto final se entregará un protocolo general que compile las 4 unidades, además de la introducción y conclusión general.

Criterio y % de Calificación

1-Protocolo de Medio abiótico. 20%

2-Protocolo Fotosíntesis. 20%

3-Protocolo Relaciones hídricas. 20%

4-Protocolo Análisis de diversidad funcional. 20%

5-Compilacion de protocolos + Introducción y Conclusión General. 20%

TOTAL 100%

1. Día 1: 1Medio físico (variables ambientales) y patrones ecológicos (composición y estructura de las comunidades).
2. Día 2: 2 Fotosíntesis: Reacciones lumínicas y en oscuridad, características funcionales relacionadas a la fotosíntesis.
3. Días 3 y 4: Relaciones hídricas: Potencial hídrico, flujo de agua a través del xilema, atributos funcionales asociados a las relaciones hídricas.
4. Día 5: Escalando del individuo a la comunidad: Análisis de atributos funcionales para describir la funcionalidad del bosque.

Que el estudiante conozca técnicas y herramientas para la recolecta, manejo y preservación de especímenes de hongos, con énfasis en los basidiomicetos (saprobios, parásitos, ectomicorrizógenos), incluyendo especies comestibles silvestres. Que reconozca el valor del espécimen como muestra de estudio, y evidencia científica, y como componente para impulsar o desarrollar colecciones biológicas. Que se informe de las técnicas y herramientas para reconocer, medir y analizar diferentes tipos de caracteres (morfológicos/moleculares) en basidiomicetos. Que reconozca la importancia de la sistemática molecular en la identificación de especies fúngicas. Que visualice vacíos de información en el conocimiento de los hongos de México y cuente con herramientas para impulsar su estudio.

Se destinarán sesiones i) teóricas para temas específicos, ii) sesiones de campo para el reconocimiento de poblaciones silvestres de hongos y explicaciones in situ sobre su ecología, iii) sesiones de laboratorio, para reconocer la variación de caracteres morfológicos y anatómicos en distintos taxones obtenidos en campo, iv) sesiones de laboratorio para la obtención de ADN, PCR, análisis bioinformáticos y aislamiento de cepas, y v) discusión de temas desarrollados por los estudiantes.

Egresados de biología y áreas afines u otros interesados en la identificación de hongos silvestres o en técnicas para estudios morfológicos y moleculares (extracción de ADN y PCR).

Disposición para participar en sesiones de campo y laboratorio, capacidad de análisis y síntesis de información.

Se tomará en cuenta asistencia y puntualidad, participación, exposición y reporte de investigación.

Diversidad de macrohongos a nivel mundial y nacional. 2. Conceptos importantes sobre taxonomía y nomenclatura. 3. Estado del arte de la sistemática de macrohongos en México. 4. Caracteres morfo-anatómicos descriptivos (macro y microscópicos). 5. Importancia de la sistemática molecular en hongos. 6. Técnicas moleculares para estudio de macrohongos (extracción de ADN, PCR, electroforesis, purificación, secuenciación). 7. Comparación de secuencias en bases de datos, alineamientos y análisis. 8. Técnicas de aislamiento de cepas y su uso para la identificación taxonómica.

1. Introducir los conceptos básicos de la redacción de artículos científicos en inglés 2. Practicar la redacción científica en inglés para cada sección de un artículo 3. Capacitar los estudiantes en los procesos de publicación (desde el envío hasta la corrección de pruebas de galera) 4. Discutir sobre las experiencias en la revisión, edición y publicación de artículos 5. Preparar estudiantes para las responsabilidades como árbitro y editor de revistas

El curso está diseñado para un máximo de 15 estudiantes de cualquier semestre, preferiblemente de semestres avanzados que ya están escribiendo su tesis o un artículo en inglés. Cada día se darán clases teóricas (1 hora) seguidos por ejercicios prácticas de lectura, redacción, revisión y edición (2 horas) y la exposición y discusión de sus trabajos (1 hora). En dos ocasiones se invitarán profesores de Posgrado para discutir sobre sus experiencias en la redacción, publicación, revisión y edición de artículos científicos.

Conocimientos básicos del inglés. Un fuerte compromiso para mejorar la redacción y lectura de textos en inglés.

Buenos conocimientos del inglés y del manejo de software de texto (Word) y de presentaciones (Powerpoint); trabajo actual en la publicación de artículos científicos.

