Morfometría Geométrica en R
Morfometría Geométrica en R

  • Inicia: 18/03/2019    Finaliza: 22/03/2019
  • Horario de clases: 9 am a 6 pm con dos horas para comida
  • Estudiantes mínimo: 20    máximo: 30
  • Costo: $ 2250
  • Creditos: 4
  • Horas: 40
  • Coordinadores: Andrés Lira Noriega
  • Profesores invitados: Sandra Milena Ospina Garcés
    Miriam Leah Zelditch
    Donald Swidersky

Curso dirigido a estudiantes e investigadores, interesados en aprender la herramienta de la morfometría geométrica y sus aplicaciones, en el programa estadístico R. La morfometría geométrica parte del registro numérico de las formas mediante configuraciones de coordenadas cartesianas (x,y) y permite modelar la deformación de una configuración observada respecto de una configuración consenso. Además, permite aproximaciones finas a la variación de las formas, que pueden ser analizados mediante métodos matemáticos y estadísticos para interpretar los cambios en la forma y el tamaño de una estructura en diferentes contextos biológicos.
Aprender a partir de la instrucción teórica y práctica, la captura de coordenadas cartesianas y las herramientas del modelado estadístico para analizar los datos morfométricos. Así como profundizar las aplicaciones de la morfometría geométrica en diferentes líneas de investigación biológica, como en la biología del desarrollo, evolutiva y los modelos espacialmente explícitos.
1.- Describirá la variación de diversas estructuras en términos de matrices de coordenadas asociadas a una configuración de marcas. 2.- Analizar mediante el modelado estadístico en R, la variación de las formas de estructuras de interés. 3.- Conocer las aplicaciones de la morfometría geométrica en diversas áreas de la biología, incluyendo el ajuste de modelos evolutivos a la forma, análisis de modularidad y ontogenia, descripción del filomorfoespacio y análisis espaciales de la variación morfológica.
El curso contará con una sesión teórica en la mañana (4 horas) donde se abordarán los conceptos y métodos de la morfometría geométrica, y una sesión práctica en la tarde (4 horas), para desarrollar protocolos de análisis de Morfometría Geométrica en los programas especializados libres de morfometría (programa TpsDig2.0 y paquetes de morfometría geométrica para R). Después de cada sesión teórica se hará una breve discusión sobre los temas vistos y lecturas previas asignadas para cada sesión.
Conocimientos básicos de morfometría, interés en desarrollar proyectos involucrando las herramientas de la morfometría goemétrica y manejo del programa R. BECAS: Para los estudiantes externos provenientes de instituciones educativas que tengan convenio vigente con el INECOL, estarán disponibles 5 becas del 100%, 5 de 75%, 5 del 50% y 5 becas del 25% de condonación del pago. Los estudiantes sin convenio deberán cubrir el 100% de la cuota.
El alumno podrá aplicar los conocimientos adquiridos para capturar, analizar e interpretar la variación morfológica de estructuras de interés, en diferentes contextos biológicos, aplicando modelos estadísticos, hipótesis filogenéticas y datos espaciales.
Asistencia, ejercicios y una presentación final, donde se propone un protocolo morfométrico (hipótesis, datos morfométricos y un análisis preliminar).
Lunes: una visión general de la morfometría geométrica; Marcas y Semimarcas; Superposición Martes: la teoría de la forma; Métodos de ordenación (análisis de componentes principales, análisis de variaciones canónicas, análisis de componentes principales entre grupos) Miércoles: Estadísticas, Parte 1 (Análisis estadísticos simples, Modelos complejos) Jueves: Estadísticas, Parte 2 (Análisis estadísticos con información filogenética); Aplicaciones evolutivas (mínimos cuadrados filogenéticos generalizados, estimación del estado ancestral, filomorfoespacio, señal filogenética) Viernes: Abierto a los intereses de los estudiantes, a menudo: Modularidad e integración, Ecomorfología, Análisis geográficos.

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