La taxonomía y sistemática han avanzado enormemente con el desarrollo de nuevos métodos, programas bioinformáticos y plataformas de secuenciación de nueva generación. La creación de herramientas para mediciones morfométricas, programas para analizar diferentes fuentes de caracteres, la accesibilidad en línea a colecciones biológicas actuales e históricas, a literatura antigua relevante y a bases de datos de biodiversidad de diversa índole han facilitado la tarea de los taxónomos. De modo que es importante que los estudiantes conozcan los diferentes caracteres utilizados en la definición de especies, así como análisis para descubrir nuevos taxones y la presentación de resultados apegados a los códigos de nomenclatura botánica y zoológica.
Que el alumno sea capaz de describir un taxón nuevo y publicarlo en una revista especializada. Esto incluye desde la recolección de especímenes, adquisición de caracteres, análisis, hasta la descripción formal siguiendo los códigos de nomenclatura botánicos/zoológicos.
El curso iniciará con una breve presentación de los métodos y trabajo de laboratorio (1 hora diaria de teoría serían 22 horas); el resto del tiempo se empleará en prácticas de laboratorio (4 horas diarias de prácticas serían 88 horas) de microscopía, laboratorio molecular y bioinformático. La última semana del 01 al 08 de abril será de asesoría (4 horas en la mañana y 4 horas en la tarde serían 48 horas). En la sistemática y taxonomía el trabajo de campo es inicial únicamente para recolectar los organismos de interés y así será, el curso: iniciará con trabajo de campo y una vez colectados los organismos se procederá a utilizarlos en las prácticas.
Conceptos básicos en taxonomía y sistemática.
Dado que fundamentamernte el curso es práctico, se sugiere que los alumnos elijan desde el inicio del curso su grupo de estudio, ya sea con base en sus propios intereses.
Manejo de software de bases de datos
La evaluación del curso se basará en cuatro reportes que se entregarán al final, cada uno contribuye con 25% de la calificación.
(a) Historia de los conceptos de especie
(b) Diferencias entre la sistemática clásica y la filogenética
(c) Selección de caracteres
(d) Tipos de caracteres, continuos, discretos
(e) Métodos de codificación de caracteres
(f) Concepto de homología
(g) Caracteres moleculares (fragmentos, secuencias, genómica)
(h) Analisis fenéticos
(i) Análisis filogenéticos
(g) Integración y decisiones taxonómicas
(i) Códigos de nomenclatura botánica y zoológica
(j) Descripción de especie (botánica y zoológica)
(k) Síntesis de un trabajo taxonómico