Modelos de Nichos Ecológicos y de Distribución de Especies
Modelos de Nichos Ecológicos y de Distribución de Especies

  • Inicia: 05/06/2023    Finaliza: 16/06/2023
  • Horario de clases: Lunes a viernes de 9:00 a 18:00 hrs, con una hora de descanso
  • Estudiantes mínimo: 5    máximo: 30
  • Costo: $3,000
  • Creditos: 8
  • Horas: 80
  • Nota:
  • Coordinadores:
    Dr. Octavio Rafael Rojas Soto
  • Profesores invitados:
    M en C. Gonzalo Pinilla Buitrago
    Dr David Prieto Torres
    Dr. Fabricio Villalobos Camacho
    Fís. María del Rosario Landgrave Ramírez
    Dr. Enrique Martinez Meyer
    Dr. Juan Luis Parra Vergara
    Dr. Andrés Lira Noriega
    Dr. Claudio Mota Vargas
    Dr. Luis Osorio Olvera
    Dr. Carlos Alberto Yañez Arenas
    Dr. Daniel Jiménez García
    M en C Felipe Andrés Toro Cardona
    Dr. Luis Osorio Olvera
    M en C. Gonzalo Pinilla Buitrago

A través de este curso se espera que los alumnos aprendan la teoría básica del Modelado de Nichos Ecológico y de los Modelos de Distribución de Especies (MDE), así como las herramientas empíricas para contestar diversas preguntas biológicas.

El curso tiene como objetivos el entender los diversos fundamentos teóricos sobre los cuales descansa el modelado de nichos ecológicos y los Modelos de Distribución de Especies (MDE), tales como las unidades a modelar, los conceptos de nicho ecológicos y las distribuciones geográficas, así como aspectos importantes, como las unidades de modelado, los conceptos de nicho y de área de distribución, las necesidades y características de los datos biológicos y las coberturas ambientales, el modelo BAM, las implicaciones de las transferencias climáticas, las validaciones estadísticas entre otras. Además otro objetivo es abordar los principios y manejo de algunos algoritmos comunes, como Maxent, etc., para que el alumno pueda aplicar esta herramienta en la solución de preguntas y problemas biológicos.

1) Conocer las bases teóricas del Modelado de Nicho Ecológico (MNE) y de los Modelos de Distribución de Especies (MDE).

2) Conocer la teoría y las aplicaciones empíricas del modelado de nicho ecológicos y distribución de especies.

3) Manejar algunos de los algoritmos más comunes.

Por facilidades prácticas y disposición de los profesores invitados, este curso será intensivo, de tal manera que se cumplan en total 80 horas de clase, más lecturas extra clase para su discusión. Los alumnos utilizarán parte de horario extra clase para el desarrollo de un proyecto.

Los alumnos deben tener conocimientos en el uso de algún sistema de información geográfica: ArcMap, QuantumGIS, etc. o paqueterías para estos análisis en R. Se dará preferencia a los que demuestren haber tomado un curso de SIG. BECAS: Para los estudiantes externos provenientes de instituciones educativas que tengan convenio vigente con el INECOL.

Además de contar con los conocimientos sobre SIG, los interesados deben tener mucho interés en aprender usar este tipo de herramientas para contestar preguntas biológicas concretas.

Serán evaluados a través de la participación en clase a través, de lecturas, la realización de un examen y mediante la realización y presentación de un proyecto final que desarrollarán durante el curso. El curso será evaluado de la siguiente manera: Proyecto 40%, Examen 40%, participación y lecturas 20%.

Teoría:

Introducción:

1.1 La Informática de la Biodiversidad

1.2 Los modelos de nicho ecológico (MNE) y de distribución de especies (MDE) ¿qué son y para qué sirven?

  1. Interfaces de los análisis espaciales (Sistemas de Información Geográfica, R)
  2. Las unidades del modelado ¿Qué estamos modelando?

       3.1 Conceptos de especie

       3.2 Conceptos de subespecie

       3.3 Conceptos de población

  1. Áreas de distribución

       4.1 Conceptos y métodos para su determinación

       4.2 Análisis histórico y espacial de las áreas de distribución

  1. Conceptos de nicho

       5.1 Conceptos de Grinnell, Elton y Hutchinson: su aplicación en MNE

  1. Del nicho ecológico a la distribución geográfica

6.1 La dualidad de Hutchinson

6.2 Descripción y análisis del esquema BAM (áreas Go, Gi, Gp)

6.3 Configuraciones de BAM

6.4 Aplicaciones empíricas de BAM

  1. Datos biológicos

7.1 Tipos de datos: sólo presencia, presencia/ausencia, presencia/pseudoausencia, presencia/entorno

7.2 Consideraciones de los datos biológicos: formatos, fuentes de datos, georreferenciación, errores asociados

  1. Datos geográficos

8.1 Tipos de datos: variables directas e indirectas (scenopoéticas y bionóminas)

8.2 Consideraciones de los datos geográficos: Formatos, Fuentes de datos, Resolución, Calidad, Temporalidad

8.3 Análisis y selección de las variables

  1. Implementación:

9.1 Master Chef de Algoritmos

9.2 BIOCLIM

9.3 Maxent, KUENM, Proyecto Wallace, “Niche Tool Box”

10. Transferencia de nichos y áreas no análogas: MESS y MOP

11. Validación de los modelos: Pruebas estadísticas, utilidad y limitaciones, Ji-cuadrado, Índice Kappa, TSS, Curva ROC y AUC – ROC Parcial, Boyce

12. Conservadurismo de nicho: Warren y Broennimann

13. Incertidumbre en el modelado

14. Fisiología/ecología (modelos mecanísticos)

15. Modelos orientados a procesos

16. Aplicaciones de los MNE y MDE: Nichos y abundancias, Cambio climático, Comunidades, Conservación, Biogeografía estacional, Agrobiodiversidad, Enfermedades infecciosas, Especies invasoras, etc.

Práctica

Proyectos