La participación en el curso, un trabajo práctico individual (ensayo escrito) y un trabajo en grupo (ensayo escrito y revisado varias veces) proporcionan cada uno 33.3% a la evaluación final.

Día 1 1. Conceptos básicos de redacción: ¿Cuándo, dónde, cómo, para quién? 2. ¿Qué es un artículo científico? Estructura IMRAD 3. Inglés como idioma internacional de las ciencias 4. Revistas (Prestigio, impacto, tiempos de revisión, porcentaje de rechazo) 5. Herramientas (traductores, diccionarios, bibliografía, manuales) 6. Ejercicios: Redacción de un primer ensayo libre, Ejercicio de lectura 7. Deberes: Lectura de un texto favorito Día 2 8. Errores típicos de redacción en inglés 9. Planeación y manejo de tiempo (Calendarización de pasos), (Writing an article in 12 weeks) 10. Responsabilidades del autor (Acuerdo de autorías, datos originales, plagios) 11. Derechos de autor, autorías (criterios, orden, acuerdos), direcciones, permisos de reproducción 12. Revisión de bibliografía sobre el tema, buscadores, bases de datos, bibliotecas 13. Ejercicio: Formular hipótesis y defenderla con argumentos, Ejercicio de conversación 14. Deberes: Diseñar un plan de trabajo y redactar un primer borrador Día 3 15. Estructura de párrafos, Vinculación de párrafos 16. Revisión de deberes 17. Sección de métodos 18. Sección de agradecimientos (colegas, técnicos, revisores, becas, apoyos otorgados) 19. Citación de bibliografía en el texto 20. Ejercicios: Revisión de varios artículos, Redacción de una sección de métodos y de agradecimientos basado en ejemplos. 21. Deberes: Revisión mutua de borradores Día 4 22. Ritmo del texto escrito, puntuación 23. Sección de resultados I 24. Ejercicios: Revisión de varios artículos, Redacción de una sección de resultados basado en ejemplos 25. Deberes: Redacción de sus resultados de tesis Día 5 26. Sección de resultados II 27. Revisión de deberes 28. Tablas y figuras (Reglas para leyenda, símbolos, colores, software) 29. Ejercicios: Revisión de varios artículos, Redacción de leyendas de tablas y figuras basado en ejemplos 30. Deberes: Diseño de tablas, figuras y leyendas con ejemplos Día 6 31. Palabras que se deben evitar 32. Revisión de deberes 33. Secciones de discusión y de bibliografía 34. Formatos de bibliografía (Tipos de formatos, Software) 35. Ejercicios: Revisión de varios artículos, Redacción de una sección de discusión basado en ejemplos, Formatear una sección bibliográfica según un sistema de citación 36. Deberes: Búsqueda de ejemplos de buena y mala redacción Día 7 37. 30 pecados de estilo 38. Resumen (problema, métodos, resultados, discusión, conclusión, límite de palabras, abreviaciones) 39. Sección de introducción (problemas, antecedentes, métodos, objetivos, preguntas, hipótesis) 40. Titulo (número de palabras, especificidad, palabras clave, sintaxis, abreviaciones) 41. Ejercicios: Revisión de varios artículos, Revisión de resúmenes, Mejora de títulos, Redacción de un resumen basado en ejemplos Día 8 42. Marcadores de edición 43. Redundancias 44. Proceso de publicación (normas, guías de autores, formatos, carta de envío, carta de recepción, decisión, revisión, corrección, pruebas de galera, costos, sobretiros) 45. Ejercicios: Redacción de una carta de envío, reenvío, corrección de pruebas de galera 46. Profesor invitado: Dr. Victor Bandala 47. Deberes: Edición de un texto escrito Día 9 48. Presentación de libros leídos durante el curso 49. Expresiones confundidas 50. Actividades y responsabilidades como árbitros y editores 51. Ejercicios: Revisión y redacción de un documento de arbitraje, análisis de una carta de aceptación y una carta de rechazo 52. Entrevista con Profesor invitado 53. Deberes: Redacción de un ensayo libre Día 10 54. Presentación de libros leídos durante el curso 55. Revisión de deberes 56. Ejercicios: Redacción de un ensayo libre, Revisión de documentos en conjunto. Ejercicio de lectura 57. Discusión final sobre el curso: Expectativas y necesidades

