- Inicia: 11/05/2026 Finaliza: 22/05/2026
- Modalidad: Presencial
- Horario de clases: Lunes a viernes de 10:00 a 18:00, una hora para comer.
- Estudiantes mínimo: 4 máximo: 20
- Costo: $2,625
- Creditos: 7
- Horas: 70
- Nota:
- Coordinadores:
Dr. Carlos Daniel Pinacho Pinacho
M. en C. Ismael Guzmán Valdivieso - Profesores invitados:
M. en C. Didier Casanova Hernández
Dr. Miguel Calixto Rojas
Los avances con las propuestas de Taxonomía integrativa en combinación con los diferentes enfoques de delimitación de especies con datos moleculares, permiten estimados más robustos de cuánta diversidad de especies existe en el planeta. La Taxonomía integrativa se ha propuesto como un marco de referencia que integre conceptos y metodologías para estudiar los orígenes, límites y evolución de las especies. Este curso está diseñado para conocer y explorar la terminología básica de Taxonomía integrativa, usando diferentes enfoques de delimitación de especies con datos moleculares, morfológicos y ecológicos en organismos no modelo.
El objetivo del curso es el de dotar al estudiante de las herramientas básicas de la Taxonomía integrativa para manejar e implementar información de datos moleculares, morfológicos y ecológicos en el estudio de organismos no modelo.
1) Entender la terminología de Taxonomía integrativa y sus aplicaciones. 2) Entender los diferentes algoritmos para estimar un árbol filogenético. 3) Aplicar diferentes herramientas para la delimitación de especies con datos moleculares. 4) Reconocer diferentes herramientas para estudios morfológicos y ecológicos en la delimitación de especies.
Es un curso teórico-práctico. En cada sesión teórica se discutirán los fundamentos con base en lecturas de artículos científicos. Después, en cada sesión práctica, se implementarán diferentes algoritmos y se discutirán los resultados para su interpretación.
Contar con un equipo de cómputo con conexión a red inalámbrica. De preferencia CPU con más de 12 núcleos. Tener nociones básicas de sistemática filogenética.
Capacidad de pensamiento crítico, trabajo por cuenta propia y destrezas básicas para el trabajo por computadora.
Asistencia y participación 20%; control de lecturas 20%; ejercicios prácticos 20%; trabajo final 40%.
1) introducción a la Taxonomía integrativa. 2) características generales de los datos moleculares: ADN; ARN; alineamiento de secuencias; genes codificantes y no codificantes; nucleótidos; codones, aminoácidos; tipos de sustituciones; homología de datos moleculares; genómica, transcriptomica, mitogenoma. 3) métodos de reconstrucción filogenética: parsimonia; modelos de sustitución; máxima verosimilitud; apoyo de ramas; inferencia bayesiana. 4) delimitación de especies con datos moleculares: taxonomía numérica; taxonomía molecular; DNA barcoding; Multispecies coalescent (MSC); Machine learning; ABGD (Automated Barcode Gap Discovery); GMYC (General Mixed Yule Coalescent); PTP (Poisson Tree Process); Bayesian Phylogenetics and Phylogeography (BPP); Bayes factor; Phylogeographic Inference Using Approximate Likelihoods (PHRAPL); delimitación de especies con datos genómicos; delimitación de especies con introgresión (Msci). 5) datos morfológicos: obtención de datos morfométricos; análisis de varianza; análisis de componentes principales (PCA); análisis discriminante (DFA); identificación taxonómica automatizada. 6) datos ecológicos: GBIF; modelos de nicho ecológico; conservadurismo/divergencia de nicho; análisis de K-medias. 7) unificando la Taxonomía integrativa; la Taxonomía es integrativa, no minimalista.