La ecología y la genética del paisaje son disciplinas que hacen un uso imprescindible de análisis espaciales para caracterizar y evaluar cómo la estructura del paisaje y procesos como la fragmentación y pérdida del hábitat regulan la dinámica poblacional, la dispersión, la diversidad y el flujo genético de los organismos en hábitats antropizados. La información que proporcionan dichas herramientas es fundamental para la toma de decisiones durante la planeación de estrategias de manejo y conservación a escalas local y del paisaje. Este curso ofrece a los estudiantes conocer el marco teórico y las herramientas, sus alcances y limitaciones para plantear y desarrollar hipótesis y preguntas en ecología y genética del paisaje.
Proporcionar al alumno con los fundamentos y herramientas principales de análisis espacial en ecología y genética del paisaje en un contexto de biología de la conservación.
- Conocer el marco conceptual y fundamentos teóricos en ecología del paisaje.
- Conocer los conceptos y fundamentos teóricos en genética del paisaje.
- Conocer los elementos fundamentales de diseño muestral en ecología y genética del paisaje.
- Aprender los fundamentos, limitaciones, y usos de distintas herramientas de análisis espacial en ecología y genética del paisaje.
- Conocer las principales aplicaciones prácticas de la ecología y genética del paisaje a través de estudios de caso.
El curso será teórico (2-3hrs) y práctico (4-5 hrs). De cada una de las unidades temáticas abordadas se proveerá con una sesión explicativa sobre sus fundamentos y conceptos. Esta información proveerá las bases teóricas para realizar el componente práctico de cada sesión. Asimismo, cada unidad temática estará acompañada de literatura científica cómo revisiones conceptuales, metodológicas, así como estudios de caso. El componente práctico se enfocará a utilizar software especializado para el análisis de datos, donde el alumno tendrá que elaborar reportes de manera individual o grupal. Los ejercicios se utilizarán programas de distribución libre (QGIS, CONEFOR, CIRCUITSCAPE) y paqueterías de R.
- Cada alumno deberá contar con su propia computadora portátil con los programas a usarse en el curso (los profesores enviarán las direcciones electrónicas para bajar dichos recursos).
- Conocimientos básicos de estadística.
- Excelente compresión de textos en inglés.
- Manejo de bases de datos (ej. excel).
- Nociones básicas de R.
- Asistencia y participación (10%)
- Entrega de ejercicios desarrollados en clase (60%). De 4 a 6 ejercicios.
- Presentación oral frente a grupo de un proyecto final (30%). El proyecto consiste en plantear una pregunta de investigación de su interés, desarrollando el diseño muestral y los análisis espaciales necesarios para responder a dicha pregunta propuesta (preferentemente sobre la tesis del estudiante y que ponga en práctica lo aprendido en clase).
Semana 1:
a) Sección teórica:
- Marco conceptual de la ecología del paisaje (escala, composición, configuración)
- Fragmentación y pérdida de hábitat: Conceptos y casos de estudio
- Métricas de paisaje y análisis multiescalar
- Conectividad estructural y funcional
- Redes de conectividad e índices de conectividad
- Corredores biológicos
b) Sección práctica
- Métricas del paisaje
- Extracción de métricas a múltiples escalas
- Determinación de la escala del efecto
- Selección de modelos
- Elaboración de matrices de resistencia
- Elaboracion de corredores
- Redes de conectividad
Semana 2
a) Sección teórica
- Marco conceptual en la genética del paisaje
- Marcadores moleculares y medidas de diversidad genética
- Consideraciones de diseño muestral en genética del paisaje
- Análisis espaciales y no espaciales de estructura genética
- Simulaciones computacionales en genética del paisaje
- Análisis de la estructura espacial fina: Autocorrelación espacial
- Análisis espaciales para evaluar la resistencia del paisaje y ambiente sobre el flujo genético
b) Sección práctica
- Estimadores de diversidad genética
- Medidas de conectividad y su relación con diversidad genética
- Análisis espaciales y no espaciales de la estructura genética
- Autocorrelacion espacial
- ResistanceGA y otros análisis estadísticos para relacionar métricas de flujo genético con variables espaciales.