Detalle del curso

Nombre del curso:

Morfometría Geométrica

Inicia
22/01/2018
Finaliza
23/02/2018
Horario de clases:
Lunes a Viernes de 10:00 a 12:00 hrs
Estudiantes mínimo:
4
máximo:
20
Costo:
$ 1875
Creditos:
5
Horas:
50
Coordinadores:
Jorge Guillermo Chollet Villalpando
Profesores invitados:
Efraín de Luna García
Sandra Milena Ospina Garcés
 
Presentación
La presente iniciativa consiste en impartir un curso dinámico, en el cual se establezcan las bases teóricas y prácticas que podrán ser utilizadas en estudios de la forma de especies o sus porciones (e.g. caracteres), mediante la técnica de Morfometría Geométrica. El proceso incluirá desde la selección de los especímenes y su digitalización, la creación de abanicos y peines para la ubicación de puntos (landmarks) a lo largo del contorno, el ajuste de las configuraciones para remover los efectos ajenos a la forma y su análisis mediante estadísticos multivariados. Por otra parte se utilizarán configuraciones de marcas 2D derivadas de esta técnica para la creación de matrices de caracteres simples o combinadas para su inclusión en análisis filogenéticos con el método de Máxima Parsimonia en el Programa de computo TNT.



Objetivo
Estudiantes e investigadores fortalecerán sus capacidades y conocimientos teóricos y metodológicos en los análisis de los datos de Morfometría Geométrica, para aplicarlos en sus tesis y/o proyectos de investigación.



Objetivos específicos
Fortalecimiento de los conocimientos básicos de Morfometría.
Digitalización adecuada de especímenes de caso de estudio.
Creación de protocolos para la obtención morfo-geométrica de la forma (configuraciones de marcas y semi-marcas), alineamiento de contornos y Análisis multivariados: Componentes Principales, Variables canónicas y Regresiones.
Creación de matrices simples y combinadas de configuraciones de marcas, para su uso en análisis de Máxima Parsimonia con el programa de computo TNT.



Metodología
Se llevará a cabo un curso teórico y práctico en el cual se implementara el uso de programas de computo como los de la serie IMP y TPS mediante técnicas de Morfometría Geométrica, para llevar a cabo análisis estadísticos multivariados de la forma (coordenadas 2D). Por otra parte se mostraran algunas apliciones de los datos morfométricos: Filogenia. Métodos comparativos, evolución morfológica. Forma función.



Prerrequisitos del curso
Contar con laptop para la instalación de los programas de computo y de ser el caso con cámara digital para la captura de imágenes de especímenes (no obligatorio).



Habilidades y destrezas
Habilidades en análisis estadisticos como son: e.g. análisis de componentes principales, variables canónicas, regresión y de tipo filogéneticos (i.e. Máxima Parsimonia).



Criterios de calificación
*Un examen intermedio durante la tercera semana.
*Un proyecto de investigación.
*Seis tareas prácticas con programas de computo.
*Dos presentaciones en el formato de Congreso. La primera planteando el proyecto. La segunda presentando los resultados.

Rubros a evaluar:
examen 25%
proyecto 25%
seis tareas 25%
dos presentaciones 25%



Contenido temático
1. Introducción: Morfometría Tradicional y Morfometría Geométrica. Hipótesis para el análisis de datos.

2. Métodos de registro de la Forma: Digitalización de especímenes. Planeación de protocolos morfométricos. Registro de marcas y semimarcas.

3. Principios de Geometría: Vectores, Espacios geométricos de la forma. Métodos de superposición. Análisis morfométricos: Warps. Espacios tangentes. Manifolds. Coordenadas Procrustes. Deformación relativa.

4. Análisis estadísticos. Métodos de ordenación: Análisis de componentes principales (PCA) y análisis de variables canónicas (CVA). Métodos de regresión

5. Aplicaciones. Filogenia. Métodos comparativos, evolución morfológica. Forma función.



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