- Inicia: 13/06/2022 Finaliza: 24/06/2022
- Horario de clases: Lunes a viernes 10:00 a 14:00 y 15:00 a 18:00 hrs
- Estudiantes mínimo: 4 máximo: 40
- Costo: $3,000
- Creditos: 8
- Horas: 80
- Nota: Será presencial en la medida de lo posible. Sede Pátzcuaro
- Coordinadores:
Dra. Yessica Rico Mancebo del Castillo - Profesores invitados:
C. a Dr. Sergio Nicasio Arzeta
Dra Maria Camila Latorre Cardenas
La ecología y la genética del paisaje son disciplinas que hacen un uso imprescindible de análisis espaciales para caracterizar y evaluar cómo la estructura del paisaje y procesos como la fragmentación del hábitat regulan la dinámica poblacional, la dispersión, la diversidad genética y el flujo genético de los organismos en hábitats antropizados. La información que proporcionan dichas herramientas es fundamental para la toma de decisiones durante la planeación de estrategias de conservación y manejo a escalas local y del paisaje. Por lo tanto, resulta imprescindible conocer el marco teórico, empleo, alcances y limitaciones de estas herramientas para quienes investigan temas sobre ecología y genética del paisaje y/o están involucrados en la conservación y manejo de ecosistemas antropizados.
Proporcionar al alumno con los fundamentos y herramientas de análisis espacial en ecología y genética del paisaje en un contexto de biología de la conservación.
- Conocer el marco conceptual y fundamentos teóricos en ecología del paisaje.
- Conocer los conceptos y fundamentos teóricos en genética del paisaje.
- Conocer los elementos fundamentales de diseño muestral en ecología y genética del paisaje.
- Aprender los fundamentos, limitaciones, y usos de distintas herramientas de análisis espacial en ecología y genética del paisaje.
- Conocer las principales aplicaciones prácticas de la ecología y genética del paisaje a través de estudios de caso.
El curso será teórico (2-3hrs) y práctico (4-5 hrs). De cada una de las unidades temáticas abordadas se proveerá con una sesión explicativa sobre sus fundamentos y conceptos. Esta información proveerá las bases teóricas para realizar el componente práctico de cada sesión. Asimismo, cada unidad temática estará acompañada de literatura científica cómo revisiones conceptuales, metodológicas, así como estudios de caso. El componente práctico se enfocará a utilizar software especializado para el análisis de datos, donde el alumno al final tendrá que elaborar un reporte a manera individual o grupal de los análisis y de la discusión de los mismos. Los ejercicios se utilizarán programas de distribución libre (QGIS, CONEFOR, CIRCUITSCAPE) y paqueterías de R.
- Cada alumno deberá contar con su propia computadora portátil con los programas a usarse en el curso (los profesores enviarán las direcciones electrónicas para bajar dichos recursos).
- Conocimientos básicos de estadística.
- Excelente compresión de textos en inglés.
- Manejo de bases de datos (ej. excel).
- Nociones básicas de R.
- Asistencia y participación (10%)
- Entrega de ejercicios desarrollados en clase (60%). Alrededor de 4 a 6 ejercicios.
- Presentación frente a grupo de un proyecto (30%). El proyecto consiste en plantear una pregunta de investigación, así como el diseño muestral y los análisis necesarios para responder a la pregunta propuesta (preferentemente sobre la tesis del estudiante y que ponga en práctica lo aprendido en clase).
Semana 1:
a) Sección teórica:
- Marco conceptual de la ecología del paisaje (escala, composición, configuración)
- Fragmentación: Conceptos y casos de estudio
- Métricas de paisaje
- Paisaje focal: análisis multiescalar
- Conectividad estructural y funcional
- Redes de conectividad e índices de conectividad
b) Sección prática
- Métricas del paisaje
- Extracción de métricas a múltiples escalas
- Determinación de la escala del efecto
- Selección de modelos
- Elaboración de matrices de resistencia
- Elaboracion de corredores
- Redes de conectividad
Semana 2
a) Sección teórica
- Marco conceptual en la genética del paisaje
- Marcadores moleculares y medidas de diversidad genética
- Consideraciones de diseño muestral en genética del paisaje
- Análisis espaciales y no espaciales de estructura genética
- Simulaciones computacionales en genética del paisaje
- Análisis de la estructura espacial fina: Autocorrelación espacial
- Análisis espaciales para relacionar flujo genético y variables del paisaje y ambiente
b) Sección práctica
- Estimadores de diversidad genética
- Medidas de conectividad y su relación con diversidad genética
- Análisis espaciales y no espaciales de la estructura genética (Structure, TESS, PCA, DAPC, sPCA)
- Autocorrelacion espacial (correlogramas de Mantel)
- Distancias genéticas, diversidad genética y variables geográficas y ambientales (Mantel test, MLPE, dRDA)