1. Conocer la diversidad de microorganismos, incluyendo las arqueas, los hongos y las bacterias, así como los principales fila de éstas últimas. 2. Entender los papeles que desempeñan los microorganismos presentes en el ambiente (agua, suelo) en procesos ecosistémicos como el ciclo de elementos y nutrientes, la degradación de contaminantes o el secuestro de carbono. 3. Conocer las principales teorías sobre el origen de los microorganismos, y de la vida misma. 4. Obtener bases teóricas sobre ecología microbiana. 5. Conocer los problemas y las oportunidades asociados a los métodos empleados en la microbiología ambiental, como el muestro, la enumeración, la identificación, el cultivo, y los avances en las tecnologías moleculares. 6. Evaluar la importancia de las interacciones plantas – microorganismos (microorganismos rizosféricos, micorrizas, simbiosis fijadoras de nitrógeno – leguminosas) para la productividad vegetal. 7. Saber acceder a la literatura científica relevante, y poder desarrollar escritos científicos, escritos de divulgación, y presentaciones orales sobre problemáticas relacionadas con la microbiología ambiental.

Los profesores expondrán los temas del curso ante la clase. Los estudiantes realizarán lecturas de literatura científica sobre microbiología ambiental y se tendrán sesiones de discusión. También los estudiantes realizarán ensayos sobre algunos temas, así como un trabajo final. . Se realizarán dos sesiones de práctica en el Laboratorio de Microbiología Ambiental del Campus III del INECOL.

Los estudiantes requieren conocimientos básicos de biología para tomar este curso. Tendrán el 100% de descuento en el pago, estudiantes externos de instituciones educativas que tengan convenio vigente con el INECOL. 

Ninguna.

asistencia y participación durante las clases (10%), exámenes después de cada sesión (20%), presentación sobre un tema de relevancia para el curso (30%), reportes de revisión de artículos (40%). 

1. Clasificación de los microorganismos 1.1. Taxonomía 1.1.1. Bacterias 1.1.2. Arqueas 1.1.3. Hongos 1.2. Filogenia 2. Las bacterias y el medio ambiente 2.1. Abundancia de bacterias en diferentes ambientes 2.2. Energía y metabolismo 2.2.1. Metabolismo aerobio 2.2.2. Metabolismo anaerobio 2.2.3. Fermentación 2.2.4. Asimilación de nutrientes 2.2.5. Fotosíntesis procariota 2.2.6. Quimiosíntesis 2.3. Biogeoquímica 2.3.1. Ciclo del Carbono 2.3.2. Ciclo del Nitrógeno 2.3.3. Ciclo del Fósforo 2.3.4. Ciclo del Azufre 3. Origen de la vida 3.1. Teorías sobre el origen de la vida 3.1.1. Sopa primigénea 3.1.2. RNA world 3.1.3. Metabolismo primero 4. Ecología microbiana 4.1. Concepto de especie 4.2. Genoma núcleo y genoma accesorio 4.3. Procesos de Especiación 4.4. Evolución en bacterias 4.4.1. Genética y genómica de poblaciones 4.4.2. Transferencia horizontal de genes 4.4.3. Evolución experimental 4.5. Ecología de Comunidades 4.5.1. Teorías de ensamblaje de comunidades (procesos neutros, históricos y deterministas) 4.5.2. Cooperación y competencia en comunidades microbianas 4.6. Postulado de Baas-Becking y críticas modernas 5. Herramientas metodológicas en microbiología ambiental 5.1. Muestreo y Aislamiento de cepas 5.1.1. Medios de cultivo 5.1.2. Técnicas de cultivo 5.1.2.1. Teoría del cultivo en lotes 5.1.2.2. Teoría del cultivo continuo 5.1.2.3. Teorías de la competencia en microorganismos 5.1.3. Fisiología microbiana 5.2. Detección de cepas 5.3. Identificación de microorganismos 5.4. Enumeración, medición de biomasa y actividad microbiana 5.5. Secuenciación 5.6. PCR cuantitativo 5.7. Metagenómica 6. Ambientes particulares 6.1. El suelo 6.2. El mar: La zona pelágica 6.3. Tapetes microbianos y estromatolitos 6.4. Chimeneas hidrotermales 6.5. Los tubos digestivos de los animales 6.6. Las zonas polares 7. Interacciones planta – microorganismos 7.1. Microorganismos de corteza, 7.2. Rizosfera 7.3. Micorrizas 7.4. Simbiosis leguminosas- Rhizobium, 7.5. Frankia 7.6. Control biológico. 8. Aplicaciones Biotecnológicas de microbiología ambiental 8.1. Agromicrobiología 8.2. Biorremediación de suelos contaminados 8.3. Tratamiento de aguas residuales